14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2294 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2294  hypothetical protein  100 
 
 
411 aa  844    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.147546  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0314  hypothetical protein  21.55 
 
 
425 aa  82.8  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6729  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  23.33 
 
 
830 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577691  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4079  hypothetical protein  21.36 
 
 
876 aa  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00459285  normal  0.104503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8580  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  22.63 
 
 
792 aa  60.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384634  normal  0.281416 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5981  hypothetical protein  21.81 
 
 
747 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5953  hypothetical protein  20.92 
 
 
751 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0906  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  33.33 
 
 
765 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2031  hypothetical protein  32.89 
 
 
205 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6850  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  39.62 
 
 
833 aa  46.6  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0108098  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1689  conjugation protein  23.61 
 
 
1342 aa  45.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0295  hypothetical protein  23.53 
 
 
400 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690441  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0342  hypothetical protein  20.92 
 
 
742 aa  43.1  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.460096 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0632  hypothetical protein  30.71 
 
 
708 aa  43.1  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>