42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6729 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6729  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  100 
 
 		 830 aa  1603    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577691  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2549  hypothetical protein  53.08 
 
 		 832 aa  641    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4079  hypothetical protein  49.94 
 
 		 876 aa  658    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00459285  normal  0.104503 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1694  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  51.49 
 
 		 832 aa  609  1e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000925009  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2745  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  49.94 
 
 		 841 aa  605  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6850  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  47.42 
 
 		 833 aa  603  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0108098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8580  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  46.57 
 
 		 792 aa  588  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384634  normal  0.281416 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0906  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  37.67 
 
 		 765 aa  253  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2068  hypothetical protein  39.63 
 
 		 728 aa  233  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000291289  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7330  type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  33.68 
 
 		 719 aa  213  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000633696  decreased coverage  0.00000000626768 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1436  hypothetical protein  36.75 
 
 		 737 aa  204  7e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188035  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0314  hypothetical protein  30.65 
 
 		 425 aa  180  8e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0295  hypothetical protein  30.96 
 
 		 400 aa  150  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690441  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5953  hypothetical protein  29.62 
 
 		 751 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5981  hypothetical protein  30.37 
 
 		 747 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5107  hypothetical protein  26.83 
 
 		 991 aa  120  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.286492  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4007  hypothetical protein  30.13 
 
 		 976 aa  110  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0069  hypothetical protein  31.85 
 
 		 969 aa  106  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0314244  hitchhiker  0.0000262699 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3174  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1009 aa  102  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2031  hypothetical protein  36.43 
 
 		 205 aa  101  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3629  hypothetical protein  22.54 
 
 		 1276 aa  99.4  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1027  hypothetical protein  26.47 
 
 		 791 aa  94  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0342  hypothetical protein  26.16 
 
 		 742 aa  87  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460096 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0612  hypothetical protein  26.27 
 
 		 906 aa  82.8  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1449  hypothetical protein  27.38 
 
 		 1319 aa  75.5  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.331748  normal  0.0633529 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2294  hypothetical protein  23.04 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.147546  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2122  TraG family protein  24.2 
 
 		 464 aa  68.6  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0250  TraG family protein  22.52 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0195  TraG family protein  22.95 
 
 		 457 aa  60.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0093  conjugation protein, TraG/TraD family  32.03 
 
 		 1166 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0064  conjugation protein, TraG/TraD family  32.03 
 
 		 1166 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2966  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1187 aa  59.3  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0073  TraG/TraD family protein  32.03 
 
 		 1166 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0064  TraG/TraD family conjugal transfer protein  32.03 
 
 		 1109 aa  59.3  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0124  mobilization protein  25.21 
 
 		 635 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.795434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1183  hypothetical protein  23.6 
 
 		 811 aa  51.6  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0037  hypothetical protein  21.93 
 
 		 926 aa  52  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0221  TraG/TraD family conjugal transfer protein  28 
 
 		 1025 aa  51.6  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0029  hypothetical protein  38.18 
 
 		 191 aa  50.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0297  hypothetical protein  27.21 
 
 		 1123 aa  46.2  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0816  hypothetical protein  26.61 
 
 		 452 aa  45.4  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.723695  normal  0.916322 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3242  hypothetical protein  24.56 
 
 		 612 aa  45.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>