225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4980 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  100 
 
 		 570 aa  1170    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  55.2 
 
 		 567 aa  621  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  53.35 
 
 		 574 aa  615  1e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  40.11 
 
 		 600 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  44.21 
 
 		 427 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3692  protein of unknown function DUF87  33.95 
 
 		 382 aa  193  8e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.703061  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  29.88 
 
 		 591 aa  156  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  24.96 
 
 		 709 aa  138  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  26.87 
 
 		 575 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  25.11 
 
 		 595 aa  133  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  27.4 
 
 		 577 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  25.38 
 
 		 599 aa  121  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  26.33 
 
 		 593 aa  120  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  26.61 
 
 		 546 aa  117  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  23 
 
 		 617 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  22.52 
 
 		 579 aa  114  6e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  23.33 
 
 		 591 aa  111  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2366  protein of unknown function DUF87  24.25 
 
 		 592 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.250268  normal  0.14702 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  24.16 
 
 		 670 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  25.6 
 
 		 594 aa  110  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0715  HerA helicase  26.68 
 
 		 409 aa  109  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  24.32 
 
 		 601 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0349  protein of unknown function DUF87  25.31 
 
 		 540 aa  108  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  25.14 
 
 		 550 aa  107  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  24.63 
 
 		 587 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  25.87 
 
 		 492 aa  104  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  25.06 
 
 		 581 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  25 
 
 		 569 aa  100  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  24.78 
 
 		 664 aa  100  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  26.03 
 
 		 500 aa  99.4  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  25.11 
 
 		 693 aa  96.3  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  24.32 
 
 		 526 aa  95.1  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  23.75 
 
 		 709 aa  93.6  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2030  hypothetical protein  22.75 
 
 		 589 aa  93.6  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309935 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  22.3 
 
 		 607 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  23.78 
 
 		 561 aa  92.8  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  26.18 
 
 		 714 aa  90.9  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  24.33 
 
 		 612 aa  89  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  30.98 
 
 		 579 aa  89  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  24.79 
 
 		 590 aa  87.4  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  25.24 
 
 		 626 aa  87  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  25.63 
 
 		 659 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  33.33 
 
 		 623 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  24.2 
 
 		 524 aa  86.3  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  29.95 
 
 		 679 aa  84  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  24.63 
 
 		 524 aa  80.5  0.00000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2954  hypothetical protein  31.62 
 
 		 589 aa  80.1  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000103337 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  38 
 
 		 544 aa  80.1  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_268  hypothetical protein  30 
 
 		 530 aa  79.7  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  32.26 
 
 		 674 aa  79.7  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0326  hypothetical protein  30 
 
 		 530 aa  79.3  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  35.51 
 
 		 569 aa  79.3  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3279  hypothetical protein  30.88 
 
 		 590 aa  78.6  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  29.34 
 
 		 496 aa  77.8  0.0000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  35.11 
 
 		 583 aa  77  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  23.01 
 
 		 674 aa  77  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  31.34 
 
 		 603 aa  77  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0306  hypothetical protein  29.44 
 
 		 530 aa  76.6  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  35.11 
 
 		 617 aa  75.5  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  34.35 
 
 		 628 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  34.35 
 
 		 583 aa  75.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  35.11 
 
 		 584 aa  75.1  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1486  hypothetical protein  24.4 
 
 		 560 aa  72.8  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  35.11 
 
 		 583 aa  72.8  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  23.33 
 
 		 662 aa  72.8  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  31.34 
 
 		 497 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  31.34 
 
 		 497 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  27.71 
 
 		 493 aa  71.2  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  37.7 
 
 		 557 aa  71.2  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  32.82 
 
 		 582 aa  70.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  30.88 
 
 		 497 aa  70.9  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  35.43 
 
 		 510 aa  70.1  0.00000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  33.9 
 
 		 628 aa  69.3  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  38.32 
 
 		 531 aa  68.9  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  22.22 
 
 		 557 aa  68.9  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4844  hypothetical protein  21.99 
 
 		 579 aa  68.2  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0645  ATPase-like protein  25.67 
 
 		 989 aa  68.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  32.2 
 
 		 605 aa  68.2  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0494  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  22.49 
 
 		 505 aa  67.8  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  26.99 
 
 		 563 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0321  hypothetical protein  24.71 
 
 		 499 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  30.97 
 
 		 520 aa  66.6  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  31.36 
 
 		 608 aa  66.6  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2549  hypothetical protein  28.02 
 
 		 542 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.170922  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  31.78 
 
 		 524 aa  65.9  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  24.29 
 
 		 570 aa  65.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  31.29 
 
 		 679 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0132  protein of unknown function DUF87  32.17 
 
 		 534 aa  65.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0970919  decreased coverage  0.000025846 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  26.61 
 
 		 546 aa  65.5  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  30.51 
 
 		 611 aa  65.5  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1701  hypothetical protein  31.58 
 
 		 539 aa  63.5  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.016697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  34.03 
 
 		 580 aa  62.8  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  28.81 
 
 		 616 aa  63.2  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0343  hypothetical protein  24.48 
 
 		 499 aa  62.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3183  hypothetical protein  31.58 
 
 		 538 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837382  normal  0.234519 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0453  protein of unknown function DUF87  31.3 
 
 		 568 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0937  hypothetical protein  31.71 
 
 		 540 aa  60.5  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0147133  normal  0.254287 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1906  hypothetical protein  28.7 
 
 		 579 aa  60.5  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000004225  normal  0.0184215 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  31.03 
 
 		 559 aa  60.1  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  33.88 
 
 		 523 aa  59.7  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>