142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2804 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  65.71 
 
 
679 aa  841    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  100 
 
 
693 aa  1400    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  70.9 
 
 
662 aa  827    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  66.62 
 
 
674 aa  863    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1486  hypothetical protein  53.64 
 
 
560 aa  594  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  48.03 
 
 
626 aa  535  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  43.35 
 
 
582 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  43.01 
 
 
628 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  42.83 
 
 
583 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  43.23 
 
 
583 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  43.26 
 
 
584 aa  457  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  45.1 
 
 
583 aa  451  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  44.01 
 
 
617 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  44.05 
 
 
590 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  42.22 
 
 
612 aa  421  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  39.55 
 
 
570 aa  372  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  37.68 
 
 
569 aa  326  1e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  35.73 
 
 
569 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  37.38 
 
 
544 aa  320  5e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  32.64 
 
 
575 aa  226  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  29.23 
 
 
546 aa  206  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  29.52 
 
 
593 aa  205  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  29.8 
 
 
607 aa  200  6e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  28.25 
 
 
591 aa  196  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  29.18 
 
 
550 aa  194  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  27.38 
 
 
599 aa  189  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  26.8 
 
 
623 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  29.28 
 
 
594 aa  182  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  25.82 
 
 
595 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  28.26 
 
 
587 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  28.48 
 
 
526 aa  162  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  27.93 
 
 
579 aa  160  6e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  28.25 
 
 
559 aa  154  4e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  27.74 
 
 
577 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  30.94 
 
 
579 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  27.65 
 
 
591 aa  151  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  40.74 
 
 
679 aa  127  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  37.82 
 
 
709 aa  123  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  27.74 
 
 
520 aa  110  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  32.95 
 
 
664 aa  108  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  29.52 
 
 
674 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  28.83 
 
 
714 aa  105  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  23.49 
 
 
510 aa  103  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  26.81 
 
 
709 aa  99.8  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  26.82 
 
 
557 aa  97.8  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  34.29 
 
 
603 aa  97.4  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  36.36 
 
 
670 aa  96.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  24.67 
 
 
493 aa  95.9  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  25.11 
 
 
570 aa  95.9  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  24.3 
 
 
559 aa  95.5  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  30.2 
 
 
659 aa  95.1  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  23.13 
 
 
564 aa  93.2  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  26.82 
 
 
531 aa  91.7  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  23.88 
 
 
497 aa  91.7  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  22.87 
 
 
497 aa  90.9  7e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  23.62 
 
 
497 aa  90.5  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  25.06 
 
 
492 aa  87  9e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  24.94 
 
 
500 aa  86.7  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  40.54 
 
 
601 aa  86.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  26.51 
 
 
496 aa  85.1  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  25.12 
 
 
616 aa  84.3  0.000000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  24.66 
 
 
508 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  36.94 
 
 
617 aa  82.8  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  24.31 
 
 
427 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  31.52 
 
 
611 aa  82.4  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  24.57 
 
 
574 aa  82  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  37.5 
 
 
563 aa  81.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  31.1 
 
 
581 aa  81.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  34.93 
 
 
560 aa  80.9  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  31.48 
 
 
605 aa  80.5  0.00000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  24.32 
 
 
567 aa  79.7  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  24.81 
 
 
524 aa  79.7  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  30.3 
 
 
608 aa  79  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  29.13 
 
 
600 aa  79  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  25.06 
 
 
524 aa  77.4  0.0000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  32.69 
 
 
557 aa  76.6  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  33.05 
 
 
496 aa  75.9  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  26.18 
 
 
524 aa  74.7  0.000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  24.23 
 
 
523 aa  73.6  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1515  protein of unknown function DUF87  24.75 
 
 
530 aa  72.8  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.649754  normal  0.132485 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  38.39 
 
 
561 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  36.89 
 
 
628 aa  69.3  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  23.75 
 
 
546 aa  67.8  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  28.48 
 
 
523 aa  65.1  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1865  hypothetical protein  29.31 
 
 
655 aa  64.3  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0131162 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0349  protein of unknown function DUF87  19.7 
 
 
540 aa  62.8  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2954  hypothetical protein  25.38 
 
 
589 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000103337 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  34.69 
 
 
360 aa  61.6  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0074  hypothetical protein  31.67 
 
 
495 aa  61.2  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0871233  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1374  protein of unknown function DUF87  24.48 
 
 
538 aa  60.8  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2030  hypothetical protein  32.22 
 
 
589 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309935 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1183  hypothetical protein  24.93 
 
 
811 aa  59.7  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  26.77 
 
 
250 aa  59.3  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0937  hypothetical protein  33.05 
 
 
540 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0147133  normal  0.254287 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0753  protein of unknown function DUF87  33.59 
 
 
506 aa  58.5  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0799035  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0018  protein of unknown function DUF87  27.04 
 
 
537 aa  58.2  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.989354  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3279  hypothetical protein  29.7 
 
 
590 aa  57  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5115  hypothetical protein  27.93 
 
 
595 aa  56.6  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2366  protein of unknown function DUF87  29.75 
 
 
592 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.250268  normal  0.14702 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  25.86 
 
 
580 aa  56.6  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>