16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_3017 on replicon NC_013206
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013206  Aaci_3017  hypothetical protein  100 
 
 
828 aa  1717    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0073  TraG/TraD family protein  22.75 
 
 
1166 aa  105  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0093  conjugation protein, TraG/TraD family  22.75 
 
 
1166 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0064  conjugation protein, TraG/TraD family  22.75 
 
 
1166 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0064  TraG/TraD family conjugal transfer protein  24.45 
 
 
1109 aa  89  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0221  TraG/TraD family conjugal transfer protein  22.9 
 
 
1025 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0215  conjugation protein, TraG/TraD family  22.24 
 
 
792 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0295  hypothetical protein  30.35 
 
 
400 aa  60.1  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690441  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0314  hypothetical protein  38.37 
 
 
425 aa  56.6  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0342  hypothetical protein  31.15 
 
 
742 aa  49.3  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.460096 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4308  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  22.89 
 
 
840 aa  48.1  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0280519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4079  hypothetical protein  31.9 
 
 
876 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00459285  normal  0.104503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8580  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  31.19 
 
 
792 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384634  normal  0.281416 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0361  sex pilus assembly and mating pair formation  29.46 
 
 
589 aa  45.4  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.398823  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0906  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  23.02 
 
 
765 aa  45.4  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2745  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  29.75 
 
 
841 aa  45.1  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325821  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>