45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2818 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_2818  TATA-box binding family protein  100 
 
 		 123 aa  256  7e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3287  transcription factor  49.5 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1078  transcription factor  39.18 
 
 		 199 aa  70.1  0.000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1206  transcription factor  40.82 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.693601  hitchhiker  0.00093313 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0807  transcription factor  39.18 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.364807  hitchhiker  0.00198948 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1352  transcription factor  33.33 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.496063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0806  transcription factor  40.51 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3413  transcription factor  31.68 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3600  integrase family protein  53.97 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1523  transcription factor  32.67 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.302764  normal  0.0166402 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1519  TATA-box binding family protein  32.04 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00147991 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0447  transcription factor  34.34 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3629  hypothetical protein  100 
 
 		 1276 aa  53.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1927  TATA-box binding family protein  30.14 
 
 		 181 aa  52  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.688895  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0612  transcription factor  34.29 
 
 		 174 aa  52  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.298266  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0971  TATA-box binding family protein  27.59 
 
 		 181 aa  51.6  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0152  transcription factor  30.43 
 
 		 183 aa  50.8  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.939058  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0864  transcription factor  29.89 
 
 		 183 aa  50.8  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1270  transcription factor  29.13 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0598  2-alkenal reductase  33.33 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0696  transcription factor  29.13 
 
 		 181 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04976  TATA-box-binding protein (TATA-box factor)(TATA-binding factor)(TATA sequence-binding protein)(TBP)(Transcription initiation factor TFIID TBP subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12731]  27.84 
 
 		 284 aa  48.9  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.419076  normal  0.827915 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1062  transcription factor  30.43 
 
 		 184 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38880  TATA-binding protein  27.84 
 
 		 247 aa  49.3  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.130977  normal  0.751023 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1260  transcription factor  28.16 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0729165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1728  transcription factor  25 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.419666  normal  0.701049 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1250  transcription factor  28.71 
 
 		 186 aa  48.9  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1917  TATA-box binding family protein  32.5 
 
 		 291 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0595  transcription factor  27.54 
 
 		 183 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0293  TATA-box binding  27.27 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000761553  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0721  TATA-box binding family protein  27.72 
 
 		 186 aa  47.4  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0568  transcription factor  29.73 
 
 		 186 aa  47.8  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.279117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1496  transcription factor  28.79 
 
 		 206 aa  47.8  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000221739  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1416  transcription factor  28.16 
 
 		 181 aa  47  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.223382  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2629  transcription factor  31.88 
 
 		 185 aa  47.4  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1388  transcription factor  29.91 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1320  transcription factor  30 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01090  general RNA polymerase II transcription factor, putative  25.77 
 
 		 232 aa  45.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0916  transcription factor  28.75 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000134892  hitchhiker  0.00000000296214 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0133  TATA-box binding family protein  26.14 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1863  TATA-box binding family protein  26.14 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.304276  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26716  predicted protein  29.27 
 
 		 226 aa  45.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258569  normal  0.155129 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0186  transcription factor  26.21 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.537167  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2006  transcription factor  27.94 
 
 		 184 aa  40.4  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.720701  normal  0.180889 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0323  transcription factor  25.71 
 
 		 184 aa  40.4  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.940017  normal  0.981502 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>