161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2580 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
629 aa  1254    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.294872 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0141  peptidoglycan binding domain-containing protein  59.96 
 
 
624 aa  599  1e-170  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.764176 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0215  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.6 
 
 
670 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3150  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.93 
 
 
654 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2979  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.49 
 
 
648 aa  386  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.32051  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2752  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.92 
 
 
646 aa  389  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2068  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.86 
 
 
672 aa  378  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494147  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2875  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.3 
 
 
662 aa  379  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.929395  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2805  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.33 
 
 
674 aa  378  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.75853  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0991  hypothetical protein  42.47 
 
 
811 aa  350  4e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.95434 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1223  peptidoglycan binding domain-containing protein  41 
 
 
775 aa  344  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.213789  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1428  hypothetical protein  39.13 
 
 
718 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1407  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.45 
 
 
716 aa  326  7e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281728  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4668  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.79 
 
 
724 aa  323  7e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.257633  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3977  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.84 
 
 
730 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6864  hypothetical protein  39.5 
 
 
702 aa  313  5.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.337654  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2095  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.4 
 
 
566 aa  259  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.683622 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2894  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.06 
 
 
560 aa  251  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0428751  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.54 
 
 
559 aa  249  7e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1895  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.79 
 
 
565 aa  249  2e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0937127  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2774  hypothetical protein  35.37 
 
 
546 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.299675  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1416  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.37 
 
 
546 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2893  hypothetical protein  32.86 
 
 
563 aa  239  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.724025  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2171  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.64 
 
 
540 aa  239  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1240  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.33 
 
 
535 aa  238  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.770213 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06430  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.77 
 
 
547 aa  236  8e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1035  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.05 
 
 
544 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1619  hypothetical protein  34.89 
 
 
536 aa  234  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.193231 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1418  hypothetical protein  31.1 
 
 
558 aa  233  6e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0511098  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2470  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.13 
 
 
549 aa  229  8e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1575  hypothetical protein  33.01 
 
 
631 aa  227  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00305451  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2235  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.14 
 
 
637 aa  225  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.328672 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1936  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  36.2 
 
 
599 aa  224  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1556  hypothetical protein  32.86 
 
 
661 aa  223  8e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1003  hypothetical protein  33.27 
 
 
554 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1075  hypothetical protein  32.09 
 
 
598 aa  220  5e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.023264  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1417  hypothetical protein  30.02 
 
 
568 aa  218  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.118077  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_004310  BR0962  hypothetical protein  31.4 
 
 
572 aa  216  9e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.918601  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.66 
 
 
556 aa  216  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1790  hypothetical protein  31.4 
 
 
563 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2015  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.64 
 
 
636 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0952  cell wall degradation protein  31.82 
 
 
656 aa  215  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2224  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.49 
 
 
668 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1218  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.65 
 
 
540 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135115  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3815  hypothetical protein  35.13 
 
 
540 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3942  hypothetical protein  33.47 
 
 
557 aa  213  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2069  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.33 
 
 
560 aa  211  3e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.118953  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2145  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.54 
 
 
531 aa  211  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.535243  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2078  hypothetical protein  30.18 
 
 
614 aa  211  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142171  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1789  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.98 
 
 
571 aa  209  9e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.385253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3376  hypothetical protein  31.78 
 
 
537 aa  209  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.925793  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41210  petidoglycan binding protein  31.07 
 
 
530 aa  207  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.052034  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1781  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.44 
 
 
500 aa  207  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0274269 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0206  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.62 
 
 
625 aa  207  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2392  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.83 
 
 
560 aa  206  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.937016 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2142  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.54 
 
 
563 aa  205  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.79447  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4967  hypothetical protein  40.2 
 
 
523 aa  205  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0313  hypothetical protein  30.56 
 
 
546 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000890514 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0941  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.31 
 
 
549 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2320  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.29 
 
 
560 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0008  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.19 
 
 
516 aa  201  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000297379 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1899  hypothetical protein  28.32 
 
 
571 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1632  hypothetical protein  31.4 
 
 
564 aa  197  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2592  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.38 
 
 
543 aa  196  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000115115  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1899  hypothetical protein  29.41 
 
 
561 aa  196  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.131383  hitchhiker  0.000892254 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1800  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.71 
 
 
549 aa  194  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.081998  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1444  hypothetical protein  30.25 
 
 
607 aa  194  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.354174  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0041  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.22 
 
 
506 aa  191  4e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0945132  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2903  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.82 
 
 
399 aa  190  8e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000818135 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3586  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.88 
 
 
525 aa  189  9e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1674  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.18 
 
 
560 aa  189  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68179  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2331  hypothetical protein  28.9 
 
 
519 aa  187  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1973  hypothetical protein  28.31 
 
 
596 aa  187  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.221768  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2563  hypothetical protein  28.79 
 
 
618 aa  187  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593956  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2654  hypothetical protein  28.79 
 
 
618 aa  187  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.334629  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3935  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.66 
 
 
534 aa  187  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444109  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1660  hypothetical protein  31 
 
 
563 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1861  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.53 
 
 
539 aa  183  7e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0148  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.2 
 
 
533 aa  183  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.246711  normal  0.747742 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1767  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.58 
 
 
526 aa  182  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1133  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 
419 aa  181  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2377  hypothetical protein  33.45 
 
 
483 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.316864  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01179  putative periplasmic protein  34.69 
 
 
410 aa  179  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.383601  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0166  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.27 
 
 
533 aa  179  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1060  hypothetical protein  36.21 
 
 
616 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2478  hitchhiker  0.00110354 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2393  hypothetical protein  28.81 
 
 
615 aa  177  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.840289  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1028  hypothetical protein  36.21 
 
 
615 aa  177  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0304813 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1001  hypothetical protein  36.21 
 
 
615 aa  177  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.040014  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1093  hypothetical protein  29.71 
 
 
606 aa  177  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.565365  normal  0.428912 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1110  hypothetical protein  36.21 
 
 
615 aa  176  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.360324  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00929  predicted carboxypeptidase  36.21 
 
 
615 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.627631  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2718  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.21 
 
 
615 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00936  hypothetical protein  36.21 
 
 
615 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.653767  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2531  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.23 
 
 
433 aa  176  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1032  hypothetical protein  36.21 
 
 
615 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1024  hypothetical protein  28.97 
 
 
615 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600131  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1086  hypothetical protein  36.21 
 
 
611 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0169645  normal  0.732672 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2671  hypothetical protein  36.21 
 
 
615 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.370742  normal  0.102738 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2195  hypothetical protein  36.21 
 
 
615 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.555237  normal  0.324858 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1328  hypothetical protein  29.18 
 
 
539 aa  175  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>