184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2467 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2467  TRAG family protein  100 
 
 		 511 aa  1044    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.606871  hitchhiker  0.00000000721319 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1405  TRAG family protein  55.51 
 
 		 827 aa  531  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0976  TRAG family protein  51.88 
 
 		 912 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1362  TRAG family protein  42.27 
 
 		 663 aa  351  1e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0843  TRAG family protein  39.56 
 
 		 682 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0365  TRAG protein  31.01 
 
 		 661 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0821  TRAG family protein  30.05 
 
 		 673 aa  171  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.153462  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0815  TRAG family protein  28.51 
 
 		 648 aa  169  8e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805111  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2519  TRAG family protein  29.46 
 
 		 625 aa  158  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166499  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1805  TRAG family protein  29.73 
 
 		 598 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1502  TRAG family protein  26.36 
 
 		 610 aa  131  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.343787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0918  TRAG family protein  27.1 
 
 		 677 aa  124  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0788  TRAG family protein  28.98 
 
 		 590 aa  120  7.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28380  type IV secretory pathway, VirD4 component  27.97 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.125371 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18910  type IV secretory pathway, VirD4 component  28.26 
 
 		 627 aa  110  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.755696  normal  0.106526 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3153  TRAG family protein  27.79 
 
 		 762 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1514  TRAG family protein  25.06 
 
 		 606 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4169  TRAG protein  23.08 
 
 		 678 aa  95.9  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0018  type IV secretion system component VirD4  24.31 
 
 		 723 aa  92.8  1e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.512537  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2530  TRAG family protein  23.65 
 
 		 661 aa  92.8  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.684984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0040  type IV secretion system component VirD4  24.07 
 
 		 714 aa  92  2e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0008  type IV secretion system component VirD4  25.3 
 
 		 648 aa  91.7  3e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.325178  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5000  TRAG family protein  26.46 
 
 		 670 aa  91.7  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0044  hypothetical protein  26.65 
 
 		 608 aa  91.3  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.612223  normal  0.249044 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2738  TRAG family protein  24.71 
 
 		 606 aa  90.5  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2451  TRAG family protein  24.56 
 
 		 559 aa  90.1  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.885622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4554  TRAG family protein  22.39 
 
 		 695 aa  88.2  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3794  TRAG protein  23.9 
 
 		 668 aa  87.4  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3988  TRAG family protein  24.03 
 
 		 670 aa  86.7  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.420427  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4368  TRAG family protein  22.65 
 
 		 713 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.538935 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3655  TRAG family protein  23.95 
 
 		 667 aa  86.3  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.291322  decreased coverage  0.00000244512 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6396  TRAG family protein  22.37 
 
 		 699 aa  85.5  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9810  conjugative coupling protein  22.29 
 
 		 699 aa  83.6  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1493  conjugal transfer coupling protein TraG  25.72 
 
 		 700 aa  83.6  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00200644  normal  0.246461 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3625  TRAG family protein  25.54 
 
 		 742 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2002  conjugal transfer coupling protein TraG  24.72 
 
 		 665 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0417239  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3708  conjugal transfer coupling protein TraG  23.77 
 
 		 669 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0739  type IV secretion system component VirD4  23.04 
 
 		 641 aa  80.1  0.00000000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1548  conjugal transfer coupling protein TraG  24.02 
 
 		 664 aa  77.8  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11101  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0968  conjugal transfer coupling protein TraG  24.22 
 
 		 666 aa  77.4  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0023  transfer complex protein TrsK-like  26.42 
 
 		 588 aa  77  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4193  conjugal transfer coupling protein TraG  23.56 
 
 		 663 aa  75.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30960  conjugal transfer coupling protein TraG  23.96 
 
 		 666 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.70004e-21 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2701  conjugal transfer coupling protein TraG  24.18 
 
 		 669 aa  75.1  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5517  conjugal transfer coupling protein TraG  22.25 
 
 		 665 aa  74.3  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0112559 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1893  conjugal transfer coupling protein TraG  24.51 
 
 		 670 aa  74.7  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2348  conjugal transfer coupling protein TraG  23.51 
 
 		 669 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1026  hypothetical protein  23.91 
 
 		 657 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.272564 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0440  conjugal transfer coupling protein TraG  24.46 
 
 		 673 aa  74.3  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2913  conjugal transfer coupling protein TraG  23.8 
 
 		 665 aa  73.9  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6215  TRAG family protein  25.28 
 
 		 902 aa  73.9  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.371474 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2818  conjugal transfer coupling protein TraG  26.02 
 
 		 660 aa  73.6  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.443273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1023  conjugal transfer coupling protein TraG  25.28 
 
 		 660 aa  73.2  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0724  conjugal transfer coupling protein TraG  24.18 
 
 		 668 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3508  conjugal transfer coupling protein TraG  23.96 
 
 		 667 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2618  conjugal transfer coupling protein TraG  24.89 
 
 		 687 aa  72  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8210  type IV secretion system protein VirD4  22.76 
 
 		 663 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3193  conjugal transfer coupling protein TraG  23.66 
 
 		 661 aa  72.4  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0684551  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0862  TRAG family protein  21.44 
 
 		 677 aa  71.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2643  conjugal transfer coupling protein TraG  23.36 
 
 		 672 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3084  conjugal transfer coupling protein TraG  25.17 
 
 		 661 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.847978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35740  conjugal transfer coupling protein TraG  23.52 
 
 		 666 aa  71.2  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1833  conjugal transfer coupling protein TraG  24.16 
 
 		 687 aa  71.2  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1339  conjugal transfer coupling protein TraG  23.96 
 
 		 664 aa  70.9  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.953058  normal  0.786812 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1649  TRAG family protein  23.25 
 
 		 823 aa  70.9  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2586  conjugal transfer coupling protein TraG  23.52 
 
 		 675 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3903  conjugal transfer coupling protein TraG  23.67 
 
 		 665 aa  70.5  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0701  conjugal transfer coupling protein TraG  25.06 
 
 		 661 aa  70.5  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3006  conjugal transfer coupling protein TraG  24.15 
 
 		 663 aa  70.5  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6143  type IV secretion system protein VirD4  22.78 
 
 		 548 aa  70.5  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0142  conjugal transfer coupling protein TraG  23.63 
 
 		 674 aa  69.3  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3157  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  29.05 
 
 		 332 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.104836  normal  0.929615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7739  conjugal transfer coupling protein TraG  25.38 
 
 		 661 aa  70.1  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.477093 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1196  conjugal transfer coupling protein TraG  25.39 
 
 		 663 aa  69.7  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0400673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3539  conjugal transfer coupling protein TraG  25.39 
 
 		 663 aa  69.7  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4672  conjugal transfer coupling protein TraG  21.45 
 
 		 641 aa  68.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.811781  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3188  conjugal transfer coupling protein TraG  24.51 
 
 		 669 aa  68.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4436  TRAG protein  23.06 
 
 		 714 aa  68.6  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1506  conjugal transfer coupling protein TraG  24.1 
 
 		 661 aa  67.8  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3886  transfer complex protein TrsK-like protein  24.93 
 
 		 569 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0515  conjugal transfer coupling protein TraG  23.78 
 
 		 662 aa  67.8  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.246818  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1733  conjugal transfer coupling protein TraG  24.55 
 
 		 660 aa  67.4  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2469  transfer complex protein TrsK-like protein  24.93 
 
 		 569 aa  67.4  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805174 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0894  TRAG family protein  23.37 
 
 		 627 aa  67  0.0000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2876  conjugal transfer coupling protein TraG  24.83 
 
 		 662 aa  67  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3689  conjugal transfer coupling protein TraG  24.22 
 
 		 676 aa  66.6  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5456  transfer complex protein TrsK-like protein  22.88 
 
 		 638 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5695  transfer complex protein TrsK-like protein  22.88 
 
 		 638 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.604846 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1280  conjugal transfer coupling protein TraG  22.67 
 
 		 665 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0680  agrobacteirum virulence protein VirD4  22.49 
 
 		 554 aa  66.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7438  conjugal transfer coupling protein TraG  22.84 
 
 		 660 aa  66.6  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291662  normal  0.932105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2025  conjugal transfer coupling protein TraG  23.46 
 
 		 678 aa  66.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3825  conjugal transfer coupling protein TraG  25.06 
 
 		 666 aa  66.6  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1185  TRAG family protein  23.97 
 
 		 630 aa  65.5  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3356  conjugal transfer coupling protein TraG  23.95 
 
 		 666 aa  65.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.456046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3849  conjugal transfer coupling protein TraG  24.55 
 
 		 664 aa  65.1  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00986433  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0247  putative type IV secretory pathway protein VirD4  20.97 
 
 		 648 aa  65.1  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.865084 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1699  TraG/TraD family protein  23.75 
 
 		 834 aa  65.1  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9186  conjugal transfer coupling protein TraG  22.29 
 
 		 656 aa  65.1  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.995414  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1398  TRAG family protein  23.75 
 
 		 828 aa  64.7  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.277319  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>