45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0645 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0645  hypothetical protein  100 
 
 
686 aa  1381    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.549524  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0720  hypothetical protein  23.14 
 
 
351 aa  67.8  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  28.36 
 
 
524 aa  65.1  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0397  hypothetical protein  25.57 
 
 
325 aa  61.6  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1502  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.59 
 
 
609 aa  60.8  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0756  hypothetical protein  27.1 
 
 
645 aa  60.8  0.00000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00608077 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  32.46 
 
 
523 aa  58.2  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  34.69 
 
 
523 aa  56.6  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  43.86 
 
 
524 aa  56.2  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0053  hypothetical protein  24.5 
 
 
547 aa  55.5  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.594463 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1467  hypothetical protein  22.97 
 
 
739 aa  55.5  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1815  putative type IV secretory pathway VirB4 protein  34.23 
 
 
747 aa  54.7  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  42.31 
 
 
524 aa  54.3  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  24.08 
 
 
544 aa  53.9  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0931  hypothetical protein  41.18 
 
 
616 aa  51.6  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3978  hypothetical protein  37.72 
 
 
296 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  42.37 
 
 
508 aa  49.7  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3611  hypothetical protein  38.14 
 
 
296 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.715293  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5394  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  35.23 
 
 
579 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.709491  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  52 
 
 
569 aa  50.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4965  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  35.23 
 
 
579 aa  49.7  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  43.75 
 
 
605 aa  48.9  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  43.59 
 
 
628 aa  49.3  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  41.67 
 
 
608 aa  48.1  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2753  hypothetical protein  23.23 
 
 
610 aa  48.1  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  41.67 
 
 
611 aa  47.8  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  36.84 
 
 
496 aa  47.8  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2827  conjugal transfer ATPase TrbE  21.61 
 
 
812 aa  47.4  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.595122  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  43.59 
 
 
616 aa  47.4  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  28 
 
 
564 aa  47.4  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  22.75 
 
 
557 aa  47.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0937  hypothetical protein  42.03 
 
 
540 aa  46.2  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0147133  normal  0.254287 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  30.68 
 
 
496 aa  46.6  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2611  conjugal transfer ATPase TrbE  22.26 
 
 
829 aa  46.2  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  36.05 
 
 
500 aa  45.8  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1783  hypothetical protein  35.09 
 
 
296 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  41.54 
 
 
590 aa  45.8  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  43.75 
 
 
621 aa  45.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  44.9 
 
 
569 aa  44.7  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  38.1 
 
 
709 aa  44.3  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  38.46 
 
 
575 aa  44.3  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1720  ATPase  36 
 
 
504 aa  44.3  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  30.34 
 
 
600 aa  43.9  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35690  conjugal transfer ATPase TrbE  23.37 
 
 
816 aa  43.9  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0715  HerA helicase  43.75 
 
 
409 aa  43.9  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>