43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0246 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0246  hypothetical protein  100 
 
 		 1577 aa  3204    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2180  AAA ATPase  34.17 
 
 		 777 aa  179  5e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.520189  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5417  hypothetical protein  26.88 
 
 		 1698 aa  97.1  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265481  normal  0.989313 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0053  hypothetical protein  27.67 
 
 		 547 aa  90.9  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.594463 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1373  AAA ATPase  25.33 
 
 		 572 aa  87  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.280618  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0025  hypothetical protein  28.57 
 
 		 500 aa  67.8  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2315  hypothetical protein  22.48 
 
 		 1743 aa  66.6  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0466  hypothetical protein  23.46 
 
 		 1692 aa  60.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.189828  normal  0.0732856 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  27.78 
 
 		 560 aa  58.5  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.56 
 
 		 629 aa  54.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  26.09 
 
 		 629 aa  55.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01254  hypothetical protein  47.54 
 
 		 115 aa  52  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06795  hypothetical protein  35.63 
 
 		 516 aa  51.6  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.207511  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1849  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  39.39 
 
 		 511 aa  51.6  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.892343  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2518  hypothetical protein  23.35 
 
 		 1830 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.577468  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1088  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  25.73 
 
 		 1633 aa  50.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0397  hypothetical protein  53.66 
 
 		 325 aa  48.9  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1273  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  42.62 
 
 		 520 aa  48.9  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.50823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0162  hypothetical protein  37.5 
 
 		 591 aa  48.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.222598  normal  0.0745617 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2862  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  45.16 
 
 		 501 aa  48.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  20.32 
 
 		 520 aa  48.5  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22220  predicted ATPase  40 
 
 		 544 aa  47.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.198348 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0858  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  51.02 
 
 		 514 aa  47.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1131  AAA ATPase  22.76 
 
 		 600 aa  47  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  25.19 
 
 		 569 aa  47.4  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0494  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  32.93 
 
 		 505 aa  46.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0635  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  56.76 
 
 		 513 aa  46.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1395  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  28.27 
 
 		 616 aa  46.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0290868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2231  hypothetical protein  45.16 
 
 		 521 aa  46.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0965874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4924  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  52.27 
 
 		 515 aa  46.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.311979 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4415  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  38.81 
 
 		 521 aa  46.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.763813  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4878  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  52.27 
 
 		 521 aa  46.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.493177 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0321  hypothetical protein  39.73 
 
 		 499 aa  46.2  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1614  hypothetical protein  50 
 
 		 519 aa  45.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.821212  normal  0.326677 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0091  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  47.27 
 
 		 488 aa  46.2  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0259973  normal  0.193086 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0096  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  52.27 
 
 		 490 aa  45.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0107  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  52.27 
 
 		 490 aa  45.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1993  hypothetical protein  43.55 
 
 		 508 aa  45.8  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0089  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  52.27 
 
 		 491 aa  45.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1312  hypothetical protein  48 
 
 		 515 aa  45.8  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  20.9 
 
 		 564 aa  45.4  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3313  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  52.27 
 
 		 565 aa  45.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2606  hypothetical protein  30.85 
 
 		 1050 aa  45.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>