178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1674 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  100 
 
 
591 aa  1198    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  51.1 
 
 
679 aa  593  1e-168  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  55.06 
 
 
526 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  41.57 
 
 
709 aa  461  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  40.55 
 
 
623 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  37.62 
 
 
599 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  38.35 
 
 
593 aa  399  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  29.73 
 
 
544 aa  253  9.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  30.7 
 
 
569 aa  243  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  30.63 
 
 
569 aa  233  5e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  30.92 
 
 
595 aa  224  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  28.62 
 
 
583 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  30.41 
 
 
546 aa  220  6e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  28.12 
 
 
628 aa  217  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  28.62 
 
 
582 aa  217  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  26.7 
 
 
583 aa  213  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  26.88 
 
 
575 aa  213  7.999999999999999e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  29 
 
 
550 aa  211  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  27.03 
 
 
583 aa  209  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  26.5 
 
 
584 aa  208  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  27.15 
 
 
617 aa  204  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  27.99 
 
 
662 aa  203  7e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  27.99 
 
 
693 aa  200  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1486  hypothetical protein  28.03 
 
 
560 aa  194  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  25.65 
 
 
612 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  26.99 
 
 
570 aa  191  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  28.63 
 
 
590 aa  190  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  30.11 
 
 
579 aa  189  2e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  26.19 
 
 
674 aa  188  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  27.77 
 
 
607 aa  187  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  26.92 
 
 
577 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  28.1 
 
 
591 aa  182  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  26.91 
 
 
587 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  28.85 
 
 
594 aa  180  5.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  25.36 
 
 
626 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  26.06 
 
 
559 aa  152  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  26.33 
 
 
579 aa  150  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  24.5 
 
 
670 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  27.21 
 
 
605 aa  139  1e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  24.92 
 
 
603 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  32.13 
 
 
709 aa  120  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  35.26 
 
 
679 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  27.15 
 
 
600 aa  120  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  25.59 
 
 
574 aa  119  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  24.24 
 
 
570 aa  118  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  31.19 
 
 
714 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2366  protein of unknown function DUF87  24.31 
 
 
592 aa  107  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.250268  normal  0.14702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  35.43 
 
 
674 aa  106  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  26.86 
 
 
531 aa  105  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  31.63 
 
 
664 aa  104  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  32.99 
 
 
608 aa  102  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  26.8 
 
 
427 aa  102  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  32.49 
 
 
611 aa  101  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  36.77 
 
 
557 aa  99  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  28.81 
 
 
524 aa  97.4  6e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  38.61 
 
 
500 aa  96.7  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  35.06 
 
 
492 aa  95.1  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  30.94 
 
 
496 aa  94  6e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  30 
 
 
659 aa  93.2  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  36.2 
 
 
508 aa  92.4  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  30.61 
 
 
616 aa  92.8  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  30.46 
 
 
617 aa  91.7  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  30 
 
 
601 aa  91.3  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  41.67 
 
 
563 aa  91.3  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  29.04 
 
 
524 aa  90.9  6e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3183  hypothetical protein  25.73 
 
 
538 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837382  normal  0.234519 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  35.19 
 
 
557 aa  87.8  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  30.91 
 
 
497 aa  87.8  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  30.3 
 
 
581 aa  87.4  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  31.52 
 
 
497 aa  87.4  6e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  31.52 
 
 
497 aa  87.4  7e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  27.37 
 
 
560 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  34.81 
 
 
520 aa  86.7  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  35.96 
 
 
493 aa  86.7  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  34.23 
 
 
496 aa  85.1  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  35.14 
 
 
559 aa  84.3  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  29.3 
 
 
564 aa  83.2  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_002936  DET0326  hypothetical protein  25.5 
 
 
530 aa  82.4  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_268  hypothetical protein  25.67 
 
 
530 aa  82.4  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  39.17 
 
 
567 aa  81.3  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  36.67 
 
 
561 aa  80.9  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  34.19 
 
 
510 aa  79.7  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  36 
 
 
523 aa  77.8  0.0000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3279  hypothetical protein  25.41 
 
 
590 aa  77.4  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1515  protein of unknown function DUF87  30.54 
 
 
530 aa  76.3  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.649754  normal  0.132485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0753  protein of unknown function DUF87  27.32 
 
 
506 aa  75.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0799035  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  33.55 
 
 
523 aa  75.9  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  34.23 
 
 
524 aa  75.1  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  37.66 
 
 
628 aa  74.7  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0074  hypothetical protein  23.63 
 
 
495 aa  73.2  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0871233  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2030  hypothetical protein  30.5 
 
 
589 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309935 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0937  hypothetical protein  26.47 
 
 
540 aa  71.2  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0147133  normal  0.254287 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1625  hypothetical protein  28.28 
 
 
783 aa  70.9  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1619  hypothetical protein  29.19 
 
 
532 aa  70.1  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2954  hypothetical protein  22.35 
 
 
589 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000103337 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2149  ATPase  28.47 
 
 
605 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2109  protein of unknown function DUF87  25.68 
 
 
688 aa  67.4  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000368581  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  30.77 
 
 
546 aa  67  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1701  hypothetical protein  31.06 
 
 
539 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.016697  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1140  protein of unknown function DUF87  38.18 
 
 
554 aa  65.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>