137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3949 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04129  predicted ATPase  67.25 
 
 
500 aa  679    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.431713  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3734  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  67.25 
 
 
500 aa  679    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.600698  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3852  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  66.47 
 
 
505 aa  690    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5785  hypothetical protein  67.45 
 
 
500 aa  680    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00669177  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1897  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  64.22 
 
 
503 aa  659    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0908491  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04093  hypothetical protein  67.25 
 
 
500 aa  679    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.437855  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3654  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  67.25 
 
 
500 aa  686    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0860843 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3949  hypothetical protein  100 
 
 
513 aa  1036    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4519  hypothetical protein  67.45 
 
 
500 aa  680    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000859541  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4836  hypothetical protein  67.45 
 
 
500 aa  679    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000653742  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4584  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  82.65 
 
 
508 aa  808    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3706  hypothetical protein  99.42 
 
 
513 aa  1032    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0243  putative NPT hydrolase  99.42 
 
 
513 aa  1031    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0650533  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3749  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  67.25 
 
 
500 aa  679    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0662864  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4744  hypothetical protein  67.45 
 
 
500 aa  679    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0318785  normal  0.98435 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4817  hypothetical protein  67.25 
 
 
500 aa  677    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00312271  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1702  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  65.06 
 
 
502 aa  634  1e-180  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1993  hypothetical protein  61.72 
 
 
508 aa  630  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3520  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  62.86 
 
 
508 aa  628  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.227605  normal  0.161748 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4068  hypothetical protein  61.93 
 
 
541 aa  627  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1336  hypothetical protein  63.1 
 
 
509 aa  627  1e-178  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1987  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  60.57 
 
 
520 aa  618  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.155203  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1727  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  61.9 
 
 
505 aa  620  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.766436 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2387  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  60.75 
 
 
520 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2668  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  63.1 
 
 
504 aa  617  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.881432  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1966  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  63.33 
 
 
505 aa  607  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2189  hypothetical protein  57.98 
 
 
535 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2521  hypothetical protein  63.32 
 
 
511 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0786  hypothetical protein  61.22 
 
 
511 aa  593  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0655509  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3204  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  63.53 
 
 
507 aa  593  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1668  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  61.21 
 
 
498 aa  585  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.510895  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1954  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  61.51 
 
 
525 aa  584  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3727  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  57.2 
 
 
493 aa  573  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0732  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  59.51 
 
 
488 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0114727  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0767  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  59.39 
 
 
482 aa  566  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2074  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  58.7 
 
 
526 aa  556  1e-157  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.504817  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2631  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  55.75 
 
 
522 aa  554  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1768  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  57.44 
 
 
522 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.307535 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2221  hypothetical protein  57.75 
 
 
497 aa  541  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2231  hypothetical protein  55.6 
 
 
521 aa  544  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0965874  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3313  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  54.01 
 
 
565 aa  543  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0091  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  56.85 
 
 
488 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0259973  normal  0.193086 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0236  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  55.4 
 
 
496 aa  536  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0578  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  56.1 
 
 
520 aa  537  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215105  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4878  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  53.82 
 
 
521 aa  533  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.493177 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4415  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  53.6 
 
 
521 aa  533  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.763813  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0088  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  58.88 
 
 
502 aa  534  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1018  ATPase  53.12 
 
 
463 aa  529  1e-149  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4924  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  54.13 
 
 
515 aa  530  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.311979 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0107  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  55.95 
 
 
490 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0915  hypothetical protein  52.93 
 
 
463 aa  528  1e-148  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0823  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  54.07 
 
 
522 aa  523  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0089  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  55.56 
 
 
491 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0096  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  55.75 
 
 
490 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1936  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  52.24 
 
 
536 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0936  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  54.18 
 
 
521 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222531  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2022  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  61.63 
 
 
557 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.27586  normal  0.0150658 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0858  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  55.42 
 
 
514 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3029  hypothetical protein  52.33 
 
 
536 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.998506  normal  0.572623 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2697  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  54.66 
 
 
503 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2047  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  53.47 
 
 
536 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.171196  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3529  hypothetical protein  51.83 
 
 
536 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.370836 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1204  hypothetical protein  51.77 
 
 
527 aa  514  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22220  predicted ATPase  55.82 
 
 
544 aa  506  9.999999999999999e-143  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.198348 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4789  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  64.5 
 
 
514 aa  506  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0444  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  60.15 
 
 
524 aa  503  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0693836  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0563  hypothetical protein  53 
 
 
503 aa  499  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2524  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  52.88 
 
 
478 aa  499  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0564  hypothetical protein  53 
 
 
503 aa  498  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1636  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  56.11 
 
 
526 aa  496  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.985803  normal  0.278037 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1223  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  53.86 
 
 
514 aa  489  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00822087  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3379  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  51.26 
 
 
496 aa  489  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3542  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  60.4 
 
 
543 aa  491  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416289  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2862  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  53.44 
 
 
501 aa  490  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0435  hypothetical protein  51.64 
 
 
504 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3826  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  51.84 
 
 
498 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3566  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  51.71 
 
 
497 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3899  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  51.06 
 
 
504 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4022  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  51.06 
 
 
504 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0535  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  48.89 
 
 
501 aa  480  1e-134  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.162196  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0463  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  51.5 
 
 
497 aa  481  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0459  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  51.3 
 
 
497 aa  481  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1551  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  51.12 
 
 
490 aa  476  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2150  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  56.66 
 
 
520 aa  470  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.56752  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0459  hypothetical protein  51.7 
 
 
493 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1380  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  48.56 
 
 
524 aa  468  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.141103  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1614  hypothetical protein  49.6 
 
 
519 aa  459  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.821212  normal  0.326677 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1312  hypothetical protein  48.5 
 
 
515 aa  451  1e-125  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4430  hypothetical protein  49.61 
 
 
495 aa  450  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55980  hypothetical protein  50.29 
 
 
496 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0734375  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1372  hypothetical protein  51.95 
 
 
491 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4875  hypothetical protein  50.19 
 
 
496 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1012  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  51.65 
 
 
491 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000194694 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4351  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  51.75 
 
 
491 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.012441 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4442  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  51.44 
 
 
491 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.905304  hitchhiker  0.0000193157 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3308  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  50.8 
 
 
494 aa  430  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3713  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  50.83 
 
 
580 aa  413  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2768  hypothetical protein  45.33 
 
 
508 aa  410  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1273  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  45.56 
 
 
520 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.50823  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0635  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  42.51 
 
 
513 aa  393  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>