173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4178 on replicon NC_008765
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6801  hypothetical protein  48.42 
 
 		 864 aa  837    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  100 
 
 		 874 aa  1818    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1535  hypothetical protein  36.78 
 
 		 860 aa  530  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.324807 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2653  hypothetical protein  37.29 
 
 		 855 aa  524  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.696195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2320  hypothetical protein  37.36 
 
 		 855 aa  521  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  27.98 
 
 		 847 aa  365  2e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  29.04 
 
 		 864 aa  347  5e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  27.68 
 
 		 868 aa  332  2e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0371  F-pilin subunit assembly into extended F pili  28.54 
 
 		 809 aa  302  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  28 
 
 		 815 aa  300  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  27.9 
 
 		 827 aa  279  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_08  conjugative transfer protein TraC  28.31 
 
 		 843 aa  275  3e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0316  sex pilus assembly protein  26.67 
 
 		 815 aa  265  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0253  sex pilus assembly protein  25.67 
 
 		 815 aa  251  4e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4290  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  25.63 
 
 		 866 aa  241  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0029  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  25.96 
 
 		 875 aa  238  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4442  Type-IV secretion system protein TraC  25.95 
 
 		 862 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4438  type-IV secretion system protein TraC  25.84 
 
 		 862 aa  234  6e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.314552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4502  type-IV secretion system protein TraC  26.18 
 
 		 862 aa  234  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4535  type-IV secretion system protein TraC  25.97 
 
 		 862 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.862751 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4378  type-IV secretion system protein TraC  25.97 
 
 		 862 aa  233  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4627  type-IV secretion system protein TraC  25.85 
 
 		 862 aa  233  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.997489 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0028  hypothetical protein  23.71 
 
 		 858 aa  221  3e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0798103  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0020  hypothetical protein  24.14 
 
 		 865 aa  218  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3777  sex pilus assembly protein  24.64 
 
 		 816 aa  209  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.899145  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1089  type-IV secretion system protein TraC  25.35 
 
 		 866 aa  197  9e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0936  putative pillus assembly protein  28.15 
 
 		 690 aa  175  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4218  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  23.44 
 
 		 894 aa  144  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.750787 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6224  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.05 
 
 		 860 aa  110  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.628877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6709  hypothetical protein  27.07 
 
 		 845 aa  105  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.534859  normal  0.161214 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3253  type IV secretory pathway VirB4 components-like  24.49 
 
 		 861 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4357  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  25.15 
 
 		 819 aa  100  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.471619  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3545  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  25.15 
 
 		 811 aa  99  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0653304  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6919  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.2 
 
 		 792 aa  94.4  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4376  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.43 
 
 		 785 aa  92.8  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851787 
 
 
-
 
NC_002950  PG1481  conjugative transposon protein TraG  26.82 
 
 		 841 aa  92.8  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.612602 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2948  Type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TRAC  23.36 
 
 		 841 aa  92.8  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3004  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  27.66 
 
 		 837 aa  89  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2394  hypothetical protein  25.71 
 
 		 962 aa  86.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6206  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  25.36 
 
 		 839 aa  85.9  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.623322  normal  0.0559252 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  23.46 
 
 		 621 aa  85.9  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2186  hypothetical protein  25.49 
 
 		 962 aa  84.7  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1815  putative type IV secretory pathway VirB4 protein  24.83 
 
 		 747 aa  84  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3330  hypothetical protein  24.24 
 
 		 913 aa  83.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.543175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1256  hypothetical protein  24.02 
 
 		 963 aa  83.6  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  28.11 
 
 		 608 aa  83.2  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4179  hypothetical protein  24.51 
 
 		 969 aa  82.8  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0837304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3424  hypothetical protein  24.45 
 
 		 956 aa  82.8  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0683  hypothetical protein  25.17 
 
 		 960 aa  82.4  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.439939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0948  hypothetical protein  25.27 
 
 		 962 aa  82  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711504  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  27.27 
 
 		 629 aa  82  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1184  hypothetical protein  23.48 
 
 		 955 aa  82  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0255  Type IV secretory pathway AvhB4 protein  25.16 
 
 		 788 aa  82  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.849698 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0518  Type IV secretory pathway VirB4 protein  25.54 
 
 		 845 aa  81.6  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832849  normal  0.194578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.67 
 
 		 629 aa  81.6  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0502  hypothetical protein  24.68 
 
 		 978 aa  80.1  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1398  hypothetical protein  23.8 
 
 		 955 aa  80.1  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2948  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  23.79 
 
 		 913 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0435  hypothetical protein  24.51 
 
 		 949 aa  79.3  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.544746  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5007  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.41 
 
 		 805 aa  79  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0207382  normal  0.0996879 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0505  type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TraC  25.63 
 
 		 843 aa  78.6  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2859  AAA ATPase  23.83 
 
 		 960 aa  78.2  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1626  hypothetical protein  24.78 
 
 		 949 aa  77.8  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1442  hypothetical protein  23.46 
 
 		 1002 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.188514 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0931  hypothetical protein  24.73 
 
 		 616 aa  77.4  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36280  lipoprotein  23.45 
 
 		 973 aa  77  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0859  hypothetical protein  23.58 
 
 		 889 aa  77  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0858  type IV secretion system ATPase VirB4  23.4 
 
 		 801 aa  75.9  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0648  hypothetical protein  21.6 
 
 		 908 aa  75.9  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.685695  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3023  hypothetical protein  22.68 
 
 		 917 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2353  hypothetical protein  23.26 
 
 		 963 aa  75.5  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000463521  unclonable  0.00000047318 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9821  type IV secretion protein AvhB4  23.86 
 
 		 819 aa  75.1  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.65 
 
 		 630 aa  75.5  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59940  hypothetical protein  22.89 
 
 		 980 aa  72.8  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163365  hitchhiker  0.00000000104179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.73 
 
 		 631 aa  71.6  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4515  type IV secretory pathway, VirB4 component  22.89 
 
 		 983 aa  71.6  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  24.09 
 
 		 569 aa  71.2  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.85 
 
 		 611 aa  71.2  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0108  TriC protein  24.55 
 
 		 916 aa  70.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  24.82 
 
 		 866 aa  70.9  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0914  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.55 
 
 		 1043 aa  70.1  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.06 
 
 		 659 aa  70.1  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4562  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.98 
 
 		 805 aa  69.7  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733697  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4086  putative plasmid-related protein  23.79 
 
 		 954 aa  68.9  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9656  conjugal transfer protein TrbE  23.85 
 
 		 687 aa  67.8  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0179  membrane bound ATPase, putative  24.66 
 
 		 955 aa  67  0.000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1764  hypothetical protein  22.71 
 
 		 938 aa  67  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2007  conjugal transfer ATPase TrbE  23.31 
 
 		 816 aa  67  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581672  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2353  conjugal transfer ATPase TrbE  23.31 
 
 		 816 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.344124 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.38 
 
 		 595 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6405  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.98 
 
 		 819 aa  66.6  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0682909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4169  putative plasmid-related protein  23.35 
 
 		 954 aa  66.6  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3503  conjugal transfer ATPase TrbE  23.58 
 
 		 823 aa  65.9  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1285  conjugal transfer ATPase TrbE  23.04 
 
 		 816 aa  65.1  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1898  conjugal transfer ATPase TrbE  23.58 
 
 		 817 aa  63.9  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2696  conjugal transfer ATPase TrbE  23.04 
 
 		 823 aa  63.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0851108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35690  conjugal transfer ATPase TrbE  22.49 
 
 		 816 aa  63.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0435  conjugal transfer ATPase TrbE  23.31 
 
 		 817 aa  63.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4485  hypothetical protein  31.87 
 
 		 897 aa  63.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30910  conjugal transfer ATPase TrbE  23.31 
 
 		 817 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000414209  unclonable  1.71741e-21 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>