59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5149 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1484  hypothetical protein  45.06 
 
 
1144 aa  852    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0469742  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5149  AAA ATPase  100 
 
 
1031 aa  2069    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120671  normal  0.52051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1183  AAA ATPase  84.21 
 
 
1043 aa  1743    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3967  AAA ATPase  38.15 
 
 
1046 aa  600  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1184  ATPase  36.8 
 
 
1071 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2709  ATPase-like  33.82 
 
 
1106 aa  568  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  35.53 
 
 
1076 aa  525  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2631  hypothetical protein  46.08 
 
 
886 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.703653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5089  AAA ATPase  57.5 
 
 
1100 aa  445  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0231758  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3423  AAA ATPase  55.61 
 
 
1104 aa  437  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.598451  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2632  ATPase  63.87 
 
 
319 aa  389  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.57356 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2606  hypothetical protein  22.58 
 
 
1050 aa  116  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320925  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2242  hypothetical protein  27.29 
 
 
658 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3193  hypothetical protein  26.61 
 
 
653 aa  107  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1696  hypothetical protein  26.42 
 
 
764 aa  101  6e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000294033  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0983  hypothetical protein  24.89 
 
 
762 aa  99.4  3e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.137038  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3326  hypothetical protein  26.41 
 
 
800 aa  96.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000795061  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  26.84 
 
 
496 aa  91.7  7e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1505  hypothetical protein  23.45 
 
 
753 aa  90.9  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4031  hypothetical protein  26.84 
 
 
802 aa  87  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1346  hypothetical protein  27.5 
 
 
859 aa  86.3  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1311  hypothetical protein  26.86 
 
 
847 aa  85.1  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  24.55 
 
 
557 aa  84  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1236  hypothetical protein  26.93 
 
 
859 aa  80.9  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1085  hypothetical protein  25.69 
 
 
847 aa  77  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  26.69 
 
 
523 aa  75.5  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0239  hypothetical protein  22.07 
 
 
734 aa  70.9  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.72436  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  26.36 
 
 
523 aa  70.9  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  25.65 
 
 
531 aa  70.9  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  23.99 
 
 
508 aa  69.3  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  25.57 
 
 
608 aa  68.9  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  24.21 
 
 
611 aa  67.4  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  25.92 
 
 
628 aa  64.7  0.000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  26.33 
 
 
524 aa  64.3  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  22.93 
 
 
524 aa  64.3  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  26.48 
 
 
524 aa  63.5  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1251  hypothetical protein  23.2 
 
 
657 aa  58.5  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  23.71 
 
 
605 aa  58.2  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  24.59 
 
 
616 aa  56.2  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3642  ATPase-like  27.92 
 
 
558 aa  55.1  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.361749  normal  0.410506 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  21.54 
 
 
564 aa  52.8  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0321  hypothetical protein  23.73 
 
 
499 aa  51.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0343  hypothetical protein  23.62 
 
 
499 aa  50.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  21.83 
 
 
559 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  26.21 
 
 
709 aa  48.1  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5363  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  23.94 
 
 
812 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.395815  normal  0.0592495 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  21.53 
 
 
546 aa  47.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0816  hypothetical protein  31.63 
 
 
452 aa  46.6  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.723695  normal  0.916322 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1344  hypothetical protein  29.46 
 
 
451 aa  46.2  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  31.86 
 
 
570 aa  46.2  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4741  hypothetical protein  40.74 
 
 
629 aa  45.8  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.404612 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  28.83 
 
 
569 aa  45.8  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6133  ATPase-like protein  32.71 
 
 
630 aa  45.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.869987  normal  0.698643 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1070  hypothetical protein  28.68 
 
 
452 aa  45.8  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  28.57 
 
 
559 aa  45.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0047  hypothetical protein  33.33 
 
 
486 aa  45.1  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1259  protein of unknown function DUF87  28.26 
 
 
540 aa  45.1  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0467  ATPase-like protein  23.73 
 
 
1034 aa  45.1  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  22.22 
 
 
563 aa  44.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>