24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2631 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2631  hypothetical protein  100 
 
 
886 aa  1745    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.703653 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5149  AAA ATPase  46.08 
 
 
1031 aa  492  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120671  normal  0.52051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1183  AAA ATPase  45.84 
 
 
1043 aa  481  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1484  hypothetical protein  39.49 
 
 
1144 aa  422  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0469742  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5089  AAA ATPase  40.28 
 
 
1100 aa  401  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0231758  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3423  AAA ATPase  38.66 
 
 
1104 aa  352  1e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.598451  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1184  ATPase  33.44 
 
 
1071 aa  280  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2709  ATPase-like  31.16 
 
 
1106 aa  278  4e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  31.02 
 
 
1076 aa  229  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3967  AAA ATPase  31.02 
 
 
1046 aa  214  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2242  hypothetical protein  55.1 
 
 
658 aa  52.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3193  hypothetical protein  50.91 
 
 
653 aa  50.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2606  hypothetical protein  40.98 
 
 
1050 aa  49.7  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320925  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  32.93 
 
 
616 aa  48.9  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0321  hypothetical protein  32.91 
 
 
499 aa  47  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0756  hypothetical protein  32.47 
 
 
645 aa  46.2  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00608077 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  30.49 
 
 
605 aa  46.2  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  34.85 
 
 
608 aa  45.8  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  34.25 
 
 
360 aa  45.4  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0343  hypothetical protein  31.65 
 
 
499 aa  45.4  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4741  hypothetical protein  38.81 
 
 
629 aa  45.1  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.404612 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1344  hypothetical protein  34.38 
 
 
451 aa  44.3  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  42.31 
 
 
557 aa  44.3  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1251  hypothetical protein  20.86 
 
 
657 aa  44.3  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>