27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3642 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3642  ATPase-like  100 
 
 
558 aa  1160    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.361749  normal  0.410506 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2968  hypothetical protein  25.39 
 
 
593 aa  152  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1931  hypothetical protein  24.01 
 
 
595 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000517452 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2699  AAA ATPase  22.43 
 
 
603 aa  113  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.480316  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2555  ATPase-like  21.15 
 
 
700 aa  73.6  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  23.81 
 
 
508 aa  58.2  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5149  AAA ATPase  27.92 
 
 
1031 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120671  normal  0.52051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1183  AAA ATPase  27.45 
 
 
1043 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  26.55 
 
 
496 aa  51.2  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  20.22 
 
 
559 aa  50.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  23.53 
 
 
537 aa  48.5  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1514  ATPase-like protein  30.28 
 
 
611 aa  47.8  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1563  ATPase-like protein  30.28 
 
 
611 aa  47.8  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0074  hypothetical protein  25 
 
 
495 aa  47.4  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0871233  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0937  hypothetical protein  25 
 
 
540 aa  47  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0147133  normal  0.254287 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  30.63 
 
 
563 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  34.92 
 
 
557 aa  45.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1913  ATPase-like protein  26.5 
 
 
578 aa  45.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219994  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1498  hypothetical protein  25.47 
 
 
582 aa  45.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2164  hypothetical protein  24.7 
 
 
582 aa  44.7  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000710411 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6133  ATPase-like protein  28.07 
 
 
630 aa  44.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.869987  normal  0.698643 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3967  AAA ATPase  22.36 
 
 
1046 aa  44.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  37.68 
 
 
591 aa  44.3  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  27.21 
 
 
679 aa  43.9  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1619  hypothetical protein  24.84 
 
 
532 aa  43.9  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1450  protein of unknown function DUF87  24.2 
 
 
581 aa  43.9  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0452751  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2632  ATPase  24.16 
 
 
319 aa  43.5  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.57356 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>