65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3942 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3942  hypothetical protein  100 
 
 		 721 aa  1489    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.222103  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0408  hypothetical protein  32.92 
 
 		 657 aa  342  1e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.54792  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4804  hypothetical protein  32.01 
 
 		 670 aa  320  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2019  protein of unknown function DUF87  31.22 
 
 		 700 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1619  hypothetical protein  27.81 
 
 		 721 aa  232  2e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260804  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1837  hypothetical protein  26.62 
 
 		 697 aa  207  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1476  hypothetical protein  27.52 
 
 		 670 aa  206  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.217881  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7314  hypothetical protein  33.03 
 
 		 699 aa  150  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00058158  hitchhiker  0.000000228931 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2387  protein of unknown function DUF87  30.2 
 
 		 708 aa  65.9  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.10181  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  28.24 
 
 		 496 aa  65.1  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0751  protein of unknown function DUF87  30.11 
 
 		 499 aa  63.5  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14388  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0691  hypothetical protein  30.25 
 
 		 700 aa  62  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00451625  hitchhiker  0.000217463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1882  protein of unknown function DUF87  29.01 
 
 		 581 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000610913 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  35.05 
 
 		 601 aa  57.8  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  22.16 
 
 		 557 aa  57.8  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  24.18 
 
 		 508 aa  55.5  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1515  protein of unknown function DUF87  30.53 
 
 		 530 aa  54.7  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.649754  normal  0.132485 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  33.72 
 
 		 659 aa  54.3  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  40.45 
 
 		 674 aa  53.5  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  33.72 
 
 		 670 aa  53.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  27.82 
 
 		 563 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  30.88 
 
 		 544 aa  50.8  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1440  hypothetical protein  23.94 
 
 		 539 aa  50.4  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.828058  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  33.33 
 
 		 546 aa  48.5  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  29.31 
 
 		 587 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  32.89 
 
 		 595 aa  48.1  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  28.57 
 
 		 520 aa  48.1  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  32.5 
 
 		 579 aa  48.1  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  35.9 
 
 		 693 aa  48.1  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  33.33 
 
 		 360 aa  47.8  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  39.13 
 
 		 569 aa  47.8  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2256  hypothetical protein  26.25 
 
 		 651 aa  47.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.562267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  39.13 
 
 		 679 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  38.03 
 
 		 569 aa  47.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  39.13 
 
 		 674 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  36.9 
 
 		 714 aa  47  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  36.49 
 
 		 579 aa  47  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0816  hypothetical protein  28.45 
 
 		 452 aa  47.4  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.723695  normal  0.916322 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0047  hypothetical protein  25.6 
 
 		 486 aa  46.6  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  27.32 
 
 		 584 aa  46.2  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  32.43 
 
 		 526 aa  46.2  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  37.68 
 
 		 662 aa  45.8  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  28.42 
 
 		 583 aa  45.8  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  29.01 
 
 		 561 aa  45.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1070  hypothetical protein  25.47 
 
 		 452 aa  45.4  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  33.33 
 
 		 557 aa  45.8  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  27.27 
 
 		 623 aa  45.8  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  27.32 
 
 		 617 aa  45.8  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  30.93 
 
 		 603 aa  45.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  37.04 
 
 		 607 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  32.53 
 
 		 664 aa  45.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  30 
 
 		 628 aa  44.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  36.99 
 
 		 575 aa  44.7  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  38.24 
 
 		 626 aa  44.7  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  27.63 
 
 		 250 aa  44.7  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  24.8 
 
 		 497 aa  44.7  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2549  hypothetical protein  32.43 
 
 		 542 aa  44.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.170922  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  24.8 
 
 		 497 aa  44.7  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  34.78 
 
 		 709 aa  44.3  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  24.73 
 
 		 493 aa  44.3  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0941  AAA ATPase  29.2 
 
 		 456 aa  44.3  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0685894 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0753  protein of unknown function DUF87  28.92 
 
 		 506 aa  43.9  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0799035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2315  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1743 aa  43.9  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  35.71 
 
 		 593 aa  43.9  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0074  hypothetical protein  27.87 
 
 		 495 aa  43.9  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0871233  normal  0.176107 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>