120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2256 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2256  hypothetical protein  100 
 
 		 651 aa  1332    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.562267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  24.17 
 
 		 508 aa  100  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  24.36 
 
 		 520 aa  82  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  22.61 
 
 		 557 aa  79.7  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  24.63 
 
 		 709 aa  79  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  27.72 
 
 		 559 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1625  hypothetical protein  28.78 
 
 		 783 aa  71.2  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  21.68 
 
 		 587 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  21.4 
 
 		 628 aa  70.1  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  35.84 
 
 		 709 aa  67  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  23.15 
 
 		 546 aa  65.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2149  ATPase  26.34 
 
 		 605 aa  65.9  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  28.81 
 
 		 497 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  28.81 
 
 		 497 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  28.81 
 
 		 497 aa  65.1  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1979  Tubulin  25.91 
 
 		 625 aa  65.1  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0773401 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  26.02 
 
 		 564 aa  64.7  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  28.16 
 
 		 493 aa  64.3  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1379  hypothetical protein  25.7 
 
 		 604 aa  63.9  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  33.61 
 
 		 574 aa  63.9  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  24.49 
 
 		 496 aa  63.2  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  30.06 
 
 		 500 aa  63.2  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  22.9 
 
 		 563 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1515  protein of unknown function DUF87  23.33 
 
 		 530 aa  62  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.649754  normal  0.132485 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2277  hypothetical protein  24.12 
 
 		 653 aa  62  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0611  ATPase-like protein  23.62 
 
 		 618 aa  61.6  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1658  hypothetical protein  25 
 
 		 604 aa  60.8  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  32.39 
 
 		 714 aa  60.8  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.74185 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0018  protein of unknown function DUF87  29.68 
 
 		 537 aa  59.3  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.989354  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  23.4 
 
 		 557 aa  59.7  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  29.3 
 
 		 531 aa  59.3  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  25.29 
 
 		 560 aa  59.7  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  28.02 
 
 		 581 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  25.05 
 
 		 559 aa  58.2  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3279  hypothetical protein  27.35 
 
 		 590 aa  57  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2954  hypothetical protein  23.31 
 
 		 589 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000103337 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  24.28 
 
 		 670 aa  57  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1512  AAA ATPase  29.21 
 
 		 595 aa  56.2  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000264338  normal  0.723812 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  29.51 
 
 		 570 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  30 
 
 		 659 aa  55.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  31.48 
 
 		 617 aa  55.5  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  23.11 
 
 		 524 aa  55.1  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  31.58 
 
 		 567 aa  54.3  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0786  hypothetical protein  22.49 
 
 		 511 aa  54.3  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0655509  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  26.2 
 
 		 603 aa  54.3  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  21.48 
 
 		 593 aa  53.9  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  23.65 
 
 		 496 aa  53.9  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  37.63 
 
 		 492 aa  53.5  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  30.7 
 
 		 600 aa  53.9  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  22.86 
 
 		 605 aa  52.4  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0926  protein of unknown function DUF87  26.4 
 
 		 553 aa  52  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  23.08 
 
 		 611 aa  52  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  26.32 
 
 		 594 aa  52.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  30.12 
 
 		 524 aa  52  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  23.38 
 
 		 510 aa  52  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1466  hypothetical protein  23.42 
 
 		 278 aa  51.2  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1619  hypothetical protein  22.15 
 
 		 532 aa  51.6  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  21.59 
 
 		 616 aa  51.2  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  28.97 
 
 		 550 aa  51.2  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  22.42 
 
 		 523 aa  51.2  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1585  protein of unknown function DUF87  29.13 
 
 		 572 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.049395 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2030  hypothetical protein  26.67 
 
 		 589 aa  50.8  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309935 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  22.34 
 
 		 608 aa  50.8  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  36.56 
 
 		 607 aa  50.8  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  26.27 
 
 		 595 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2366  protein of unknown function DUF87  24.17 
 
 		 592 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.250268  normal  0.14702 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1479  hypothetical protein  28.5 
 
 		 580 aa  49.3  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0102316  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  29.88 
 
 		 546 aa  49.7  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0937  hypothetical protein  29.27 
 
 		 540 aa  49.7  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0147133  normal  0.254287 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  30.56 
 
 		 628 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  27.49 
 
 		 664 aa  48.9  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  30.77 
 
 		 612 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2047  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  22.96 
 
 		 536 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.171196  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0236  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  22.02 
 
 		 496 aa  48.9  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  28.95 
 
 		 427 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  24.79 
 
 		 601 aa  48.5  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0132  protein of unknown function DUF87  25.84 
 
 		 534 aa  48.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0970919  decreased coverage  0.000025846 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5533  hypothetical protein  34.91 
 
 		 608 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.423742  normal  0.336707 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5935  hypothetical protein  34.91 
 
 		 608 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0918921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  26.79 
 
 		 674 aa  47.8  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0691  hypothetical protein  27.27 
 
 		 700 aa  47.8  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00451625  hitchhiker  0.000217463 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  27.17 
 
 		 569 aa  47.8  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  23.08 
 
 		 579 aa  47.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  29.63 
 
 		 583 aa  47.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2521  hypothetical protein  21.01 
 
 		 511 aa  47.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3529  hypothetical protein  22.08 
 
 		 536 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.370836 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  28.41 
 
 		 537 aa  47  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1476  hypothetical protein  26.49 
 
 		 670 aa  46.6  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.217881  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3942  hypothetical protein  26.25 
 
 		 721 aa  47  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.222103  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  27.78 
 
 		 583 aa  47  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  24.86 
 
 		 544 aa  47  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2787  hypothetical protein  24.65 
 
 		 624 aa  47  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0102  HerA-ATP synthase, barrel domain protein  30 
 
 		 609 aa  45.8  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  28.7 
 
 		 617 aa  46.2  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1906  hypothetical protein  21.97 
 
 		 579 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000004225  normal  0.0184215 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0349  protein of unknown function DUF87  29.35 
 
 		 540 aa  46.2  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4413  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  22.31 
 
 		 523 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  29.63 
 
 		 583 aa  46.6  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0920  putative ATP-binding protein  22.02 
 
 		 1090 aa  46.2  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.061859  normal  0.0138151 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2549  hypothetical protein  24.89 
 
 		 542 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.170922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>