18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1837 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1837  hypothetical protein  100 
 
 
697 aa  1441    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1476  hypothetical protein  32.23 
 
 
670 aa  340  8e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.217881  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0408  hypothetical protein  29.76 
 
 
657 aa  286  9e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.54792  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4804  hypothetical protein  28.09 
 
 
670 aa  253  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2019  protein of unknown function DUF87  27.36 
 
 
700 aa  244  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7314  hypothetical protein  29.47 
 
 
699 aa  220  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00058158  hitchhiker  0.000000228931 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3942  hypothetical protein  26.62 
 
 
721 aa  207  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.222103  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1619  hypothetical protein  27.86 
 
 
721 aa  204  4e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260804  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0751  protein of unknown function DUF87  21.55 
 
 
499 aa  56.2  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14388  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  31.13 
 
 
601 aa  53.9  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  25.15 
 
 
497 aa  53.5  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  25.15 
 
 
497 aa  53.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  25.15 
 
 
497 aa  52  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  22.18 
 
 
570 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  27.27 
 
 
250 aa  47  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  28.47 
 
 
496 aa  45.4  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  26.77 
 
 
520 aa  45.4  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  33.33 
 
 
603 aa  44.7  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>