121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1098 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1098  hypothetical protein  100 
 
 
521 aa  1054    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1108  AAA ATPase  28.49 
 
 
534 aa  183  8.000000000000001e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00107728  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1296  AAA ATPase  28.87 
 
 
537 aa  174  5e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0819436 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1145  AAA ATPase  28.71 
 
 
533 aa  169  1e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00264126  hitchhiker  0.0000264348 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1512  AAA ATPase  27.3 
 
 
595 aa  167  5e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000264338  normal  0.723812 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2082  AAA ATPase  27.72 
 
 
600 aa  167  5.9999999999999996e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.901274 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0102  HerA-ATP synthase, barrel domain protein  25.56 
 
 
609 aa  147  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1849  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  27.35 
 
 
511 aa  73.9  0.000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.892343  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0494  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  26.86 
 
 
505 aa  65.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0635  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  24.59 
 
 
513 aa  63.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  24.61 
 
 
581 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  24.32 
 
 
508 aa  61.2  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  22.77 
 
 
520 aa  60.8  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1625  hypothetical protein  21.22 
 
 
783 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  23.84 
 
 
628 aa  58.9  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  22.73 
 
 
531 aa  58.5  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4413  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  26.15 
 
 
523 aa  57.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2149  ATPase  21.72 
 
 
605 aa  57.8  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  21.01 
 
 
492 aa  57  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  23.79 
 
 
500 aa  56.2  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0321  hypothetical protein  22.97 
 
 
499 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4680  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  25.15 
 
 
529 aa  56.6  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0218814  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06795  hypothetical protein  25.07 
 
 
516 aa  56.2  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.207511  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1440  hypothetical protein  38.46 
 
 
539 aa  55.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.828058  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0823  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  25.22 
 
 
522 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  25.2 
 
 
546 aa  53.9  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  37.63 
 
 
559 aa  53.9  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0936  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  24.59 
 
 
521 aa  53.9  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222531  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3912  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  26.29 
 
 
579 aa  53.5  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  31.53 
 
 
537 aa  53.5  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  24.55 
 
 
497 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  34.57 
 
 
591 aa  53.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0343  hypothetical protein  22.46 
 
 
499 aa  52.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0767  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  26.1 
 
 
482 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  24.75 
 
 
524 aa  52.4  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  35.42 
 
 
544 aa  52.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  24.22 
 
 
493 aa  52.8  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0578  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  25.79 
 
 
520 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215105  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  34.48 
 
 
569 aa  51.6  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0535  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  25.88 
 
 
501 aa  51.6  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.162196  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  28.78 
 
 
523 aa  51.6  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  36.99 
 
 
593 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  24.11 
 
 
497 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  36.49 
 
 
569 aa  51.2  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1283  hypothetical protein  25.29 
 
 
517 aa  51.6  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608046  normal  0.929249 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0751  protein of unknown function DUF87  35.37 
 
 
499 aa  51.2  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14388  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  21.1 
 
 
605 aa  51.2  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  26.44 
 
 
524 aa  51.2  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  30.84 
 
 
679 aa  51.6  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  34.29 
 
 
579 aa  51.2  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  32.62 
 
 
526 aa  50.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  25.12 
 
 
523 aa  50.8  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3639  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  25.57 
 
 
522 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0432207  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  36.11 
 
 
599 aa  50.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3712  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  25.57 
 
 
522 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.534024  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3644  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  25.57 
 
 
523 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.852861  normal  0.874146 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  24.33 
 
 
497 aa  50.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  41.18 
 
 
570 aa  49.7  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  34.29 
 
 
587 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2768  hypothetical protein  24.46 
 
 
508 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1752  protein of unknown function DUF87  28.48 
 
 
643 aa  49.3  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  32.88 
 
 
594 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2235  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  25.35 
 
 
514 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173047  normal  0.0160652 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1768  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  23.19 
 
 
522 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.307535 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1223  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  24.65 
 
 
514 aa  48.5  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00822087  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1340  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  24.2 
 
 
515 aa  48.5  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  26.85 
 
 
616 aa  48.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  26.79 
 
 
595 aa  48.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1204  hypothetical protein  23.74 
 
 
527 aa  47.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2189  hypothetical protein  23.74 
 
 
535 aa  47.8  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  31.46 
 
 
557 aa  47.8  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1374  protein of unknown function DUF87  26.92 
 
 
538 aa  47.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3713  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  25.28 
 
 
580 aa  47.8  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0091  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  25.23 
 
 
488 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0259973  normal  0.193086 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  32.47 
 
 
709 aa  47.4  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12532  hypothetical protein  24.65 
 
 
533 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255447 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2631  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  23.98 
 
 
522 aa  47  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0732  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  25.07 
 
 
488 aa  47  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0114727  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  29.7 
 
 
561 aa  47  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1273  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  23.56 
 
 
520 aa  47  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.50823  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2521  hypothetical protein  24.62 
 
 
511 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3313  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  23.16 
 
 
565 aa  46.6  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1018  ATPase  24.93 
 
 
463 aa  46.6  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1389  hypothetical protein  34.04 
 
 
606 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22220  predicted ATPase  24.56 
 
 
544 aa  46.2  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.198348 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  29.75 
 
 
496 aa  46.2  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  32.26 
 
 
550 aa  45.8  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0915  hypothetical protein  24.93 
 
 
463 aa  46.2  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  22.93 
 
 
563 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2668  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  24.04 
 
 
504 aa  45.8  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.881432  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  31.94 
 
 
623 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4068  hypothetical protein  24.6 
 
 
541 aa  45.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  20.04 
 
 
611 aa  45.1  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  22.78 
 
 
601 aa  45.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  32.5 
 
 
664 aa  45.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0096  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  25.31 
 
 
490 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2540  conserved hypothetical protein  53.66 
 
 
41 aa  44.7  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.526954  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0563  hypothetical protein  23.74 
 
 
503 aa  44.7  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  31.88 
 
 
579 aa  44.7  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2544  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  25.36 
 
 
526 aa  44.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>