66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3692 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3692  protein of unknown function DUF87  100 
 
 
382 aa  780    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.703061  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  46.77 
 
 
600 aa  354  1e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  55.3 
 
 
427 aa  252  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  35.51 
 
 
574 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  34.56 
 
 
567 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  33.95 
 
 
570 aa  193  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4327  hypothetical protein  59.79 
 
 
109 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  28.32 
 
 
593 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  25.95 
 
 
603 aa  74.3  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  27.27 
 
 
617 aa  68.2  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  24.16 
 
 
714 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  25.28 
 
 
591 aa  63.2  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  27.35 
 
 
623 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  46.77 
 
 
579 aa  60.1  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  23.2 
 
 
709 aa  59.7  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  24.12 
 
 
546 aa  58.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2577  protein of unknown function DUF606  91.67 
 
 
183 aa  58.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  24.82 
 
 
709 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  26.73 
 
 
601 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  40.98 
 
 
577 aa  57  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  28.35 
 
 
493 aa  57  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  37.84 
 
 
524 aa  53.9  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  40.58 
 
 
524 aa  53.5  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  28.27 
 
 
497 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  27.75 
 
 
497 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  25.97 
 
 
583 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  24.79 
 
 
679 aa  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  30.19 
 
 
523 aa  51.2  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  40.28 
 
 
524 aa  50.8  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  34.91 
 
 
508 aa  50.4  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  28.1 
 
 
561 aa  50.4  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  24.17 
 
 
583 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  24.68 
 
 
628 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  45.1 
 
 
575 aa  49.7  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1374  protein of unknown function DUF87  32.06 
 
 
538 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16230  excinuclease ABC, B subunit  30.33 
 
 
672 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  25.71 
 
 
599 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  27.23 
 
 
497 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  29.25 
 
 
550 aa  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  34.26 
 
 
496 aa  47.8  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3279  hypothetical protein  25.89 
 
 
590 aa  47  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2366  protein of unknown function DUF87  24.06 
 
 
592 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.250268  normal  0.14702 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2954  hypothetical protein  24.73 
 
 
589 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000103337 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  42.62 
 
 
594 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0349  protein of unknown function DUF87  24.91 
 
 
540 aa  45.8  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  51.22 
 
 
605 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  45.65 
 
 
628 aa  45.8  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  51.22 
 
 
608 aa  45.8  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  27.46 
 
 
674 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  29.03 
 
 
520 aa  45.1  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  34.04 
 
 
523 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  29.84 
 
 
616 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  27.27 
 
 
670 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  48.78 
 
 
611 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  24.15 
 
 
584 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  24.07 
 
 
582 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  26.18 
 
 
664 aa  44.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0467  ATPase-like protein  31.34 
 
 
1034 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  26.98 
 
 
607 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0410  excinuclease ABC, B subunit  28.69 
 
 
663 aa  44.3  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.662388  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  23.51 
 
 
659 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1413  excinuclease ABC subunit B  31.33 
 
 
660 aa  43.9  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000981349  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0645  hypothetical protein  27.98 
 
 
686 aa  43.5  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.549524  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  24.52 
 
 
617 aa  43.5  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  28.12 
 
 
557 aa  43.5  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  27.59 
 
 
531 aa  43.5  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>