31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4559 on replicon NC_011881
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008537  Arth_4502  hypothetical protein  92.56 
 
 
528 aa  885    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.689738  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4215  hypothetical protein  92.47 
 
 
518 aa  855    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4559  hypothetical protein  100 
 
 
485 aa  984    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.168528 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4277  hypothetical protein  56.07 
 
 
539 aa  542  1e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4943  hypothetical protein  43 
 
 
624 aa  358  1.9999999999999998e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0368  ATPase  41.37 
 
 
532 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0513969  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5522  hypothetical protein  40.43 
 
 
516 aa  322  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.349353  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5435  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  30.88 
 
 
515 aa  143  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62909  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8941  hypothetical protein  28.91 
 
 
505 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57395  normal  0.334134 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2362  hypothetical protein  45.67 
 
 
144 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.342043  normal  0.319216 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1572  ATP-binding protein  28.96 
 
 
496 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.160192  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4709  hypothetical protein  27.68 
 
 
511 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0831911  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0034  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  28.12 
 
 
711 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0687  ATP-binding protein  28.81 
 
 
502 aa  94  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7298  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.75 
 
 
696 aa  92.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  0.0433123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0444  hypothetical protein  27.45 
 
 
509 aa  89  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2243  ATP-binding protein  27.3 
 
 
512 aa  88.2  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06480  type IV secretory pathway VirB4 component-like protein  25.27 
 
 
500 aa  85.1  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.132231  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0805  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  28.77 
 
 
495 aa  83.6  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06770  hypothetical protein  28.21 
 
 
495 aa  80.5  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00150  hypothetical protein  27.92 
 
 
495 aa  77.4  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1502  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.58 
 
 
609 aa  57  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0301  hypothetical protein  23.29 
 
 
818 aa  51.6  0.00003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0733022  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2753  hypothetical protein  24.31 
 
 
610 aa  51.6  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1815  putative type IV secretory pathway VirB4 protein  25.41 
 
 
747 aa  49.3  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  31.53 
 
 
659 aa  49.3  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0914  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.02 
 
 
1043 aa  48.9  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0791  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.59 
 
 
815 aa  48.5  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18940  hypothetical protein  26.51 
 
 
908 aa  48.1  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0727779 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1505  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  30.84 
 
 
836 aa  45.8  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0609191  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  30.36 
 
 
611 aa  44.3  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>