68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0791 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1505  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  66.34 
 
 
836 aa  1069    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0609191  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0791  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  100 
 
 
815 aa  1682    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18940  hypothetical protein  63.19 
 
 
908 aa  1021    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0727779 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1815  putative type IV secretory pathway VirB4 protein  32.58 
 
 
747 aa  383  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0914  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  30.74 
 
 
1043 aa  364  3e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1287  Tn5252, Orf26  29.36 
 
 
776 aa  355  2e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1816  truncated type IV secretory pathway VirB4 component protein  27.57 
 
 
668 aa  253  9.000000000000001e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.09 
 
 
631 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.43 
 
 
611 aa  119  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.51 
 
 
608 aa  116  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  24.05 
 
 
629 aa  103  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.1 
 
 
629 aa  103  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.82 
 
 
659 aa  102  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1056  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.3 
 
 
566 aa  100  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000236301  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.68 
 
 
595 aa  99.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  24.63 
 
 
621 aa  98.6  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.09 
 
 
630 aa  96.3  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4995  hypothetical protein  23.52 
 
 
893 aa  94  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.124549  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6728  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.61 
 
 
657 aa  93.2  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1395  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  25.18 
 
 
616 aa  81.6  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0290868  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  23.41 
 
 
569 aa  80.5  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0931  hypothetical protein  23.26 
 
 
616 aa  78.6  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0132  hypothetical protein  22.43 
 
 
699 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000387943 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1815  truncated type IV secretory pathway VirB4 component protein  38.52 
 
 
127 aa  75.9  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0025  hypothetical protein  22.43 
 
 
699 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0226  hypothetical protein  22.37 
 
 
699 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  22.43 
 
 
827 aa  69.3  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1688  transfer complex protein  20.32 
 
 
663 aa  66.2  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.330287  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  22.86 
 
 
847 aa  65.5  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0179  membrane bound ATPase, putative  21.99 
 
 
955 aa  64.3  0.000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06770  hypothetical protein  22.55 
 
 
495 aa  64.3  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0371  F-pilin subunit assembly into extended F pili  21.71 
 
 
809 aa  63.9  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221651  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2211  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.59 
 
 
618 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3176  conjugation protein  20.16 
 
 
1085 aa  62.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.17 
 
 
868 aa  62.4  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2948  Type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TRAC  23.06 
 
 
841 aa  62  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0805  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.58 
 
 
495 aa  62.4  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0177  hypothetical protein  25 
 
 
696 aa  61.2  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  21.91 
 
 
874 aa  61.2  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00150  hypothetical protein  22.37 
 
 
495 aa  60.8  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3545  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  22.73 
 
 
811 aa  60.1  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0653304  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1342  ATP-binding protein  22.81 
 
 
461 aa  58.2  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0028  hypothetical protein  25.68 
 
 
858 aa  57.8  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0798103  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2964  transfer complex protein  20.28 
 
 
711 aa  54.7  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6206  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  20.04 
 
 
839 aa  52.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.623322  normal  0.0559252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4357  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  21.52 
 
 
819 aa  52  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.471619  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0008  hypothetical protein  24.5 
 
 
644 aa  51.6  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.263896  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  24.74 
 
 
866 aa  51.6  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6405  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  18.8 
 
 
819 aa  50.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0682909  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0505  type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TraC  21.49 
 
 
843 aa  49.7  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5522  hypothetical protein  24.07 
 
 
516 aa  49.7  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.349353  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0008  ATPase  27.11 
 
 
645 aa  50.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0518  Type IV secretory pathway VirB4 protein  24.09 
 
 
845 aa  48.9  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832849  normal  0.194578 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5086  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  21.68 
 
 
790 aa  48.9  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4559  hypothetical protein  25.59 
 
 
485 aa  48.5  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.168528 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1502  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21 
 
 
609 aa  48.5  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0316  sex pilus assembly protein  20.04 
 
 
815 aa  48.5  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0565  hypothetical protein  24.31 
 
 
945 aa  48.1  0.0006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2753  hypothetical protein  21.49 
 
 
610 aa  47.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3127  hypothetical protein  22.7 
 
 
610 aa  47.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1481  conjugative transposon protein TraG  21.14 
 
 
841 aa  47  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.612602 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0020  hypothetical protein  22.22 
 
 
865 aa  46.2  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6919  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26 
 
 
792 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  21.83 
 
 
864 aa  45.8  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0253  sex pilus assembly protein  20.46 
 
 
815 aa  45.8  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4502  hypothetical protein  28.97 
 
 
528 aa  45.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.689738  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4215  hypothetical protein  30.28 
 
 
518 aa  45.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1089  type-IV secretion system protein TraC  25.89 
 
 
866 aa  45.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>