49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1342 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1342  ATP-binding protein  100 
 
 
461 aa  906    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3322  putative ATP-binding protein  60.69 
 
 
480 aa  471  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.540198 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7298  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  31.67 
 
 
696 aa  183  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  0.0433123 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06770  hypothetical protein  33.73 
 
 
495 aa  182  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00150  hypothetical protein  34.1 
 
 
495 aa  182  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0034  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  31.43 
 
 
711 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0805  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  33.57 
 
 
495 aa  179  8e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5435  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  30.72 
 
 
515 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62909  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8941  hypothetical protein  31.12 
 
 
505 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57395  normal  0.334134 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06480  type IV secretory pathway VirB4 component-like protein  28.76 
 
 
500 aa  148  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.132231  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0444  hypothetical protein  29.07 
 
 
509 aa  129  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1572  ATP-binding protein  27.58 
 
 
496 aa  117  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.160192  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8298  hypothetical protein  27.74 
 
 
575 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4709  hypothetical protein  26.38 
 
 
511 aa  109  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0831911  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0687  ATP-binding protein  27.25 
 
 
502 aa  82.8  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0931  hypothetical protein  21.85 
 
 
616 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0205  AAA ATPase  28.89 
 
 
385 aa  80.1  0.00000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.519462  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2243  ATP-binding protein  27.04 
 
 
512 aa  77  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.89 
 
 
608 aa  73.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.08 
 
 
629 aa  73.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5522  hypothetical protein  24.22 
 
 
516 aa  72.4  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.349353  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  27.13 
 
 
569 aa  71.2  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  20.96 
 
 
621 aa  71.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.53 
 
 
659 aa  68.2  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0132  hypothetical protein  20.36 
 
 
699 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000387943 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0914  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.31 
 
 
1043 aa  64.7  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0025  hypothetical protein  20.36 
 
 
699 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  25.62 
 
 
629 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  21.84 
 
 
611 aa  60.5  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0226  hypothetical protein  30.97 
 
 
699 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0791  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.81 
 
 
815 aa  58.5  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0368  ATPase  24.43 
 
 
532 aa  57.8  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0513969  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.6 
 
 
630 aa  57  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0371  F-pilin subunit assembly into extended F pili  22.35 
 
 
809 aa  56.2  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221651  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4277  hypothetical protein  25.06 
 
 
539 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  23.3 
 
 
866 aa  54.7  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1505  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.42 
 
 
836 aa  54.3  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0609191  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.82 
 
 
595 aa  53.9  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18940  hypothetical protein  24.63 
 
 
908 aa  52.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0727779 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0029  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  23.96 
 
 
875 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4995  hypothetical protein  23.01 
 
 
893 aa  51.6  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.124549  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.38 
 
 
631 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1815  putative type IV secretory pathway VirB4 protein  20.57 
 
 
747 aa  47.8  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  24.36 
 
 
847 aa  47.4  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  28.45 
 
 
815 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6728  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  28.81 
 
 
657 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3176  conjugation protein  24.18 
 
 
1085 aa  44.7  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2964  transfer complex protein  22.85 
 
 
711 aa  44.3  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1816  truncated type IV secretory pathway VirB4 component protein  28.67 
 
 
668 aa  43.1  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>