55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_06770 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_06770  hypothetical protein  100 
 
 		 495 aa  992    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0805  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  74.54 
 
 		 495 aa  705    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00150  hypothetical protein  93.54 
 
 		 495 aa  912    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0444  hypothetical protein  42.17 
 
 		 509 aa  329  7e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7298  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  41.15 
 
 		 696 aa  318  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  0.0433123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0034  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  41.63 
 
 		 711 aa  317  3e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06480  type IV secretory pathway VirB4 component-like protein  40.17 
 
 		 500 aa  310  2.9999999999999997e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.132231  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5435  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  33.01 
 
 		 515 aa  241  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8941  hypothetical protein  31.86 
 
 		 505 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57395  normal  0.334134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1342  ATP-binding protein  33.73 
 
 		 461 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0687  ATP-binding protein  34.19 
 
 		 502 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3322  putative ATP-binding protein  31.67 
 
 		 480 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.540198 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1572  ATP-binding protein  32.8 
 
 		 496 aa  161  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.160192  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8298  hypothetical protein  30.72 
 
 		 575 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2243  ATP-binding protein  31.82 
 
 		 512 aa  148  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4709  hypothetical protein  29.55 
 
 		 511 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0831911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5522  hypothetical protein  28.25 
 
 		 516 aa  133  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.349353  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  31.8 
 
 		 608 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0205  AAA ATPase  30.05 
 
 		 385 aa  102  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.519462  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  29.41 
 
 		 629 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  30.02 
 
 		 595 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.18 
 
 		 631 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.27 
 
 		 659 aa  88.2  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  29.67 
 
 		 629 aa  86.7  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0914  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.03 
 
 		 1043 aa  85.5  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0368  ATPase  26.65 
 
 		 532 aa  83.6  0.000000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0513969  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4502  hypothetical protein  29.43 
 
 		 528 aa  81.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.689738  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  20.42 
 
 		 621 aa  81.3  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4215  hypothetical protein  27.39 
 
 		 518 aa  79.7  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4559  hypothetical protein  28.49 
 
 		 485 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.168528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  28.1 
 
 		 630 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  26.44 
 
 		 569 aa  72.8  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4943  hypothetical protein  26.15 
 
 		 624 aa  72  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18940  hypothetical protein  26.2 
 
 		 908 aa  71.6  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0727779 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  20.63 
 
 		 611 aa  70.1  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4277  hypothetical protein  25.52 
 
 		 539 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0791  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.55 
 
 		 815 aa  63.9  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1505  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.94 
 
 		 836 aa  61.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0609191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1815  putative type IV secretory pathway VirB4 protein  24.13 
 
 		 747 aa  60.1  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1395  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.39 
 
 		 616 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0290868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1056  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.16 
 
 		 566 aa  57.4  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000236301  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6728  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  28.03 
 
 		 657 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0371  F-pilin subunit assembly into extended F pili  21.93 
 
 		 809 aa  54.3  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3127  hypothetical protein  27.78 
 
 		 610 aa  53.9  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0253  sex pilus assembly protein  21.36 
 
 		 815 aa  53.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2211  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  23.08 
 
 		 618 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  23.67 
 
 		 847 aa  51.2  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  24.07 
 
 		 815 aa  50.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4995  hypothetical protein  24.88 
 
 		 893 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.124549  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0931  hypothetical protein  21.1 
 
 		 616 aa  48.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0301  hypothetical protein  25.33 
 
 		 818 aa  46.2  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0733022  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3115  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.39 
 
 		 802 aa  45.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0316  sex pilus assembly protein  20.33 
 
 		 815 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0179  membrane bound ATPase, putative  25.2 
 
 		 955 aa  45.1  0.003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1816  truncated type IV secretory pathway VirB4 component protein  26.71 
 
 		 668 aa  43.9  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>