25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0368 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0368  ATPase  100 
 
 
532 aa  1085    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0513969  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4502  hypothetical protein  41.84 
 
 
528 aa  345  1e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.689738  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4215  hypothetical protein  41.21 
 
 
518 aa  340  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4559  hypothetical protein  40.96 
 
 
485 aa  330  4e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.168528 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4277  hypothetical protein  39.12 
 
 
539 aa  319  9e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5522  hypothetical protein  38.53 
 
 
516 aa  293  6e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.349353  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4943  hypothetical protein  35.4 
 
 
624 aa  240  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8941  hypothetical protein  29.18 
 
 
505 aa  143  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57395  normal  0.334134 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5435  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  31.47 
 
 
515 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62909  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7298  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.91 
 
 
696 aa  92  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  0.0433123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0034  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  24.62 
 
 
711 aa  90.9  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1572  ATP-binding protein  23.99 
 
 
496 aa  87.8  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.160192  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2362  hypothetical protein  36.07 
 
 
144 aa  87  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.342043  normal  0.319216 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00150  hypothetical protein  26.65 
 
 
495 aa  86.7  9e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2243  ATP-binding protein  25.36 
 
 
512 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0805  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.72 
 
 
495 aa  85.9  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0687  ATP-binding protein  25.33 
 
 
502 aa  84.3  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06770  hypothetical protein  26.65 
 
 
495 aa  84  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06480  type IV secretory pathway VirB4 component-like protein  24.74 
 
 
500 aa  82  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.132231  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4709  hypothetical protein  31.87 
 
 
511 aa  77.4  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0831911  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0444  hypothetical protein  23.59 
 
 
509 aa  60.8  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1815  putative type IV secretory pathway VirB4 protein  23.82 
 
 
747 aa  60.1  0.00000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1342  ATP-binding protein  24.43 
 
 
461 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3322  putative ATP-binding protein  25.45 
 
 
480 aa  53.5  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.540198 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18940  hypothetical protein  23.83 
 
 
908 aa  47  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0727779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>