27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4943 on replicon NC_013442
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013442  Gbro_4943  hypothetical protein  100 
 
 		 624 aa  1257    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4502  hypothetical protein  43.48 
 
 		 528 aa  363  6e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.689738  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4559  hypothetical protein  43 
 
 		 485 aa  353  7e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.168528 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4215  hypothetical protein  41.96 
 
 		 518 aa  345  1e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4277  hypothetical protein  40.97 
 
 		 539 aa  344  2e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5522  hypothetical protein  38.28 
 
 		 516 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.349353  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0368  ATPase  35.78 
 
 		 532 aa  249  7e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0513969  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5435  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.78 
 
 		 515 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8941  hypothetical protein  26.16 
 
 		 505 aa  120  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57395  normal  0.334134 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2362  hypothetical protein  43.41 
 
 		 144 aa  99.8  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.342043  normal  0.319216 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7298  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.14 
 
 		 696 aa  99.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  0.0433123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0034  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  25.91 
 
 		 711 aa  97.1  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1572  ATP-binding protein  27.07 
 
 		 496 aa  96.3  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.160192  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0687  ATP-binding protein  27.32 
 
 		 502 aa  94.7  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4709  hypothetical protein  24.83 
 
 		 511 aa  83.2  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0831911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2243  ATP-binding protein  24.42 
 
 		 512 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00150  hypothetical protein  26.04 
 
 		 495 aa  79.7  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0805  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.25 
 
 		 495 aa  76.3  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06770  hypothetical protein  26.04 
 
 		 495 aa  73.2  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06480  type IV secretory pathway VirB4 component-like protein  24.61 
 
 		 500 aa  73.2  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.132231  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  27.39 
 
 		 569 aa  62.4  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1395  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  25.06 
 
 		 616 aa  50.8  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0290868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0444  hypothetical protein  28.89 
 
 		 509 aa  48.1  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  22.92 
 
 		 611 aa  47.8  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2211  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.04 
 
 		 618 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1342  ATP-binding protein  24.01 
 
 		 461 aa  44.7  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8298  hypothetical protein  24 
 
 		 575 aa  43.9  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.237745 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>