43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3176 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_3176  conjugation protein  100 
 
 		 1085 aa  2226    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2964  transfer complex protein  36.03 
 
 		 711 aa  368  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1688  transfer complex protein  34.86 
 
 		 663 aa  343  1e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.330287  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4995  hypothetical protein  28.14 
 
 		 893 aa  203  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.124549  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1687  hypothetical protein  30.79 
 
 		 339 aa  148  7.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.957304  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  21.21 
 
 		 621 aa  98.2  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.48 
 
 		 659 aa  92.4  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.96 
 
 		 595 aa  92  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1056  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  20.92 
 
 		 566 aa  89.7  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000236301  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.03 
 
 		 608 aa  88.2  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1815  putative type IV secretory pathway VirB4 protein  21.52 
 
 		 747 aa  87.4  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.46 
 
 		 629 aa  87.8  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  22.59 
 
 		 629 aa  85.5  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  20.8 
 
 		 611 aa  82.8  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2963  hypothetical protein  22.55 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.85 
 
 		 630 aa  79.3  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1816  truncated type IV secretory pathway VirB4 component protein  23.39 
 
 		 668 aa  73.9  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0226  hypothetical protein  22.22 
 
 		 699 aa  74.3  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0301  hypothetical protein  22.44 
 
 		 818 aa  73.2  0.00000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0733022  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0025  hypothetical protein  21.88 
 
 		 699 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0132  hypothetical protein  21.88 
 
 		 699 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000387943 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3127  hypothetical protein  22.08 
 
 		 610 aa  70.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  20.42 
 
 		 631 aa  65.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2211  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  21.2 
 
 		 618 aa  65.5  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0791  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  20.16 
 
 		 815 aa  63.2  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1505  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.88 
 
 		 836 aa  62  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0609191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18940  hypothetical protein  19.45 
 
 		 908 aa  61.6  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0727779 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  20.38 
 
 		 569 aa  56.6  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5435  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.25 
 
 		 515 aa  53.5  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  21.2 
 
 		 847 aa  53.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0914  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  19.13 
 
 		 1043 aa  53.5  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1395  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  21.57 
 
 		 616 aa  52.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0290868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0163  hypothetical protein  24.1 
 
 		 323 aa  52.4  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427999  hitchhiker  1.86977e-20 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1287  Tn5252, Orf26  19.54 
 
 		 776 aa  50.1  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0931  hypothetical protein  20.79 
 
 		 616 aa  49.3  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2180  AAA ATPase  30.82 
 
 		 777 aa  49.3  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.520189  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1502  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.16 
 
 		 609 aa  48.1  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  22.4 
 
 		 864 aa  47.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0444  hypothetical protein  23.24 
 
 		 509 aa  46.2  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0337  putative plasmid-related protein  28.11 
 
 		 952 aa  45.1  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.92337  normal  0.715711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1342  ATP-binding protein  24.18 
 
 		 461 aa  45.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06480  type IV secretory pathway VirB4 component-like protein  23.67 
 
 		 500 aa  44.7  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.132231  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00150  hypothetical protein  25.33 
 
 		 495 aa  44.7  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>