63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1525 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1525  AAA ATPase  100 
 
 
624 aa  1262    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.368938  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2190  AAA ATPase  47.26 
 
 
622 aa  537  1e-151  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0020112  hitchhiker  0.0000768998 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  23.3 
 
 
569 aa  83.2  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  21.44 
 
 
621 aa  72  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.07 
 
 
608 aa  70.9  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0029  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  25.63 
 
 
875 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6728  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  29.29 
 
 
657 aa  68.2  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1056  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.18 
 
 
566 aa  67  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000236301  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  28 
 
 
866 aa  66.6  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4290  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  24.92 
 
 
866 aa  66.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.13 
 
 
595 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.28 
 
 
629 aa  63.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0301  hypothetical protein  24.04 
 
 
818 aa  63.5  0.00000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0733022  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  25.55 
 
 
629 aa  62.4  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  21.18 
 
 
611 aa  62  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.36 
 
 
630 aa  60.1  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0859  hypothetical protein  25 
 
 
889 aa  57  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0720  hypothetical protein  21.37 
 
 
351 aa  55.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  22.22 
 
 
868 aa  55.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.41 
 
 
631 aa  55.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1467  hypothetical protein  23.84 
 
 
739 aa  54.3  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  27.56 
 
 
847 aa  53.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4515  type IV secretory pathway, VirB4 component  25.43 
 
 
983 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1442  hypothetical protein  25.66 
 
 
1002 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.188514 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0931  hypothetical protein  25.19 
 
 
616 aa  51.6  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36280  lipoprotein  26.39 
 
 
973 aa  50.8  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0053  VirB4  25.39 
 
 
822 aa  50.8  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.111502  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1815  truncated type IV secretory pathway VirB4 component protein  31.31 
 
 
127 aa  50.1  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1395  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  28.79 
 
 
616 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0290868  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59940  hypothetical protein  25.43 
 
 
980 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163365  hitchhiker  0.00000000104179 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4995  hypothetical protein  25.95 
 
 
893 aa  49.7  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.124549  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  21.29 
 
 
864 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1287  Tn5252, Orf26  21.39 
 
 
776 aa  47.8  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0028  hypothetical protein  22.71 
 
 
858 aa  47.4  0.0009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0798103  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3004  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  30.66 
 
 
837 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6709  hypothetical protein  36.17 
 
 
845 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.534859  normal  0.161214 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0575  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.69 
 
 
802 aa  47  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2859  AAA ATPase  25.19 
 
 
960 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3127  hypothetical protein  28.57 
 
 
610 aa  47  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2753  hypothetical protein  23.96 
 
 
610 aa  46.6  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0435  hypothetical protein  26.9 
 
 
949 aa  46.2  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.544746  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2211  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  29.63 
 
 
618 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1626  hypothetical protein  26.9 
 
 
949 aa  46.2  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4357  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  30.82 
 
 
819 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.471619  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3115  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.16 
 
 
802 aa  45.4  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  21.59 
 
 
815 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  34.09 
 
 
827 aa  45.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1815  putative type IV secretory pathway VirB4 protein  32.65 
 
 
747 aa  45.4  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3641  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  21.1 
 
 
791 aa  45.4  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.227146 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3424  hypothetical protein  24.8 
 
 
956 aa  45.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2964  transfer complex protein  23.58 
 
 
711 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0948  hypothetical protein  23.44 
 
 
962 aa  45.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711504  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0162  hypothetical protein  27.13 
 
 
591 aa  45.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.222598  normal  0.0745617 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2394  hypothetical protein  23.44 
 
 
962 aa  45.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2186  hypothetical protein  23.44 
 
 
962 aa  45.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1398  hypothetical protein  24.8 
 
 
955 aa  44.7  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0008  ATPase  23.91 
 
 
645 aa  44.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1256  hypothetical protein  24.8 
 
 
963 aa  44.3  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2353  hypothetical protein  24.8 
 
 
963 aa  44.3  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000463521  unclonable  0.00000047318 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1164  hypothetical protein  24.8 
 
 
659 aa  43.9  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146013  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3976  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  20.91 
 
 
787 aa  43.9  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1481  conjugative transposon protein TraG  29.71 
 
 
841 aa  43.9  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.612602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8298  hypothetical protein  20.39 
 
 
575 aa  43.9  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.237745 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>