144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6709 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1481  conjugative transposon protein TraG  48.65 
 
 		 841 aa  823    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.612602 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3004  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  50.54 
 
 		 837 aa  867    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3545  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  49.39 
 
 		 811 aa  838    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0653304  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4357  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  49.34 
 
 		 819 aa  838    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.471619  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6709  hypothetical protein  100 
 
 		 845 aa  1757    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.534859  normal  0.161214 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6919  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.21 
 
 		 792 aa  236  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0371  F-pilin subunit assembly into extended F pili  28.33 
 
 		 809 aa  127  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0253  sex pilus assembly protein  26.02 
 
 		 815 aa  110  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0316  sex pilus assembly protein  26.02 
 
 		 815 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  27.07 
 
 		 874 aa  105  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1535  hypothetical protein  25.28 
 
 		 860 aa  99.8  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.324807 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  24.5 
 
 		 847 aa  93.6  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2653  hypothetical protein  25.21 
 
 		 855 aa  92.4  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.696195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0936  putative pillus assembly protein  25.39 
 
 		 690 aa  92.4  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2320  hypothetical protein  24.93 
 
 		 855 aa  90.1  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4442  Type-IV secretion system protein TraC  29.1 
 
 		 862 aa  87.8  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4438  type-IV secretion system protein TraC  29.1 
 
 		 862 aa  87.8  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.314552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  24.58 
 
 		 815 aa  87.8  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.17 
 
 		 868 aa  87.8  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4535  type-IV secretion system protein TraC  29.1 
 
 		 862 aa  87.8  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.862751 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4627  type-IV secretion system protein TraC  29.1 
 
 		 862 aa  87.8  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.997489 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4378  type-IV secretion system protein TraC  29.1 
 
 		 862 aa  87.8  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  27.06 
 
 		 827 aa  87.4  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4502  type-IV secretion system protein TraC  28.97 
 
 		 862 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.85 
 
 		 659 aa  80.9  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  23.51 
 
 		 629 aa  80.5  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6801  hypothetical protein  27.18 
 
 		 864 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0020  hypothetical protein  24.36 
 
 		 865 aa  79.3  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3777  sex pilus assembly protein  23.28 
 
 		 816 aa  79.7  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.899145  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0028  hypothetical protein  26.55 
 
 		 858 aa  79  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0798103  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4290  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  25.23 
 
 		 866 aa  77.8  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0255  Type IV secretory pathway AvhB4 protein  23.06 
 
 		 788 aa  74.7  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.849698 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.82 
 
 		 629 aa  74.7  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0495  type IV secretion system ATPase VirB4  21.24 
 
 		 800 aa  74.3  0.000000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.97813  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0029  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  23.57 
 
 		 875 aa  73.9  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3253  type IV secretory pathway VirB4 components-like  19.27 
 
 		 861 aa  72.4  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_08  conjugative transfer protein TraC  26.84 
 
 		 843 aa  72  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0518  Type IV secretory pathway VirB4 protein  21.17 
 
 		 845 aa  72.4  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832849  normal  0.194578 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0533  type IV secretion system ATPase VirB4  20.74 
 
 		 800 aa  71.6  0.00000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6206  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  23.22 
 
 		 839 aa  69.3  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.623322  normal  0.0559252 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  23.1 
 
 		 864 aa  69.7  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.62 
 
 		 631 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5086  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  21.21 
 
 		 790 aa  68.2  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0505  type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TraC  21.05 
 
 		 843 aa  68.2  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1137  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  24.45 
 
 		 816 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.15 
 
 		 595 aa  67  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.16 
 
 		 608 aa  67  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.06 
 
 		 630 aa  67.4  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0858  type IV secretion system ATPase VirB4  20.62 
 
 		 801 aa  65.9  0.000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3997  conjugal transfer ATPase TrbE  22.39 
 
 		 812 aa  63.9  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.678924 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0037  triC protein  23.58 
 
 		 915 aa  62  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a009  secretion/conjugal transfer ATPase VirB3/4  23.49 
 
 		 924 aa  62  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0677  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  22.95 
 
 		 796 aa  62  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0598  conjugal transfer ATPase TrbE  22.66 
 
 		 809 aa  60.8  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3898  conjugal transfer ATPase TrbE  22.16 
 
 		 813 aa  60.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5007  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  21.64 
 
 		 805 aa  60.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0207382  normal  0.0996879 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0153  conjugal transfer ATPase TrbE  21.26 
 
 		 872 aa  60.1  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6224  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.41 
 
 		 860 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.628877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4346  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  22.13 
 
 		 793 aa  59.3  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677673  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0506  conjugal transfer ATPase TrbE  22.55 
 
 		 812 aa  59.3  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496331  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3367  conjugal transfer ATPase TrbE  22.92 
 
 		 814 aa  59.3  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7744  conjugal transfer ATPase TrbE  21.96 
 
 		 812 aa  59.3  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.110925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1191  conjugal transfer ATPase TrbE  21.07 
 
 		 816 aa  58.5  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3544  conjugal transfer ATPase TrbE  21.07 
 
 		 816 aa  58.5  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2696  conjugal transfer ATPase TrbE  22.05 
 
 		 823 aa  57.8  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0851108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2321  conjugal transfer ATPase TrbE  21.36 
 
 		 811 aa  57  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4562  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  22.47 
 
 		 805 aa  57.4  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733697  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2948  Type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TRAC  21.87 
 
 		 841 aa  57  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3830  conjugal transfer ATPase TrbE  22.19 
 
 		 818 aa  57.4  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3538  conjugal transfer ATPase TrbE  21.82 
 
 		 813 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0252817  normal  0.696341 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3197  conjugal transfer ATPase TrbE  20.96 
 
 		 877 aa  56.6  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.468072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6405  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.01 
 
 		 819 aa  56.6  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0682909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2881  conjugal transfer ATPase TrbE  21.07 
 
 		 812 aa  56.2  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244722  normal  0.034415 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9821  type IV secretion protein AvhB4  21.68 
 
 		 819 aa  57  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3503  conjugal transfer ATPase TrbE  21.94 
 
 		 823 aa  56.2  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  21.67 
 
 		 803 aa  55.5  0.000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1481  conjugal transfer ATPase TrbE  21.83 
 
 		 836 aa  55.5  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0386388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7443  conjugal transfer ATPase TrbE  21.56 
 
 		 809 aa  55.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1395  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  20.85 
 
 		 616 aa  55.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0290868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2353  conjugal transfer ATPase TrbE  21.43 
 
 		 816 aa  55.5  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.344124 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1553  conjugal transfer ATPase TrbE  22.79 
 
 		 809 aa  55.1  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1898  conjugal transfer ATPase TrbE  22.93 
 
 		 817 aa  54.7  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0696  conjugal transfer ATPase TrbE  20.77 
 
 		 847 aa  54.7  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3001  conjugal transfer ATPase TrbE  21.89 
 
 		 812 aa  54.7  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0870  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.63 
 
 		 830 aa  54.3  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1089  type-IV secretion system protein TraC  20.07 
 
 		 866 aa  53.9  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0066  type IV secretion system protein VirB4  23.65 
 
 		 831 aa  53.1  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0274973  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1344  conjugal transfer ATPase TrbE  21.94 
 
 		 819 aa  53.5  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2007  conjugal transfer ATPase TrbE  21.51 
 
 		 816 aa  52.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581672  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  20.23 
 
 		 569 aa  53.5  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0050  conjugal transfer protein TrbE  21.4 
 
 		 845 aa  53.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0435  conjugal transfer ATPase TrbE  21.78 
 
 		 817 aa  53.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0060  type IV secretion system protein VirB4  23.65 
 
 		 831 aa  52.8  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3703  conjugal transfer ATPase TrbE  22.44 
 
 		 817 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165131  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3215  conjugal transfer ATPase TrbE  21.23 
 
 		 836 aa  52.8  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0180  cmgb3/4  25.14 
 
 		 561 aa  52.4  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0746  conjugal transfer ATPase TrbE  21.07 
 
 		 812 aa  52.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.369643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3089  conjugal transfer ATPase TrbE  21.3 
 
 		 812 aa  52.4  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1617  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system, conserved region  23.95 
 
 		 819 aa  52  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0963  conjugal transfer ATPase TrbE  22.01 
 
 		 813 aa  51.6  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>