153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_pVir0053 on replicon NC_008770
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008770  CJJ81176_pVir0053  VirB4  100 
 
 
822 aa  1667    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.111502  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4562  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  28.14 
 
 
805 aa  158  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733697  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  23.51 
 
 
803 aa  157  1e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6405  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  25.33 
 
 
819 aa  152  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0682909  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4177  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  25.96 
 
 
804 aa  150  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9821  type IV secretion protein AvhB4  28.18 
 
 
819 aa  147  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0495  type IV secretion system ATPase VirB4  25.47 
 
 
800 aa  146  2e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.97813  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0533  type IV secretion system ATPase VirB4  24.94 
 
 
800 aa  145  3e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0858  type IV secretion system ATPase VirB4  25.25 
 
 
801 aa  140  8.999999999999999e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5086  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.69 
 
 
790 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6206  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  25.55 
 
 
839 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.623322  normal  0.0559252 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0255  Type IV secretory pathway AvhB4 protein  23.88 
 
 
788 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.849698 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0180  cmgb3/4  24.49 
 
 
561 aa  129  2.0000000000000002e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0037  triC protein  23.83 
 
 
915 aa  127  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5007  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.85 
 
 
805 aa  127  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0207382  normal  0.0996879 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a009  secretion/conjugal transfer ATPase VirB3/4  24.66 
 
 
924 aa  127  9e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0677  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.58 
 
 
796 aa  126  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4376  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.03 
 
 
785 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.851787 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3523  type IV secretion system protein VirB4  24.95 
 
 
797 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0102  pilx4 protein  23.18 
 
 
876 aa  118  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.894843 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8224  type IV secretion system protein VirB4  24.42 
 
 
789 aa  117  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0171  hypothetical protein  22.55 
 
 
826 aa  115  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6159  type IV secretion system protein VirB4  24.63 
 
 
789 aa  114  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0089682  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0153  hypothetical protein  22.95 
 
 
826 aa  113  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2441  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  23.91 
 
 
815 aa  113  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06702  normal  0.584537 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0028  cmgB3/4  22.76 
 
 
922 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3976  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  22.87 
 
 
787 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2348  conjugal transfer ATPase TrbE  24.04 
 
 
810 aa  109  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3641  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  24.64 
 
 
791 aa  107  9e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.227146 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1756  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  25.26 
 
 
830 aa  106  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5816  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  20.98 
 
 
835 aa  107  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3819  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  21.18 
 
 
791 aa  105  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.321786  normal  0.020067 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4346  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  22.61 
 
 
793 aa  102  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677673  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6325  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  22.91 
 
 
829 aa  102  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1137  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  24.94 
 
 
816 aa  101  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4445  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  19.9 
 
 
803 aa  101  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.346994  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6506  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  21.16 
 
 
825 aa  100  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0163  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  25.05 
 
 
822 aa  98.6  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2655  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  24.42 
 
 
822 aa  97.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0066  type IV secretion system protein VirB4  23.46 
 
 
831 aa  96.7  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0274973  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0450  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  24.17 
 
 
823 aa  96.3  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228216  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3215  conjugal transfer ATPase TrbE  21.85 
 
 
836 aa  95.5  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4851  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.09 
 
 
826 aa  95.1  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3315  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.09 
 
 
826 aa  95.1  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5609  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  20.6 
 
 
825 aa  95.5  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.931017  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0060  type IV secretion system protein VirB4  23.26 
 
 
831 aa  93.6  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4200  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.09 
 
 
826 aa  92.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.985629 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5465  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  22.2 
 
 
850 aa  90.9  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257739  decreased coverage  0.00704778 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3854  conjugal transfer ATPase TrbE  23.37 
 
 
830 aa  89.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0508748  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1481  conjugal transfer ATPase TrbE  21.4 
 
 
836 aa  88.6  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0386388  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6504  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  23.98 
 
 
821 aa  88.2  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2271  conjugal transfer ATPase TrbE  22.27 
 
 
812 aa  88.2  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5372  conjugal transfer ATPase TrbE  21.69 
 
 
824 aa  88.2  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.259729  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0884  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  23.56 
 
 
843 aa  85.5  0.000000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3197  conjugal transfer ATPase TrbE  20.68 
 
 
877 aa  85.1  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.468072  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0153  conjugal transfer ATPase TrbE  20.54 
 
 
872 aa  84.3  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6305  Type IV secretory pathway VirB4-like protein  22.51 
 
 
818 aa  83.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5026  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  23.89 
 
 
804 aa  84  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.451352  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3001  conjugal transfer ATPase TrbE  21.81 
 
 
812 aa  82.8  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2030  conjugal transfer ATPase TrbE  22.85 
 
 
813 aa  82  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3089  conjugal transfer ATPase TrbE  21.76 
 
 
812 aa  81.6  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1617  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system, conserved region  23.14 
 
 
819 aa  81.3  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08213  conjugal transfer protein TraE  23.12 
 
 
752 aa  81.3  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1522  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  23.83 
 
 
815 aa  80.9  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1191  conjugal transfer ATPase TrbE  21.04 
 
 
816 aa  80.5  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192837  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3544  conjugal transfer ATPase TrbE  21.04 
 
 
816 aa  80.5  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0696  conjugal transfer ATPase TrbE  22.15 
 
 
847 aa  80.5  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3997  conjugal transfer ATPase TrbE  22.27 
 
 
812 aa  79.3  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.678924 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7744  conjugal transfer ATPase TrbE  19.86 
 
 
812 aa  79  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.110925 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1010  conjugal transfer ATPase TrbE  22.13 
 
 
808 aa  78.2  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.611754  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2881  conjugal transfer ATPase TrbE  20.75 
 
 
812 aa  77.4  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244722  normal  0.034415 
 
 
-
 
NC_002978  WD1173  type IV secretion system protein VirB4, putative  25.24 
 
 
788 aa  77  0.000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0108  TriC protein  21.91 
 
 
916 aa  77.4  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3538  conjugal transfer ATPase TrbE  19.7 
 
 
813 aa  77.4  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0252817  normal  0.696341 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5221  conjugal transfer ATPase TrbE  20.49 
 
 
819 aa  77.4  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3830  conjugal transfer ATPase TrbE  20.37 
 
 
818 aa  76.6  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0506  conjugal transfer ATPase TrbE  20.84 
 
 
812 aa  75.5  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496331  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7534  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  26.15 
 
 
857 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0339872  normal  0.0463504 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2321  conjugal transfer ATPase TrbE  21.17 
 
 
811 aa  75.5  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0746  conjugal transfer ATPase TrbE  21.68 
 
 
812 aa  74.7  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.369643  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0598  conjugal transfer ATPase TrbE  20.93 
 
 
809 aa  73.9  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657344  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1041  type IV secretion system protein VirB4  22.89 
 
 
791 aa  72.8  0.00000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7443  conjugal transfer ATPase TrbE  20.79 
 
 
809 aa  73.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2349  conjugal transfer ATPase TrbE  21.88 
 
 
820 aa  72.8  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0050  conjugal transfer protein TrbE  22.74 
 
 
845 aa  72  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1487  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  20.06 
 
 
915 aa  71.6  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2503  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  21.87 
 
 
814 aa  71.6  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1503  conjugal transfer ATPase TrbE  20.65 
 
 
813 aa  71.6  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373275  normal  0.784639 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2821  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  22.65 
 
 
827 aa  71.2  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.901669 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3367  conjugal transfer ATPase TrbE  19.39 
 
 
814 aa  70.5  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0839  type IV secretion system protein VirB5  22.33 
 
 
791 aa  70.1  0.0000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0234971  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1177  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  22.97 
 
 
850 aa  70.1  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7347  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  21.24 
 
 
849 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.327754 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0870  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  20.17 
 
 
830 aa  69.3  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1838  conjugal transfer ATPase TrbE  18.86 
 
 
808 aa  69.3  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4747  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  19.27 
 
 
844 aa  68.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.290977 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0164  conjugal transfer ATPase TrbE  21.71 
 
 
822 aa  68.9  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.627498  normal  0.339359 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4566  conjugal transfer protein TrbE  21.66 
 
 
817 aa  68.6  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3898  conjugal transfer ATPase TrbE  20.99 
 
 
813 aa  68.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4271  conjugal transfer protein TrbE  23.03 
 
 
852 aa  67.8  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000528773  normal  0.467859 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>