50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6224 on replicon NC_010070
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010070  Bmul_6224  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  100 
 
 		 860 aa  1779    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.628877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0371  F-pilin subunit assembly into extended F pili  27.62 
 
 		 809 aa  257  7e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0316  sex pilus assembly protein  24.29 
 
 		 815 aa  154  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  25.29 
 
 		 827 aa  154  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  26.2 
 
 		 815 aa  146  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3777  sex pilus assembly protein  23.75 
 
 		 816 aa  146  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.899145  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0028  hypothetical protein  24.29 
 
 		 858 aa  136  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0798103  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  24.73 
 
 		 864 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  26.87 
 
 		 847 aa  134  6.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0253  sex pilus assembly protein  23.58 
 
 		 815 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1089  type-IV secretion system protein TraC  23.85 
 
 		 866 aa  132  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.74 
 
 		 868 aa  129  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0936  putative pillus assembly protein  22.71 
 
 		 690 aa  127  8.000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0020  hypothetical protein  21.96 
 
 		 865 aa  112  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  25.05 
 
 		 874 aa  110  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4627  type-IV secretion system protein TraC  23.73 
 
 		 862 aa  103  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.997489 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4535  type-IV secretion system protein TraC  23.73 
 
 		 862 aa  103  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.862751 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4378  type-IV secretion system protein TraC  23.73 
 
 		 862 aa  103  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4442  Type-IV secretion system protein TraC  23.73 
 
 		 862 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4438  type-IV secretion system protein TraC  23.92 
 
 		 862 aa  103  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.314552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6801  hypothetical protein  22.68 
 
 		 864 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4502  type-IV secretion system protein TraC  23.82 
 
 		 862 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4218  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  22.1 
 
 		 894 aa  100  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.750787 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0029  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  23.75 
 
 		 875 aa  99  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_08  conjugative transfer protein TraC  24.56 
 
 		 843 aa  88.2  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4290  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  26.67 
 
 		 866 aa  82.4  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3253  type IV secretory pathway VirB4 components-like  22.52 
 
 		 861 aa  79.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3545  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.2 
 
 		 811 aa  72  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0653304  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0505  type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TraC  22.44 
 
 		 843 aa  68.9  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4357  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.75 
 
 		 819 aa  66.6  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.471619  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2320  hypothetical protein  21.78 
 
 		 855 aa  65.1  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2653  hypothetical protein  21.99 
 
 		 855 aa  64.7  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.696195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.71 
 
 		 631 aa  64.3  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_002950  PG1481  conjugative transposon protein TraG  22.22 
 
 		 841 aa  63.9  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.612602 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3004  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.24 
 
 		 837 aa  63.9  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.39 
 
 		 608 aa  64.3  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1535  hypothetical protein  23.73 
 
 		 860 aa  63.2  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.324807 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0518  Type IV secretory pathway VirB4 protein  20.78 
 
 		 845 aa  61.6  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832849  normal  0.194578 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6709  hypothetical protein  23.41 
 
 		 845 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.534859  normal  0.161214 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2392  hypothetical protein  20.88 
 
 		 924 aa  58.2  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  22.32 
 
 		 629 aa  57.4  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  21.73 
 
 		 866 aa  53.9  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.03 
 
 		 595 aa  50.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.47 
 
 		 629 aa  49.3  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5485  conjugal transfer protein TrbE  21.82 
 
 		 815 aa  48.9  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00798845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5109  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like  21.86 
 
 		 695 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2859  AAA ATPase  24.65 
 
 		 960 aa  46.6  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2349  conjugal transfer ATPase TrbE  22.05 
 
 		 820 aa  46.6  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.99 
 
 		 630 aa  44.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  21.15 
 
 		 569 aa  44.3  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>