58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2859 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4169  putative plasmid-related protein  50.71 
 
 		 954 aa  920    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1256  hypothetical protein  78.82 
 
 		 963 aa  1547    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1398  hypothetical protein  79.31 
 
 		 955 aa  1575    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2186  hypothetical protein  84.82 
 
 		 962 aa  1632    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2394  hypothetical protein  84.82 
 
 		 962 aa  1632    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0859  hypothetical protein  67.77 
 
 		 889 aa  1224    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4515  type IV secretory pathway, VirB4 component  61.87 
 
 		 983 aa  1195    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3705  hypothetical protein  52.42 
 
 		 948 aa  939    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3424  hypothetical protein  78.37 
 
 		 956 aa  1536    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0337  putative plasmid-related protein  50.87 
 
 		 952 aa  923    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.92337  normal  0.715711 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4086  putative plasmid-related protein  50.54 
 
 		 954 aa  920    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2948  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  64.16 
 
 		 913 aa  1182    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4179  hypothetical protein  78.09 
 
 		 969 aa  1521    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0837304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3330  hypothetical protein  64.38 
 
 		 913 aa  1189    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.543175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0948  hypothetical protein  84.82 
 
 		 962 aa  1639    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711504  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2859  AAA ATPase  100 
 
 		 960 aa  1967    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1164  hypothetical protein  74.02 
 
 		 659 aa  979    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146013  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36280  lipoprotein  65.91 
 
 		 973 aa  1246    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0683  hypothetical protein  82.57 
 
 		 960 aa  1603    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.439939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0435  hypothetical protein  77.25 
 
 		 949 aa  1493    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.544746  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0662  hypothetical protein  52.75 
 
 		 941 aa  941    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1626  hypothetical protein  78.72 
 
 		 949 aa  1559    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0502  hypothetical protein  80 
 
 		 978 aa  1531    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3926  hypothetical protein  44.52 
 
 		 1042 aa  855    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1442  hypothetical protein  68.03 
 
 		 1002 aa  1301    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.188514 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0648  hypothetical protein  46.59 
 
 		 908 aa  842    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.685695  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59940  hypothetical protein  61.68 
 
 		 980 aa  1186    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163365  hitchhiker  0.00000000104179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3023  hypothetical protein  64.43 
 
 		 917 aa  1200    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1184  hypothetical protein  79.31 
 
 		 955 aa  1545    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1764  hypothetical protein  51 
 
 		 938 aa  912    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2353  hypothetical protein  78.3 
 
 		 963 aa  1535    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000463521  unclonable  0.00000047318 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2755  hypothetical protein  38.42 
 
 		 964 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446038  normal  0.940253 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2392  hypothetical protein  30.53 
 
 		 924 aa  372  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1060  hypothetical protein  29.11 
 
 		 916 aa  340  9.999999999999999e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1022  hypothetical protein  29.11 
 
 		 916 aa  340  9.999999999999999e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0614  hypothetical protein  58.95 
 
 		 240 aa  300  9e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  23.83 
 
 		 874 aa  78.2  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  22.84 
 
 		 868 aa  67  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  21.86 
 
 		 815 aa  64.3  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  21.64 
 
 		 847 aa  60.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0936  putative pillus assembly protein  22.57 
 
 		 690 aa  57.4  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  21.29 
 
 		 864 aa  57  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6801  hypothetical protein  24.94 
 
 		 864 aa  55.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4627  type-IV secretion system protein TraC  24.84 
 
 		 862 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.997489 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4438  type-IV secretion system protein TraC  24.84 
 
 		 862 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.314552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4535  type-IV secretion system protein TraC  24.84 
 
 		 862 aa  53.1  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.862751 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4442  Type-IV secretion system protein TraC  24.84 
 
 		 862 aa  53.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4378  type-IV secretion system protein TraC  24.84 
 
 		 862 aa  53.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0495  type IV secretion system ATPase VirB4  25.27 
 
 		 800 aa  48.9  0.0005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.97813  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0533  type IV secretion system ATPase VirB4  25.27 
 
 		 800 aa  48.9  0.0005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  22.8 
 
 		 629 aa  48.5  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  25.27 
 
 		 803 aa  47.4  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.55 
 
 		 608 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  20.87 
 
 		 827 aa  47  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1395  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  22.47 
 
 		 616 aa  45.8  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0290868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6224  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.65 
 
 		 860 aa  46.2  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.628877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  20.51 
 
 		 630 aa  45.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  32.41 
 
 		 1980 aa  45.4  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>