60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4086 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008739  Maqu_3926  hypothetical protein  44.26 
 
 		 1042 aa  800    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3424  hypothetical protein  51.21 
 
 		 956 aa  901    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3705  hypothetical protein  64.24 
 
 		 948 aa  1217    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0337  putative plasmid-related protein  91.82 
 
 		 952 aa  1811    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.92337  normal  0.715711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0859  hypothetical protein  49.32 
 
 		 889 aa  834    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4515  type IV secretory pathway, VirB4 component  49.63 
 
 		 983 aa  871    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2948  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  53.05 
 
 		 913 aa  979    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4086  putative plasmid-related protein  100 
 
 		 954 aa  1982    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4169  putative plasmid-related protein  97.69 
 
 		 954 aa  1894    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0435  hypothetical protein  49.74 
 
 		 949 aa  916    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.544746  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2394  hypothetical protein  50.93 
 
 		 962 aa  891    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2186  hypothetical protein  51.04 
 
 		 962 aa  893    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1398  hypothetical protein  51.13 
 
 		 955 aa  936    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1256  hypothetical protein  51.89 
 
 		 963 aa  917    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0683  hypothetical protein  50.1 
 
 		 960 aa  889    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.439939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0502  hypothetical protein  50.37 
 
 		 978 aa  908    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36280  lipoprotein  49.63 
 
 		 973 aa  876    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2859  AAA ATPase  50.65 
 
 		 960 aa  913    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1442  hypothetical protein  49.31 
 
 		 1002 aa  866    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.188514 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1626  hypothetical protein  49.47 
 
 		 949 aa  920    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0662  hypothetical protein  64.54 
 
 		 941 aa  1219    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0648  hypothetical protein  43.11 
 
 		 908 aa  756    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.685695  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3023  hypothetical protein  54.4 
 
 		 917 aa  1004    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4179  hypothetical protein  50.05 
 
 		 969 aa  906    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0837304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0948  hypothetical protein  50.93 
 
 		 962 aa  894    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711504  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3330  hypothetical protein  53.16 
 
 		 913 aa  983    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.543175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1184  hypothetical protein  51.54 
 
 		 955 aa  911    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2353  hypothetical protein  51.57 
 
 		 963 aa  914    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000463521  unclonable  0.00000047318 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1764  hypothetical protein  51.32 
 
 		 938 aa  922    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59940  hypothetical protein  49.57 
 
 		 980 aa  863    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163365  hitchhiker  0.00000000104179 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2755  hypothetical protein  37.37 
 
 		 964 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446038  normal  0.940253 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1164  hypothetical protein  47.53 
 
 		 659 aa  566  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146013  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2392  hypothetical protein  28.25 
 
 		 924 aa  363  8e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1060  hypothetical protein  28.76 
 
 		 916 aa  341  5e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1022  hypothetical protein  28.76 
 
 		 916 aa  341  5e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0614  hypothetical protein  56.09 
 
 		 240 aa  266  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  24.01 
 
 		 874 aa  73.6  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  23.28 
 
 		 847 aa  70.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.76 
 
 		 868 aa  62.8  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  22.22 
 
 		 815 aa  61.6  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0936  putative pillus assembly protein  22 
 
 		 690 aa  57.4  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  22.09 
 
 		 621 aa  53.1  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0253  sex pilus assembly protein  22.79 
 
 		 815 aa  52  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2948  Type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TRAC  21.46 
 
 		 841 aa  51.6  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  22.29 
 
 		 864 aa  51.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0316  sex pilus assembly protein  21.9 
 
 		 815 aa  50.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  26.7 
 
 		 629 aa  50.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0301  hypothetical protein  20.05 
 
 		 818 aa  49.3  0.0003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0733022  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.45 
 
 		 608 aa  49.3  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.77 
 
 		 629 aa  47.8  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4442  Type-IV secretion system protein TraC  23.2 
 
 		 862 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4438  type-IV secretion system protein TraC  23.2 
 
 		 862 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.314552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4378  type-IV secretion system protein TraC  23.2 
 
 		 862 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4627  type-IV secretion system protein TraC  23.2 
 
 		 862 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.997489 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4535  type-IV secretion system protein TraC  23.2 
 
 		 862 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.862751 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.9 
 
 		 630 aa  46.6  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2653  hypothetical protein  22.64 
 
 		 855 aa  46.2  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.696195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2320  hypothetical protein  22.88 
 
 		 855 aa  45.8  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4502  type-IV secretion system protein TraC  23.61 
 
 		 862 aa  45.4  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  22.51 
 
 		 866 aa  44.7  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>