27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5109 on replicon NC_009973
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009973  Haur_5109  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like  100 
 
 		 695 aa  1384    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5240  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like  24.95 
 
 		 779 aa  84.7  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.19 
 
 		 608 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  28.47 
 
 		 629 aa  68.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.27 
 
 		 595 aa  67.4  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  28.23 
 
 		 630 aa  62.4  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  27.4 
 
 		 629 aa  61.6  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0914  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.36 
 
 		 1043 aa  60.8  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.52 
 
 		 631 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  26.47 
 
 		 866 aa  59.3  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0371  F-pilin subunit assembly into extended F pili  24.87 
 
 		 809 aa  59.3  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8298  hypothetical protein  28.21 
 
 		 575 aa  57.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1056  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.55 
 
 		 566 aa  57.4  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000236301  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6728  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.65 
 
 		 657 aa  52  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1816  truncated type IV secretory pathway VirB4 component protein  24.01 
 
 		 668 aa  51.6  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  26.29 
 
 		 569 aa  51.2  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0931  hypothetical protein  32.17 
 
 		 616 aa  50.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1815  putative type IV secretory pathway VirB4 protein  20.22 
 
 		 747 aa  50.4  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1259  protein of unknown function DUF87  25.18 
 
 		 540 aa  50.1  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  24.26 
 
 		 847 aa  49.7  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6224  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.67 
 
 		 860 aa  48.9  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.628877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3710  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  25.07 
 
 		 823 aa  46.6  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06770  hypothetical protein  25.42 
 
 		 495 aa  46.2  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0645  hypothetical protein  40.62 
 
 		 686 aa  45.8  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.549524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  26.55 
 
 		 570 aa  44.3  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00150  hypothetical protein  25.25 
 
 		 495 aa  44.3  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18940  hypothetical protein  20.96 
 
 		 908 aa  43.9  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0727779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>