47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2556 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2556  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  451  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000851913 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4477  MglA protein  44.91 
 
 
230 aa  191  9e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0711351  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4458  MglA protein  45.58 
 
 
230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3475  hypothetical protein  46.89 
 
 
225 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4322  MglA protein  45.97 
 
 
230 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2366  hypothetical protein  46.41 
 
 
223 aa  186  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4467  MglA protein  43.98 
 
 
271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.152863  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0099  MglA protein  46.67 
 
 
195 aa  169  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2940  MglA protein  45.56 
 
 
195 aa  166  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136868  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0379  mutual gliding protein A, small GTPase  47.22 
 
 
196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.844729  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0318  gliding motility protein (MglA)  44.28 
 
 
205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.667045  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1154  GTPase-like  44.33 
 
 
356 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4048  GTPase-like protein  46.11 
 
 
195 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3962  GTPase-like protein  46.11 
 
 
195 aa  161  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0107752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1214  GTPase-like protein  43.81 
 
 
352 aa  161  7e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.504628  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1284  GTPase-like protein  43.81 
 
 
355 aa  161  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4332  GTPase-like protein  44.44 
 
 
195 aa  160  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853129  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2006  gliding motility protein  43.65 
 
 
196 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0708  MglA protein  44.44 
 
 
194 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1713  MglA protein  43.65 
 
 
196 aa  159  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.369936  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3124  MglA protein  44.44 
 
 
195 aa  157  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000166676  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3758  MglA protein  44.44 
 
 
195 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.39742  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3417  MglA protein  45 
 
 
195 aa  157  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0968  MglA protein  39.9 
 
 
214 aa  156  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3633  MglA protein  43.33 
 
 
195 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3774  MglA protein  43.33 
 
 
195 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3691  MglA protein  43.33 
 
 
195 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1201  GTPase-like protein  50 
 
 
335 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595525  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1815  gliding motility protein  43.65 
 
 
196 aa  152  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6866  MglA protein  41.67 
 
 
195 aa  147  9e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.318166 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0931  hypothetical protein  42.22 
 
 
191 aa  144  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618949  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1654  gliding motility protein (MglA)  40.5 
 
 
205 aa  143  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.690375  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4339  hypothetical protein  39.44 
 
 
191 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.137501 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1356  MglA protein  40.88 
 
 
195 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.734734  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0200  hypothetical protein  39.44 
 
 
191 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.423749 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2372  gliding motility protein (MglA)  36.5 
 
 
204 aa  136  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2812  hypothetical protein  35.43 
 
 
305 aa  132  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2679  hypothetical protein  39.67 
 
 
195 aa  131  9e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000233464 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2315  hypothetical protein  33.82 
 
 
289 aa  121  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1982  GTP-binding domain-containing protein  35.08 
 
 
289 aa  121  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.079955  normal  0.121874 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1908  hypothetical protein  34.05 
 
 
281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.102679 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1930  GTP-binding domain-containing protein  31.89 
 
 
291 aa  101  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0659  GTP-binding domain-containing protein  33.15 
 
 
293 aa  91.7  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1322  GTP-binding domain protein  26.6 
 
 
270 aa  58.5  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.886624  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2067  small GTP-binding protein  27.22 
 
 
387 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.66233  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1007  hypothetical protein  27.91 
 
 
174 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  34.15 
 
 
441 aa  41.6  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>