55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0099 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0099  MglA protein  100 
 
 		 195 aa  400  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4332  GTPase-like protein  90.77 
 
 		 195 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3962  GTPase-like protein  90.26 
 
 		 195 aa  367  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0107752  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3124  MglA protein  90.77 
 
 		 195 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000166676  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3417  MglA protein  91.28 
 
 		 195 aa  369  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4048  GTPase-like protein  90.77 
 
 		 195 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2940  MglA protein  88.72 
 
 		 195 aa  366  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136868  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0379  mutual gliding protein A, small GTPase  85.13 
 
 		 196 aa  344  4e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.844729  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3758  MglA protein  83.51 
 
 		 195 aa  338  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.39742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3774  MglA protein  83.51 
 
 		 195 aa  337  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3691  MglA protein  83.51 
 
 		 195 aa  337  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3633  MglA protein  83.51 
 
 		 195 aa  337  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6866  MglA protein  80.93 
 
 		 195 aa  329  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.318166 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0708  MglA protein  74.74 
 
 		 194 aa  308  4e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1815  gliding motility protein  62.89 
 
 		 196 aa  254  5e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1713  MglA protein  63.49 
 
 		 196 aa  248  5e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.369936  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2006  gliding motility protein  63.68 
 
 		 196 aa  247  9e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0200  hypothetical protein  59.16 
 
 		 191 aa  246  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423749 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4339  hypothetical protein  58.64 
 
 		 191 aa  246  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.137501 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1214  GTPase-like protein  58.64 
 
 		 352 aa  245  3e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.504628  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1284  GTPase-like protein  58.64 
 
 		 355 aa  245  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1154  GTPase-like  58.12 
 
 		 356 aa  244  8e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1356  MglA protein  59.3 
 
 		 195 aa  242  3e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.734734  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0931  hypothetical protein  57.07 
 
 		 191 aa  239  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618949  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1201  GTPase-like protein  56.25 
 
 		 335 aa  233  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2679  hypothetical protein  56.41 
 
 		 195 aa  228  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000233464 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2372  gliding motility protein (MglA)  52.53 
 
 		 204 aa  206  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0318  gliding motility protein (MglA)  51.58 
 
 		 205 aa  201  6e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.667045  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2812  hypothetical protein  47.67 
 
 		 305 aa  193  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1654  gliding motility protein (MglA)  48.19 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.690375  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2315  hypothetical protein  44.56 
 
 		 289 aa  180  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1908  hypothetical protein  44.27 
 
 		 281 aa  177  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.102679 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1982  GTP-binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 289 aa  177  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.079955  normal  0.121874 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2556  hypothetical protein  46.67 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000851913 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4467  MglA protein  43.92 
 
 		 271 aa  160  7e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.152863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4477  MglA protein  43.55 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0711351  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4322  MglA protein  43.17 
 
 		 230 aa  158  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4458  MglA protein  43.01 
 
 		 230 aa  158  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2366  hypothetical protein  41.95 
 
 		 223 aa  156  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3475  hypothetical protein  45.56 
 
 		 225 aa  155  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0968  MglA protein  42.77 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1930  GTP-binding domain-containing protein  39.58 
 
 		 291 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0659  GTP-binding domain-containing protein  40.43 
 
 		 293 aa  141  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1322  GTP-binding domain protein  34.2 
 
 		 270 aa  112  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.886624  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1007  hypothetical protein  35.06 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0457  small GTP-binding protein  34.31 
 
 		 168 aa  53.9  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0486938 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2190  small GTP-binding protein  29.31 
 
 		 161 aa  52  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06630  put. CPS1 protein, putative  27.97 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.306978  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0379  small GTP-binding protein  26.95 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2067  small GTP-binding protein  24.31 
 
 		 387 aa  47.8  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.66233  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01126  ADP-ribosylation factor (Broad)  26.67 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.529772  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2799  small GTP-binding protein  24.85 
 
 		 176 aa  41.6  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0639382  normal  0.479363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2141  small GTP-binding protein  24.16 
 
 		 176 aa  41.6  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1323  small GTP-binding protein  25.19 
 
 		 193 aa  41.6  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.415004  normal  0.083818 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0801  GTP-binding protein LepA  33.6 
 
 		 618 aa  41.2  0.009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.799005 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>