54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1815 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1815  gliding motility protein  100 
 
 
196 aa  402  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1713  MglA protein  81.87 
 
 
196 aa  323  1e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.369936  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2006  gliding motility protein  80.73 
 
 
196 aa  316  1e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3124  MglA protein  65.08 
 
 
195 aa  257  9e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000166676  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0708  MglA protein  63.4 
 
 
194 aa  256  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6866  MglA protein  60.82 
 
 
195 aa  256  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.318166 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3417  MglA protein  65.08 
 
 
195 aa  256  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0099  MglA protein  62.89 
 
 
195 aa  254  5e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4048  GTPase-like protein  63.27 
 
 
195 aa  254  8e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3633  MglA protein  62.37 
 
 
195 aa  253  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3774  MglA protein  62.37 
 
 
195 aa  253  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3691  MglA protein  62.37 
 
 
195 aa  253  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4332  GTPase-like protein  62.24 
 
 
195 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3962  GTPase-like protein  63.27 
 
 
195 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0107752  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3758  MglA protein  61.86 
 
 
195 aa  251  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.39742  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2940  MglA protein  63.27 
 
 
195 aa  251  5.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136868  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0379  mutual gliding protein A, small GTPase  60.2 
 
 
196 aa  249  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.844729  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0200  hypothetical protein  58.85 
 
 
191 aa  236  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.423749 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4339  hypothetical protein  58.33 
 
 
191 aa  235  4e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.137501 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1356  MglA protein  56.7 
 
 
195 aa  226  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.734734  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0931  hypothetical protein  54.17 
 
 
191 aa  221  7e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618949  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2679  hypothetical protein  54.36 
 
 
195 aa  214  5.9999999999999996e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000233464 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1201  GTPase-like protein  54.31 
 
 
335 aa  214  9e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595525  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1154  GTPase-like  53.3 
 
 
356 aa  201  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1214  GTPase-like protein  52.79 
 
 
352 aa  201  8e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.504628  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1284  GTPase-like protein  52.79 
 
 
355 aa  201  8e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2372  gliding motility protein (MglA)  47.47 
 
 
204 aa  193  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0318  gliding motility protein (MglA)  47.47 
 
 
205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.667045  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2812  hypothetical protein  44.33 
 
 
305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1654  gliding motility protein (MglA)  44.44 
 
 
205 aa  177  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.690375  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2315  hypothetical protein  46.88 
 
 
289 aa  174  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1908  hypothetical protein  47.09 
 
 
281 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.102679 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1982  GTP-binding domain-containing protein  41.15 
 
 
289 aa  160  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.079955  normal  0.121874 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4467  MglA protein  42.93 
 
 
271 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.152863  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4477  MglA protein  43.3 
 
 
230 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0711351  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0659  GTP-binding domain-containing protein  40.72 
 
 
293 aa  155  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4322  MglA protein  42.93 
 
 
230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4458  MglA protein  42.78 
 
 
230 aa  154  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2556  hypothetical protein  43.65 
 
 
220 aa  152  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000851913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3475  hypothetical protein  45.3 
 
 
225 aa  152  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2366  hypothetical protein  42.31 
 
 
223 aa  149  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0968  MglA protein  41.38 
 
 
214 aa  141  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1930  GTP-binding domain-containing protein  35.42 
 
 
291 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1322  GTP-binding domain protein  33.33 
 
 
270 aa  105  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.886624  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1007  hypothetical protein  29.53 
 
 
174 aa  62.8  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1262  small GTP-binding protein  26.19 
 
 
187 aa  47  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000054589  decreased coverage  0.00000000022616 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0253  protein of unknown function, ATP binding  23.66 
 
 
182 aa  46.2  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3915  protein of unknown function, ATP binding  28.18 
 
 
177 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2067  small GTP-binding protein  27.64 
 
 
387 aa  45.4  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.66233  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0457  small GTP-binding protein  28.37 
 
 
168 aa  45.1  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0486938 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3230  small GTP-binding protein  28.81 
 
 
177 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.137976 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3637  hypothetical protein  23.19 
 
 
218 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38412  predicted protein  24.74 
 
 
184 aa  42.4  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2190  small GTP-binding protein  27.89 
 
 
161 aa  41.6  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>