46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1654 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1654  gliding motility protein (MglA)  100 
 
 
205 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.690375  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0318  gliding motility protein (MglA)  70.5 
 
 
205 aa  306  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.667045  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2372  gliding motility protein (MglA)  53.23 
 
 
204 aa  232  3e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3417  MglA protein  49.22 
 
 
195 aa  187  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0099  MglA protein  48.19 
 
 
195 aa  186  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3124  MglA protein  47.67 
 
 
195 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000166676  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0379  mutual gliding protein A, small GTPase  47.67 
 
 
196 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.844729  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4048  GTPase-like protein  45.96 
 
 
195 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3774  MglA protein  47.89 
 
 
195 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3691  MglA protein  47.89 
 
 
195 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3633  MglA protein  47.89 
 
 
195 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3962  GTPase-like protein  45.96 
 
 
195 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0107752  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2940  MglA protein  46.63 
 
 
195 aa  177  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136868  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4332  GTPase-like protein  46.11 
 
 
195 aa  177  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853129  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2679  hypothetical protein  46.19 
 
 
195 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000233464 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1815  gliding motility protein  44.44 
 
 
196 aa  177  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6866  MglA protein  46.32 
 
 
195 aa  174  6e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.318166 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3758  MglA protein  46.84 
 
 
195 aa  174  9e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.39742  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0708  MglA protein  45.08 
 
 
194 aa  173  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1713  MglA protein  43.43 
 
 
196 aa  172  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.369936  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1154  GTPase-like  44.22 
 
 
356 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1214  GTPase-like protein  43.72 
 
 
352 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.504628  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1284  GTPase-like protein  43.72 
 
 
355 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0200  hypothetical protein  44.9 
 
 
191 aa  171  7.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.423749 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4339  hypothetical protein  44.9 
 
 
191 aa  171  7.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.137501 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1201  GTPase-like protein  43.22 
 
 
335 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595525  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2006  gliding motility protein  42.86 
 
 
196 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1356  MglA protein  42.93 
 
 
195 aa  165  5e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.734734  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0931  hypothetical protein  43.88 
 
 
191 aa  165  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618949  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2366  hypothetical protein  41 
 
 
223 aa  148  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0968  MglA protein  42.33 
 
 
214 aa  145  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4477  MglA protein  38.27 
 
 
230 aa  144  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0711351  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2556  hypothetical protein  40.5 
 
 
220 aa  143  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000851913 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4458  MglA protein  38.83 
 
 
230 aa  141  8e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4322  MglA protein  38.3 
 
 
230 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1908  hypothetical protein  38.86 
 
 
281 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.102679 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2812  hypothetical protein  37.13 
 
 
305 aa  136  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3475  hypothetical protein  41.62 
 
 
225 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2315  hypothetical protein  36.95 
 
 
289 aa  135  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4467  MglA protein  37.5 
 
 
271 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.152863  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1982  GTP-binding domain-containing protein  35.15 
 
 
289 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.079955  normal  0.121874 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1930  GTP-binding domain-containing protein  31.66 
 
 
291 aa  109  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0659  GTP-binding domain-containing protein  29.65 
 
 
293 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1322  GTP-binding domain protein  26.02 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.886624  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1007  hypothetical protein  30.23 
 
 
174 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0885  GTP-binding protein LepA  26.45 
 
 
604 aa  42  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0424793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>