63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3124 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3124  MglA protein  100 
 
 
195 aa  403  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000166676  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3417  MglA protein  93.85 
 
 
195 aa  384  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4332  GTPase-like protein  91.28 
 
 
195 aa  377  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853129  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4048  GTPase-like protein  91.79 
 
 
195 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2940  MglA protein  90.26 
 
 
195 aa  370  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136868  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3962  GTPase-like protein  91.28 
 
 
195 aa  373  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0107752  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0099  MglA protein  90.77 
 
 
195 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0379  mutual gliding protein A, small GTPase  83.08 
 
 
196 aa  347  7e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.844729  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3774  MglA protein  84.02 
 
 
195 aa  344  4e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3633  MglA protein  84.02 
 
 
195 aa  344  4e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3691  MglA protein  84.02 
 
 
195 aa  344  4e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3758  MglA protein  83.51 
 
 
195 aa  343  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.39742  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6866  MglA protein  82.47 
 
 
195 aa  340  5e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.318166 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0708  MglA protein  74.74 
 
 
194 aa  305  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1815  gliding motility protein  65.08 
 
 
196 aa  257  9e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1713  MglA protein  62.96 
 
 
196 aa  247  6e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.369936  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2006  gliding motility protein  63.49 
 
 
196 aa  246  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1356  MglA protein  58.97 
 
 
195 aa  245  3e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.734734  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1284  GTPase-like protein  57.59 
 
 
355 aa  242  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1214  GTPase-like protein  57.59 
 
 
352 aa  242  3e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.504628  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1154  GTPase-like  57.59 
 
 
356 aa  241  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1201  GTPase-like protein  56.77 
 
 
335 aa  237  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595525  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0931  hypothetical protein  55.5 
 
 
191 aa  236  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618949  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0200  hypothetical protein  56.54 
 
 
191 aa  235  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.423749 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4339  hypothetical protein  56.02 
 
 
191 aa  234  6e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.137501 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2679  hypothetical protein  55.38 
 
 
195 aa  226  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000233464 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2372  gliding motility protein (MglA)  51.52 
 
 
204 aa  202  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0318  gliding motility protein (MglA)  50 
 
 
205 aa  194  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.667045  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2812  hypothetical protein  46.63 
 
 
305 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2315  hypothetical protein  46.35 
 
 
289 aa  189  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1908  hypothetical protein  45.83 
 
 
281 aa  187  9e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.102679 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1654  gliding motility protein (MglA)  47.67 
 
 
205 aa  183  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.690375  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1982  GTP-binding domain-containing protein  45.31 
 
 
289 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.079955  normal  0.121874 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4477  MglA protein  45.16 
 
 
230 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0711351  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4322  MglA protein  44.81 
 
 
230 aa  165  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4458  MglA protein  44.62 
 
 
230 aa  165  5e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4467  MglA protein  43.92 
 
 
271 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.152863  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3475  hypothetical protein  45.56 
 
 
225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2366  hypothetical protein  42.29 
 
 
223 aa  157  6e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2556  hypothetical protein  44.44 
 
 
220 aa  157  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000851913 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0968  MglA protein  42.77 
 
 
214 aa  150  8e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1930  GTP-binding domain-containing protein  40.1 
 
 
291 aa  150  8.999999999999999e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0659  GTP-binding domain-containing protein  39.89 
 
 
293 aa  142  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1322  GTP-binding domain protein  34.72 
 
 
270 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.886624  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1007  hypothetical protein  31.58 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01126  ADP-ribosylation factor (Broad)  30.83 
 
 
183 aa  50.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.529772  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1730  small GTP-binding protein  28.26 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2141  small GTP-binding protein  25.56 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0457  small GTP-binding protein  32.56 
 
 
168 aa  47.8  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0486938 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06630  put. CPS1 protein, putative  30.51 
 
 
182 aa  46.6  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.306978  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2190  small GTP-binding protein  28.74 
 
 
161 aa  47  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79956  predicted protein  29.31 
 
 
181 aa  45.8  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.803161 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62979  predicted protein  29.31 
 
 
180 aa  45.1  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233166  normal  0.128067 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43251  predicted protein  29.27 
 
 
184 aa  45.1  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8255  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2799  small GTP-binding protein  24.4 
 
 
176 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0639382  normal  0.479363 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51064  predicted protein  26.97 
 
 
181 aa  44.3  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000653634  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1262  small GTP-binding protein  26.17 
 
 
187 aa  43.5  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000054589  decreased coverage  0.00000000022616 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43732  predicted protein  34.19 
 
 
193 aa  43.5  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105149  normal  0.152758 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03220  ARF small monomeric GTPase, putative  29.06 
 
 
182 aa  42.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2067  small GTP-binding protein  26.55 
 
 
387 aa  43.1  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.66233  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0379  small GTP-binding protein  26.79 
 
 
191 aa  42.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3607  protein of unknown function ATP binding protein  28.27 
 
 
204 aa  42.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00411  Small COPII coat GTPase sar1 (EC 3.6.5.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGB9]  43.75 
 
 
189 aa  41.2  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.395555  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>