75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43251 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_43251  predicted protein  100 
 
 		 184 aa  384  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8255  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51064  predicted protein  83.52 
 
 		 181 aa  326  1.0000000000000001e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000653634  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03220  ARF small monomeric GTPase, putative  81.42 
 
 		 182 aa  313  9.999999999999999e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79956  predicted protein  82.12 
 
 		 181 aa  310  5.999999999999999e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.803161 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62979  predicted protein  82.12 
 
 		 180 aa  310  9e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233166  normal  0.128067 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01126  ADP-ribosylation factor (Broad)  80.66 
 
 		 183 aa  303  8.000000000000001e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.529772  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06630  put. CPS1 protein, putative  68.16 
 
 		 182 aa  258  4e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.306978  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05020  ADP ribosylation factor (Eurofung)  63.28 
 
 		 185 aa  238  5e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04290  small monomeric GTPase, putative  59.36 
 
 		 186 aa  228  4e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37806  predicted protein  56.61 
 
 		 211 aa  228  5e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0163906  normal  0.029284 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05912  ADP ribosylation factor A (Eurofung)  59.24 
 
 		 182 aa  225  3e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8244  predicted protein  60.23 
 
 		 175 aa  224  4e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222929  normal  0.223128 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69050  predicted protein  59.43 
 
 		 185 aa  215  2.9999999999999998e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.121793 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8659  predicted protein  59.89 
 
 		 184 aa  214  7e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56002  predicted protein  53.75 
 
 		 162 aa  183  1.0000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0254308  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03960  ADP-ribosylation factor, putative  44.38 
 
 		 182 aa  171  5.999999999999999e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710992  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51819  predicted protein  46.01 
 
 		 187 aa  152  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38412  predicted protein  46.75 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00440  ADP-ribosylation-like factor, putative  39.16 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03934  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08290)  34.73 
 
 		 179 aa  114  7.999999999999999e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13157  predicted protein  32.2 
 
 		 177 aa  111  6e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54420  predicted protein  35.26 
 
 		 192 aa  106  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0877951  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00411  Small COPII coat GTPase sar1 (EC 3.6.5.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGB9]  34.88 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.395555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56609  predicted protein  33.87 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.158476  normal  0.886863 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67516  GTP-binding protein  32.95 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03430  SAR small monomeric GTPase, putative  34.52 
 
 		 189 aa  102  5e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000269904  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43276  predicted protein  32.34 
 
 		 186 aa  99.4  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.348621 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43397  predicted protein  32.34 
 
 		 186 aa  99.4  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04210  conserved hypothetical protein  33.91 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43732  predicted protein  30.81 
 
 		 193 aa  92.4  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105149  normal  0.152758 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52766  putative ADP-ribosylation factor in the carboxypeptidase Y pathway  27.65 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167275  normal  0.735667 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00634  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G16970)  40.86 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00256949  normal  0.850865 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15349  predicted protein  28.3 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02300  arf-related protein (arp), putative  33.33 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.241389  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29284  predicted protein  26.6 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12689  predicted protein  28 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166155  normal  0.0578353 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22713  predicted protein  26.71 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517638  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  25.77 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01190  GTPase, putative  28.69 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89948  GTP-binding protein  26.03 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.0054767 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51727  predicted protein  25.17 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24119  predicted protein  28.86 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38767  predicted protein  29.35 
 
 		 205 aa  52  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0208811 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05520  ras-related protein ypt1, putative  26.03 
 
 		 205 aa  52  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04281  GTP-binding protein ypt1 (Broad)  26 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71522  GTP-binding protein of the rab family  27.4 
 
 		 208 aa  52  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30139  predicted protein  26.89 
 
 		 207 aa  51.2  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51810  predicted protein  26.67 
 
 		 213 aa  51.2  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03842  RAB GTPase Ypt5, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08040)  24.39 
 
 		 218 aa  48.1  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1262  small GTP-binding protein  26.53 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000054589  decreased coverage  0.00000000022616 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04340  Rab/GTPase, putative  25.68 
 
 		 211 aa  46.2  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260268  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51511  predicted protein  28.1 
 
 		 201 aa  45.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.471468  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63641  Rab5-like GTPase  28.1 
 
 		 215 aa  45.4  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.38675  normal  0.213062 
 
 
-
 
NC_006686  CND00140  GTPase, putative  24.26 
 
 		 233 aa  45.8  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0177882  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06974  Rab GTPase SrgA (Eurofung)  28.57 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000000778226 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1930  GTP-binding domain-containing protein  25.13 
 
 		 291 aa  45.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02560  conserved hypothetical protein  28.4 
 
 		 240 aa  45.4  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2067  small GTP-binding protein  25.51 
 
 		 387 aa  45.4  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.66233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_79030  Ras-related small GTPase, Rho type  29.45 
 
 		 186 aa  45.1  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.554484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31160  predicted protein  27.12 
 
 		 214 aa  45.1  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0379  mutual gliding protein A, small GTPase  28.46 
 
 		 196 aa  45.1  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.844729  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3124  MglA protein  29.27 
 
 		 195 aa  45.1  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000166676  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00347  Ras GTPase similar to RAB11B (Eurofung)  27.64 
 
 		 210 aa  44.7  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.521067  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04915  RAB GTPase Vps21/Ypt51, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10740)  25.71 
 
 		 258 aa  43.9  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.222182 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4332  GTPase-like protein  26.83 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853129  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00920  Rab family GTP-binding protein, putative  24.17 
 
 		 885 aa  43.9  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3417  MglA protein  27.64 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51244  GTP-binding protein of the rab/ypt family  24.24 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32150  predicted protein  26.4 
 
 		 214 aa  43.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.495831 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4048  GTPase-like protein  27.64 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2940  MglA protein  29.27 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136868  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3962  GTPase-like protein  27.64 
 
 		 195 aa  42.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0107752  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88308  predicted protein  23.16 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.359872 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41856  predicted protein  30.86 
 
 		 220 aa  42  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00446099  hitchhiker  0.00310862 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.42 
 
 		 1107 aa  41.6  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>