112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_13157 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_13157  predicted protein  100 
 
 		 177 aa  360  7.0000000000000005e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03934  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08290)  43.2 
 
 		 179 aa  157  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43276  predicted protein  40.94 
 
 		 186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.348621 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43397  predicted protein  40.94 
 
 		 186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04210  conserved hypothetical protein  40.23 
 
 		 182 aa  140  7e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8244  predicted protein  36.05 
 
 		 175 aa  127  7.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222929  normal  0.223128 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56002  predicted protein  37.04 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0254308  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05912  ADP ribosylation factor A (Eurofung)  36.99 
 
 		 182 aa  122  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05020  ADP ribosylation factor (Eurofung)  36 
 
 		 185 aa  121  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79956  predicted protein  33.71 
 
 		 181 aa  120  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.803161 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51064  predicted protein  32.57 
 
 		 181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000653634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62979  predicted protein  33.71 
 
 		 180 aa  119  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233166  normal  0.128067 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03220  ARF small monomeric GTPase, putative  33.71 
 
 		 182 aa  117  6e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06630  put. CPS1 protein, putative  33.52 
 
 		 182 aa  117  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.306978  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01126  ADP-ribosylation factor (Broad)  32.95 
 
 		 183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.529772  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43251  predicted protein  32.2 
 
 		 184 aa  111  6e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8255  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8659  predicted protein  33.71 
 
 		 184 aa  110  9e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03960  ADP-ribosylation factor, putative  35.23 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710992  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69050  predicted protein  33.9 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.121793 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37806  predicted protein  32.58 
 
 		 211 aa  105  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0163906  normal  0.029284 
 
 
-
 
NC_006686  CND04290  small monomeric GTPase, putative  31.25 
 
 		 186 aa  104  8e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54420  predicted protein  40.91 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0877951  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38412  predicted protein  27.85 
 
 		 184 aa  95.9  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43732  predicted protein  35.22 
 
 		 193 aa  95.5  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105149  normal  0.152758 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67516  GTP-binding protein  34.85 
 
 		 190 aa  89.7  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00440  ADP-ribosylation-like factor, putative  29.63 
 
 		 195 aa  84.3  8e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51819  predicted protein  27.78 
 
 		 187 aa  84.3  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00411  Small COPII coat GTPase sar1 (EC 3.6.5.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGB9]  34.35 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.395555  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03430  SAR small monomeric GTPase, putative  33.59 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000269904  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56609  predicted protein  29.76 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.158476  normal  0.886863 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52766  putative ADP-ribosylation factor in the carboxypeptidase Y pathway  27.52 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167275  normal  0.735667 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15349  predicted protein  27.1 
 
 		 174 aa  67  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00634  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G16970)  33.33 
 
 		 276 aa  61.6  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00256949  normal  0.850865 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29284  predicted protein  28.91 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  25.66 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71522  GTP-binding protein of the rab family  26.29 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24119  predicted protein  29.01 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0881  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.38 
 
 		 165 aa  52.4  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.334755  hitchhiker  0.000103971 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  30.53 
 
 		 925 aa  50.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  28.99 
 
 		 415 aa  49.7  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00347  Ras GTPase similar to RAB11B (Eurofung)  28.57 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.521067  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02300  arf-related protein (arp), putative  28.1 
 
 		 223 aa  49.3  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.241389  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51727  predicted protein  24.28 
 
 		 208 aa  49.3  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22713  predicted protein  27.87 
 
 		 203 aa  48.9  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517638  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31160  predicted protein  27.27 
 
 		 214 aa  48.9  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02560  conserved hypothetical protein  29.81 
 
 		 240 aa  48.5  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05520  ras-related protein ypt1, putative  26.04 
 
 		 205 aa  48.1  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68134  predicted protein  29.41 
 
 		 220 aa  48.1  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30139  predicted protein  25.71 
 
 		 207 aa  48.1  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0758  GTPase ObgE  30.66 
 
 		 476 aa  47.8  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.639245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  28.4 
 
 		 904 aa  47.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0231  translation initiation factor IF-2  25.88 
 
 		 883 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0340219  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  28.4 
 
 		 920 aa  47.4  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.71 
 
 		 434 aa  47  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04281  GTP-binding protein ypt1 (Broad)  26.29 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00140  GTPase, putative  31.93 
 
 		 233 aa  46.2  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0177882  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1093  translation initiation factor IF-2  27.81 
 
 		 917 aa  46.6  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5478  GTP-binding protein Obg/CgtA  25.13 
 
 		 480 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587105  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07602  hypothetical protein similar to small GTP-binding protein (Eurofung)  28 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236475  normal  0.0559081 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0600  translation initiation factor IF-2  25.88 
 
 		 886 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38767  predicted protein  24.8 
 
 		 205 aa  45.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0208811 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1587  translation initiation factor IF-2  29.76 
 
 		 1128 aa  45.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.73073  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1262  small GTP-binding protein  26.23 
 
 		 187 aa  44.7  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000054589  decreased coverage  0.00000000022616 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41856  predicted protein  23.6 
 
 		 220 aa  44.3  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00446099  hitchhiker  0.00310862 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  26.95 
 
 		 968 aa  44.7  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01820  ras-related protein ypt3 (rab), putative  29.32 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0024  translation initiation factor IF-2  25.44 
 
 		 871 aa  43.9  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0480379 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16981  translation initiation factor IF-2  29.17 
 
 		 1126 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  28.77 
 
 		 460 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1648  sulfate adenylyltransferase subunit 1  28.57 
 
 		 469 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14983  predicted protein  24.39 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227158  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  22.89 
 
 		 888 aa  43.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51810  predicted protein  25.78 
 
 		 213 aa  43.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00920  Rab family GTP-binding protein, putative  30.77 
 
 		 885 aa  42.4  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00660  RAB small monomeric GTPase, putative  25.98 
 
 		 206 aa  42.4  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  25.62 
 
 		 937 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0031  translation initiation factor IF-2  25.44 
 
 		 868 aa  42.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3991  small GTP-binding protein  30.77 
 
 		 167 aa  42.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16741  translation initiation factor IF-2  26.79 
 
 		 1161 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67584  predicted protein  24.03 
 
 		 215 aa  42.7  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16851  translation initiation factor IF-2  26.79 
 
 		 1114 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12689  predicted protein  28.69 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166155  normal  0.0578353 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16161  translation initiation factor IF-2  26.51 
 
 		 1113 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.446889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  25.62 
 
 		 937 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2190  small GTP-binding protein  27.11 
 
 		 161 aa  42.4  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03625  small GTP-binding protein  29.92 
 
 		 161 aa  42.4  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51511  predicted protein  28.1 
 
 		 201 aa  42  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.471468  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  26.22 
 
 		 294 aa  42.4  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04140  Rho small monomeric GTPase, putative  28.09 
 
 		 224 aa  41.6  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764266  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0638  translation initiation factor IF-2  23.78 
 
 		 885 aa  41.6  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268252  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0057  translation initiation factor IF-2  26.47 
 
 		 921 aa  42  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2458  GTP-binding protein Obg/CgtA  24.46 
 
 		 450 aa  41.6  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  25.61 
 
 		 896 aa  41.6  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3563  translation initiation factor IF-2  25.29 
 
 		 832 aa  41.6  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  26.82 
 
 		 450 aa  41.6  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04340  Rab/GTPase, putative  24.19 
 
 		 211 aa  41.2  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260268  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2180  GTPase ObgE  24.29 
 
 		 454 aa  41.2  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3976  translation initiation factor 2  25 
 
 		 1059 aa  41.6  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  25.29 
 
 		 437 aa  41.2  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  27.81 
 
 		 965 aa  41.2  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>