56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54420 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_54420  predicted protein  100 
 
 		 192 aa  397  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0877951  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43732  predicted protein  61.98 
 
 		 193 aa  261  4e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105149  normal  0.152758 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00411  Small COPII coat GTPase sar1 (EC 3.6.5.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGB9]  62.83 
 
 		 189 aa  253  1.0000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.395555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67516  GTP-binding protein  62.18 
 
 		 190 aa  246  1e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03430  SAR small monomeric GTPase, putative  60.73 
 
 		 189 aa  246  2e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000269904  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15349  predicted protein  41.08 
 
 		 174 aa  124  8.000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8244  predicted protein  37.06 
 
 		 175 aa  117  9e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222929  normal  0.223128 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01126  ADP-ribosylation factor (Broad)  35.63 
 
 		 183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.529772  normal  0.310407 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05912  ADP ribosylation factor A (Eurofung)  37.7 
 
 		 182 aa  114  7.999999999999999e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79956  predicted protein  35.33 
 
 		 181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.803161 
 
 
-
 
NC_006686  CND04290  small monomeric GTPase, putative  34.62 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62979  predicted protein  35.36 
 
 		 180 aa  112  3e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233166  normal  0.128067 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06630  put. CPS1 protein, putative  35.67 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.306978  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03220  ARF small monomeric GTPase, putative  40.74 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51064  predicted protein  41.54 
 
 		 181 aa  109  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000653634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69050  predicted protein  37.06 
 
 		 185 aa  107  9.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.121793 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8659  predicted protein  37.29 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43251  predicted protein  35.26 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8255  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37806  predicted protein  33.33 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0163906  normal  0.029284 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05020  ADP ribosylation factor (Eurofung)  38.93 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56002  predicted protein  42.98 
 
 		 162 aa  98.6  5e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0254308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13157  predicted protein  40.91 
 
 		 177 aa  96.7  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43397  predicted protein  33.53 
 
 		 186 aa  95.1  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43276  predicted protein  33.53 
 
 		 186 aa  95.1  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.348621 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03934  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08290)  38.1 
 
 		 179 aa  93.2  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03960  ADP-ribosylation factor, putative  29.51 
 
 		 182 aa  91.3  8e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710992  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51819  predicted protein  31.76 
 
 		 187 aa  89.4  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38412  predicted protein  28.49 
 
 		 184 aa  89  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04210  conserved hypothetical protein  31.65 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00440  ADP-ribosylation-like factor, putative  32.14 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52766  putative ADP-ribosylation factor in the carboxypeptidase Y pathway  26.98 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167275  normal  0.735667 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00634  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G16970)  34.02 
 
 		 276 aa  65.1  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00256949  normal  0.850865 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56609  predicted protein  31.25 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.158476  normal  0.886863 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29284  predicted protein  22.34 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02300  arf-related protein (arp), putative  31.06 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.241389  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1982  GTP-binding domain-containing protein  28.48 
 
 		 289 aa  50.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.079955  normal  0.121874 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1930  GTP-binding domain-containing protein  23.84 
 
 		 291 aa  48.9  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1730  small GTP-binding protein  28.57 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  30.88 
 
 		 458 aa  45.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  27.97 
 
 		 203 aa  44.7  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_006686  CND00140  GTPase, putative  26.4 
 
 		 233 aa  43.9  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0177882  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1908  hypothetical protein  26.58 
 
 		 281 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.102679 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  31.97 
 
 		 882 aa  43.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0333  translation initiation factor IF-2  28.39 
 
 		 620 aa  43.5  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.792261  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2141  small GTP-binding protein  27.89 
 
 		 176 aa  42.4  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  30.43 
 
 		 860 aa  42  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2315  hypothetical protein  25.95 
 
 		 289 aa  42  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  28.48 
 
 		 904 aa  42  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0831  translation initiation factor IF-2  25.77 
 
 		 882 aa  42  0.006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.857351  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  30.61 
 
 		 439 aa  41.6  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.33 
 
 		 437 aa  41.6  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1093  translation initiation factor IF-2  29.17 
 
 		 917 aa  41.6  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3449  GTPase ObgE  25.78 
 
 		 516 aa  41.6  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0579297  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67584  predicted protein  26.61 
 
 		 215 aa  41.6  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05520  ras-related protein ypt1, putative  25.21 
 
 		 205 aa  41.2  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2799  small GTP-binding protein  26.21 
 
 		 176 aa  41.2  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0639382  normal  0.479363 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>