48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0318 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0318  gliding motility protein (MglA)  100 
 
 
205 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.667045  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1654  gliding motility protein (MglA)  70.5 
 
 
205 aa  306  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.690375  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2372  gliding motility protein (MglA)  58.16 
 
 
204 aa  246  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4048  GTPase-like protein  53.68 
 
 
195 aa  202  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0379  mutual gliding protein A, small GTPase  52.33 
 
 
196 aa  201  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.844729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0099  MglA protein  51.58 
 
 
195 aa  201  7e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3962  GTPase-like protein  53.68 
 
 
195 aa  200  9e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0107752  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3417  MglA protein  52.63 
 
 
195 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4332  GTPase-like protein  51.05 
 
 
195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853129  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2940  MglA protein  51.05 
 
 
195 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136868  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3124  MglA protein  50 
 
 
195 aa  194  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000166676  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0708  MglA protein  49.74 
 
 
194 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1713  MglA protein  47.96 
 
 
196 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.369936  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6866  MglA protein  50.53 
 
 
195 aa  192  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.318166 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2679  hypothetical protein  52.06 
 
 
195 aa  191  6e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000233464 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1201  GTPase-like protein  48.98 
 
 
335 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595525  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1154  GTPase-like  50.51 
 
 
356 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2006  gliding motility protein  46.7 
 
 
196 aa  189  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1284  GTPase-like protein  50 
 
 
355 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1815  gliding motility protein  47.47 
 
 
196 aa  189  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1214  GTPase-like protein  50 
 
 
352 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.504628  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3774  MglA protein  49.47 
 
 
195 aa  187  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3691  MglA protein  49.47 
 
 
195 aa  187  9e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3633  MglA protein  49.47 
 
 
195 aa  187  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3758  MglA protein  48.95 
 
 
195 aa  184  7e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.39742  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0200  hypothetical protein  48.7 
 
 
191 aa  180  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.423749 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4339  hypothetical protein  47.96 
 
 
191 aa  180  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.137501 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0931  hypothetical protein  47.45 
 
 
191 aa  176  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618949  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1356  MglA protein  46.11 
 
 
195 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.734734  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2556  hypothetical protein  44.28 
 
 
220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000851913 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4477  MglA protein  41.03 
 
 
230 aa  158  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0711351  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4458  MglA protein  41.54 
 
 
230 aa  157  8e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4322  MglA protein  41.54 
 
 
230 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2366  hypothetical protein  40.8 
 
 
223 aa  155  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0968  MglA protein  42.78 
 
 
214 aa  148  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4467  MglA protein  39.3 
 
 
271 aa  147  9e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.152863  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2812  hypothetical protein  40.49 
 
 
305 aa  147  9e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3475  hypothetical protein  43.55 
 
 
225 aa  145  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1982  GTP-binding domain-containing protein  38.42 
 
 
289 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.079955  normal  0.121874 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1908  hypothetical protein  36.27 
 
 
281 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.102679 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2315  hypothetical protein  36.84 
 
 
289 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1930  GTP-binding domain-containing protein  33 
 
 
291 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0659  GTP-binding domain-containing protein  34.5 
 
 
293 aa  108  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1322  GTP-binding domain protein  35.57 
 
 
270 aa  92.4  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.886624  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1007  hypothetical protein  28.49 
 
 
174 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2576  small GTP-binding protein  23.67 
 
 
188 aa  43.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2206  small GTP-binding protein  23.67 
 
 
188 aa  43.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.32077  normal  0.0744426 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05106  secretion related GTPase SrgD (AFU_orthologue; AFUA_1G07680)  25.58 
 
 
175 aa  42.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00933055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>