More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1892 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1892  small GTP-binding protein  100 
 
 		 207 aa  426  1e-118  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3129  GTP-binding protein  73.04 
 
 		 213 aa  323  1e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144339  normal  0.904032 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1219  small GTP-binding protein  68.87 
 
 		 212 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2664  small GTP-binding protein  60.4 
 
 		 212 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000173682  normal  0.819778 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2232  GTP-binding protein, HSR1-related  60.59 
 
 		 217 aa  265  2.9999999999999995e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0751  hypothetical protein  57 
 
 		 208 aa  261  6e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.489882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1793  GTP-binding protein, HSR1-related  58.5 
 
 		 213 aa  259  2e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0804701  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0814  GTP-binding protein HSR1-related  56.81 
 
 		 213 aa  257  8e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.826996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2746  GTP-binding protein HSR1-related  54.93 
 
 		 213 aa  247  8e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3778  small GTP-binding protein  57.84 
 
 		 212 aa  246  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1615  small GTP-binding protein  54.93 
 
 		 213 aa  245  3e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1929  small GTP-binding protein  56.86 
 
 		 212 aa  244  6.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2908  small GTP-binding protein domain-containing protein  52.4 
 
 		 209 aa  238  4e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.633867 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1337  small GTP-binding protein  30.89 
 
 		 438 aa  56.6  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0503171  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  27.59 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2498  GTP-binding protein EngA  27.32 
 
 		 602 aa  55.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  26.46 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  30.43 
 
 		 456 aa  55.5  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09700  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  29.23 
 
 		 438 aa  55.1  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.253075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  27.89 
 
 		 461 aa  55.1  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2448  GTP-binding protein EngA  26.77 
 
 		 459 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14966  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  29.41 
 
 		 299 aa  54.3  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1075  small GTP-binding protein  28.27 
 
 		 438 aa  54.3  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  28.06 
 
 		 439 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2427  GTP-binding protein EngA  27 
 
 		 489 aa  54.7  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1064  GTP-binding protein Era  26.8 
 
 		 303 aa  53.9  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1186  GTP-binding protein EngA  28.71 
 
 		 461 aa  53.9  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0104  tRNA modification GTPase TrmE  27.6 
 
 		 462 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04795  GTP-binding protein EngA  26.88 
 
 		 434 aa  53.1  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  30.27 
 
 		 300 aa  53.1  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  24.75 
 
 		 440 aa  53.1  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0083  GTP-binding protein EngA  28.57 
 
 		 476 aa  52.8  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  26.56 
 
 		 302 aa  52.4  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3778  small GTP-binding protein  28.14 
 
 		 433 aa  52  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3005  GTP-binding protein EngA  25.62 
 
 		 460 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.325  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0387  GTP-binding protein EngA  26.15 
 
 		 457 aa  51.6  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2006  GTP-binding protein TypA  29.3 
 
 		 620 aa  51.6  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1122  GTP-binding protein TypA  28.93 
 
 		 633 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  29.02 
 
 		 416 aa  50.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  29.57 
 
 		 438 aa  51.2  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0991  GTP-binding protein EngA  25.37 
 
 		 492 aa  51.2  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0751  GTP-binding protein TypA  27.54 
 
 		 630 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0948  GTP-binding protein LepA  24.74 
 
 		 605 aa  51.2  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0962  GTP-binding protein TypA  27.17 
 
 		 645 aa  51.2  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0622618  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04421  GTP-binding protein EngA  26.7 
 
 		 457 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1181  GTP-binding protein LepA  24.74 
 
 		 601 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.216806 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  27.89 
 
 		 451 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  28.19 
 
 		 298 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1632  GTP-binding protein Era  26.29 
 
 		 299 aa  50.1  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04111  GTP-binding protein EngA  26.7 
 
 		 457 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3360  GTP-binding protein TypA  29.19 
 
 		 622 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.957899  hitchhiker  0.00356234 
 
 
-
 
NC_002950  PG2143  GTP-binding protein EngA  25.27 
 
 		 437 aa  49.7  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2868  GTP-binding protein TypA  29.01 
 
 		 594 aa  49.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  22.96 
 
 		 460 aa  49.3  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0987  GTP-binding protein TypA  27.65 
 
 		 645 aa  49.3  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0410239  normal  0.953039 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  28.27 
 
 		 450 aa  49.3  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  26.15 
 
 		 302 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  28.12 
 
 		 605 aa  49.3  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  27.04 
 
 		 298 aa  49.3  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  29.03 
 
 		 449 aa  49.3  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1476  GTP-binding protein Era  26.42 
 
 		 299 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf270  GTPase ObgE  28.87 
 
 		 422 aa  48.9  0.00005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.320591  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  27.18 
 
 		 294 aa  48.9  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0777  GTP-binding protein EngA  25 
 
 		 462 aa  48.9  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  28.88 
 
 		 441 aa  49.3  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1166  GTP-binding protein EngA  25.5 
 
 		 490 aa  49.3  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000230797  normal  0.345653 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1466  GTP-binding protein LepA  24.23 
 
 		 601 aa  48.9  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0811  GTP-binding proten HflX  27.57 
 
 		 509 aa  48.5  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000455725  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3132  GTP-binding protein TypA  28.57 
 
 		 641 aa  48.5  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26090  GTP-binding protein TypA/BipA  28.82 
 
 		 636 aa  48.9  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.876916 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  27.37 
 
 		 299 aa  48.5  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2766  GTP-binding protein TypA  29.01 
 
 		 617 aa  48.5  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.254596 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  27.37 
 
 		 299 aa  48.5  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  26.9 
 
 		 456 aa  48.5  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  26.7 
 
 		 455 aa  48.5  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3331  GTP-binding protein TypA  28.57 
 
 		 636 aa  48.5  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.446831  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2535  GTP-binding protein TypA  26.83 
 
 		 642 aa  48.5  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000592047 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  27.51 
 
 		 297 aa  48.5  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06890  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  27.69 
 
 		 444 aa  48.1  0.00008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.632761 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0062  GTP-binding protein EngA  25.81 
 
 		 455 aa  48.5  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  27.45 
 
 		 438 aa  48.1  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  27.45 
 
 		 438 aa  48.1  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  26.02 
 
 		 307 aa  48.5  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7137  small GTP-binding protein  31.82 
 
 		 657 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  26.67 
 
 		 299 aa  48.1  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1637  GTP-binding protein LepA  26.34 
 
 		 596 aa  48.1  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0759  GTP-binding protein TypA  28.07 
 
 		 633 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00250463  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2340  GTP-binding protein EngA  27.84 
 
 		 453 aa  48.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1851  GTP-binding protein Era  28.42 
 
 		 309 aa  47.8  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4316  GTP-binding protein TypA  28.66 
 
 		 624 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  27.42 
 
 		 301 aa  47.8  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.19 
 
 		 438 aa  48.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2279  GTP-binding protein EngA  24.14 
 
 		 460 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0830899  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15530  small GTP-binding protein domain protein  26.22 
 
 		 636 aa  47.8  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1107  GTP-binding protein TypA  29.3 
 
 		 617 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00406487  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2717  GTP-binding protein LepA  26.15 
 
 		 601 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2084  tRNA modification GTPase TrmE  29.41 
 
 		 457 aa  47.8  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.103263  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2817  GTP-binding protein TypA  26.83 
 
 		 642 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.664891  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2840  small GTP-binding protein  25.73 
 
 		 501 aa  47.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118235 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2599  tRNA modification GTPase TrmE  34.04 
 
 		 470 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.652843  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>