More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1438 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1438  small GTP-binding protein domain-containing protein  100 
 
 		 437 aa  847    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000421865  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1210  GTP-binding protein EngA  45.18 
 
 		 463 aa  334  2e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  40.41 
 
 		 438 aa  323  4e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0980  ribosome-associated GTPase EngA  43.67 
 
 		 478 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0728  small GTP-binding protein  43.48 
 
 		 441 aa  320  3e-86  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.390352 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09700  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  41.42 
 
 		 438 aa  319  6e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.253075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  39.95 
 
 		 438 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  39.95 
 
 		 438 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19830  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  43.08 
 
 		 531 aa  317  3e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2826  small GTP-binding protein  46.21 
 
 		 463 aa  317  4e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000744132  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2981  ribosome-associated GTPase EngA  44.72 
 
 		 447 aa  316  6e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1075  small GTP-binding protein  38.5 
 
 		 438 aa  316  7e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.6 
 
 		 438 aa  315  9.999999999999999e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  39.17 
 
 		 439 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1924  ribosome-associated GTPase EngA  43.24 
 
 		 515 aa  315  9.999999999999999e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00693706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2503  GTP-binding protein EngA  45.62 
 
 		 461 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.512604  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1337  small GTP-binding protein  41.27 
 
 		 438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0503171  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15170  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  41.97 
 
 		 527 aa  312  6.999999999999999e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00982196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15330  cytidylate kinase  43.37 
 
 		 755 aa  312  9e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.201651  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1616  GTP-binding protein EngA  44.65 
 
 		 471 aa  311  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207628  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  39.82 
 
 		 441 aa  311  1e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1227  GTP-binding protein EngA  40 
 
 		 436 aa  311  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.718862  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0460  GTP-binding protein EngA  40.92 
 
 		 436 aa  309  5e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14830  GTP-binding protein EngA  46.35 
 
 		 470 aa  310  5e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.778091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  42.38 
 
 		 448 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2369  ribosome-associated GTPase EngA  43.71 
 
 		 482 aa  308  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.931884  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  36.79 
 
 		 440 aa  307  3e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0799  GTP-binding protein EngA  38.43 
 
 		 436 aa  306  3e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.940642  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2159  GTP-binding protein EngA  40 
 
 		 436 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1538  GTP-binding protein EngA  41.95 
 
 		 516 aa  306  5.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0501467  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  41.88 
 
 		 444 aa  305  8.000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1538  GTP-binding protein EngA  42.21 
 
 		 516 aa  305  8.000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000734498 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1272  GTP-binding protein EngA  41.74 
 
 		 490 aa  305  9.000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1565  cytidylate kinase  43.02 
 
 		 725 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  37.59 
 
 		 440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5057  GTP-binding protein EngA  44.83 
 
 		 462 aa  305  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0472211 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0764  GTP-binding protein EngA  39.35 
 
 		 437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000517804  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3785  GTP-binding protein EngA  38.81 
 
 		 436 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0456792  normal  0.0699486 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1667  GTP-binding protein EngA  39.08 
 
 		 436 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1631  GTP-binding protein EngA  39.08 
 
 		 436 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1414  GTP-binding protein EngA  39.08 
 
 		 436 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1386  GTP-binding protein EngA  39.08 
 
 		 436 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.844345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1386  GTP-binding protein EngA  39.08 
 
 		 436 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0845142  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1598  GTP-binding protein EngA  39.08 
 
 		 436 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000589883 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1525  GTP-binding protein EngA  39.08 
 
 		 436 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  37.88 
 
 		 441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2108  GTP-binding protein EngA  40 
 
 		 443 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000750275  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2146  GTP-binding protein EngA  43.3 
 
 		 493 aa  303  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1428  GTP-binding protein EngA  38.58 
 
 		 436 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1559  GTP-binding protein EngA  39.08 
 
 		 436 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0922672  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0463  bifunctional cytidylate kinase/GTP-binding protein  42.33 
 
 		 709 aa  301  1e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.816012  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4423  small GTP-binding protein  43.67 
 
 		 465 aa  300  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  39.95 
 
 		 434 aa  301  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1497  small GTP-binding protein  40.99 
 
 		 476 aa  300  3e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.642777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  41.96 
 
 		 494 aa  300  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  40.27 
 
 		 441 aa  300  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1043  GTP-binding protein EngA  37.73 
 
 		 436 aa  298  1e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.617691  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06890  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  39.73 
 
 		 444 aa  298  1e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.632761 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3568  GTP-binding protein EngA  41.48 
 
 		 455 aa  296  3e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1458  GTP-binding protein EngA  45.03 
 
 		 487 aa  297  3e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.961762  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2148  small GTP-binding protein  45.08 
 
 		 495 aa  296  4e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  40.46 
 
 		 439 aa  296  4e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3493  GTP-binding protein EngA  42.99 
 
 		 479 aa  296  4e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.948039  normal  0.275089 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1233  small GTP-binding protein  43.38 
 
 		 458 aa  296  4e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.765411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3059  small GTP-binding protein  42.47 
 
 		 493 aa  296  5e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296218  normal  0.0592019 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  41.76 
 
 		 438 aa  296  5e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  41.98 
 
 		 449 aa  295  8e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0359  GTP-binding protein EngA  37.73 
 
 		 436 aa  295  9e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2126  GTP-binding protein EngA  40 
 
 		 449 aa  294  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.127058  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4051  small GTP-binding protein  44.04 
 
 		 483 aa  295  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0567196  normal  0.594075 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3566  ribosome-associated GTPase EngA  38.32 
 
 		 454 aa  293  3e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.173152  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3778  small GTP-binding protein  35.58 
 
 		 433 aa  293  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0577  GTP-binding protein EngA  34.42 
 
 		 435 aa  293  4e-78  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.416412  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1291  GTP-binding protein EngA  38.37 
 
 		 436 aa  293  5e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0244351  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2143  GTP-binding protein EngA  37.84 
 
 		 437 aa  292  6e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11728  GTP-binding protein EngA  44.27 
 
 		 463 aa  291  1e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000105319  normal  0.501933 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1921  GTP-binding protein EngA  43.81 
 
 		 467 aa  291  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.39722  hitchhiker  0.00139595 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0789  small GTP-binding protein  39.41 
 
 		 443 aa  291  1e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000826073  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04421  GTP-binding protein EngA  37.1 
 
 		 457 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2896  GTP-binding protein EngA  38.18 
 
 		 453 aa  291  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0739755  hitchhiker  0.000158888 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0387  GTP-binding protein EngA  37.56 
 
 		 457 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1009  GTPase  36.36 
 
 		 442 aa  291  2e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.369054  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0893  GTP-binding protein EngA  39.25 
 
 		 427 aa  291  2e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177025  hitchhiker  0.0000000000000146029 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  38.16 
 
 		 442 aa  290  3e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04111  GTP-binding protein EngA  37.33 
 
 		 457 aa  290  3e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1620  GTP-binding protein EngA  37.18 
 
 		 436 aa  290  4e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2815  ribosome-associated GTPase EngA  42.53 
 
 		 478 aa  290  4e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.560303  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1562  GTP-binding protein EngA  37.73 
 
 		 436 aa  289  6e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.496113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1532  GTP-binding protein EngA  37.73 
 
 		 436 aa  289  6e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3274  GTP-binding protein EngA  43.91 
 
 		 470 aa  288  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333638  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  37.24 
 
 		 441 aa  287  2e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04795  GTP-binding protein EngA  36.03 
 
 		 434 aa  288  2e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0121  GTP-binding protein EngA  37.99 
 
 		 452 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0118  GTP-binding protein EngA  37.99 
 
 		 452 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.132129 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1177  GTP-binding protein  37.01 
 
 		 441 aa  287  2e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0828  ribosome-associated GTPase EngA  39.77 
 
 		 734 aa  286  7e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  38.14 
 
 		 440 aa  285  8e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0885  GTP-binding protein EngA  37.56 
 
 		 452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  39.17 
 
 		 440 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  36.59 
 
 		 440 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>