More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1616 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2815  ribosome-associated GTPase EngA  72.44 
 
 		 478 aa  660    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.560303  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2369  ribosome-associated GTPase EngA  72.25 
 
 		 482 aa  662    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.931884  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1616  GTP-binding protein EngA  100 
 
 		 471 aa  930    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207628  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4051  small GTP-binding protein  72.2 
 
 		 483 aa  657    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0567196  normal  0.594075 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14830  GTP-binding protein EngA  74.26 
 
 		 470 aa  682    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.778091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11728  GTP-binding protein EngA  68.76 
 
 		 463 aa  609  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000105319  normal  0.501933 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3493  GTP-binding protein EngA  66.38 
 
 		 479 aa  609  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.948039  normal  0.275089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3274  GTP-binding protein EngA  68.01 
 
 		 470 aa  608  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2981  ribosome-associated GTPase EngA  68.86 
 
 		 447 aa  611  1e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3059  small GTP-binding protein  63.24 
 
 		 493 aa  595  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296218  normal  0.0592019 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1538  GTP-binding protein EngA  63.17 
 
 		 516 aa  597  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0501467  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1538  GTP-binding protein EngA  63.99 
 
 		 516 aa  595  1e-169  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000734498 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5057  GTP-binding protein EngA  68.04 
 
 		 462 aa  594  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0472211 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2942  GTP-binding protein EngA  66.81 
 
 		 471 aa  589  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4423  small GTP-binding protein  68.93 
 
 		 465 aa  588  1e-167  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1497  small GTP-binding protein  61.44 
 
 		 476 aa  591  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.642777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2927  GTP-binding protein EngA  66.81 
 
 		 471 aa  589  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2971  GTP-binding protein EngA  66.81 
 
 		 471 aa  589  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1210  GTP-binding protein EngA  63.74 
 
 		 463 aa  585  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1921  GTP-binding protein EngA  67.98 
 
 		 467 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.39722  hitchhiker  0.00139595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2826  small GTP-binding protein  66.82 
 
 		 463 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000744132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3000  GTP-binding protein  65.42 
 
 		 472 aa  584  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19830  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  65.19 
 
 		 531 aa  581  1.0000000000000001e-165  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1458  GTP-binding protein EngA  69.16 
 
 		 487 aa  580  1e-164  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.961762  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0980  ribosome-associated GTPase EngA  61.98 
 
 		 478 aa  580  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15170  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  65.34 
 
 		 527 aa  577  1.0000000000000001e-163  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00982196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1272  GTP-binding protein EngA  66.28 
 
 		 490 aa  578  1.0000000000000001e-163  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15330  cytidylate kinase  64.68 
 
 		 755 aa  571  1.0000000000000001e-162  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.201651  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1930  GTP-binding protein EngA  68.64 
 
 		 467 aa  571  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.322711  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1565  cytidylate kinase  63.84 
 
 		 725 aa  566  1e-160  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1924  ribosome-associated GTPase EngA  64.55 
 
 		 515 aa  567  1e-160  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00693706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2148  small GTP-binding protein  67.28 
 
 		 495 aa  560  1e-158  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2503  GTP-binding protein EngA  63.17 
 
 		 461 aa  560  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.512604  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3115  GTP-binding protein EngA  64.3 
 
 		 496 aa  556  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241248 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14040  GTP-binding protein EngA  64.38 
 
 		 512 aa  555  1e-157  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.732945  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0463  bifunctional cytidylate kinase/GTP-binding protein  55.53 
 
 		 709 aa  527  1e-148  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.816012  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0828  ribosome-associated GTPase EngA  55.68 
 
 		 734 aa  519  1e-146  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1233  small GTP-binding protein  62.16 
 
 		 458 aa  511  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.765411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  41.14 
 
 		 438 aa  365  1e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  41.14 
 
 		 438 aa  365  1e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2028  GTP-binding protein EngA  43.57 
 
 		 455 aa  363  3e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.89204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03881  GTP-binding protein EngA  42.66 
 
 		 456 aa  363  4e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0644  GTP-binding protein EngA  43.47 
 
 		 455 aa  360  3e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04431  GTP-binding protein EngA  42.34 
 
 		 456 aa  359  7e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0422674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1726  GTP-binding protein EngA  42.34 
 
 		 456 aa  358  9e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  42.57 
 
 		 441 aa  355  6.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  43.91 
 
 		 438 aa  354  2e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  40.54 
 
 		 440 aa  352  5.9999999999999994e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  42.22 
 
 		 449 aa  352  7e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0885  GTP-binding protein EngA  42.76 
 
 		 452 aa  352  8e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  41.59 
 
 		 439 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21511  GTP-binding protein EngA  42.66 
 
 		 461 aa  351  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0333  GTP-binding protein EngA  41.76 
 
 		 453 aa  350  2e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  42.47 
 
 		 438 aa  350  3e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3785  GTP-binding protein EngA  39.82 
 
 		 436 aa  349  5e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0456792  normal  0.0699486 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1428  GTP-binding protein EngA  39.59 
 
 		 436 aa  348  1e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  43.12 
 
 		 444 aa  348  2e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1227  GTP-binding protein EngA  40.27 
 
 		 436 aa  347  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.718862  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1561  GTP-binding protein EngA  42.15 
 
 		 453 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.53751  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2146  GTP-binding protein EngA  42.51 
 
 		 493 aa  346  5e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  40 
 
 		 441 aa  346  5e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1043  GTP-binding protein EngA  39.45 
 
 		 436 aa  346  6e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.617691  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1631  GTP-binding protein EngA  40.05 
 
 		 436 aa  345  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1414  GTP-binding protein EngA  40.05 
 
 		 436 aa  345  1e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1386  GTP-binding protein EngA  40.05 
 
 		 436 aa  345  1e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.844345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1386  GTP-binding protein EngA  40.05 
 
 		 436 aa  345  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0845142  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1559  GTP-binding protein EngA  40.05 
 
 		 436 aa  345  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0922672  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1525  GTP-binding protein EngA  40.05 
 
 		 436 aa  345  1e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1598  GTP-binding protein EngA  40.05 
 
 		 436 aa  345  1e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000589883 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  43.34 
 
 		 438 aa  345  1e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1667  GTP-binding protein EngA  40.05 
 
 		 436 aa  345  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2108  GTP-binding protein EngA  39.86 
 
 		 443 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000750275  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3566  ribosome-associated GTPase EngA  40.72 
 
 		 454 aa  344  2.9999999999999997e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.173152  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04531  GTP-binding protein EngA  40.63 
 
 		 458 aa  342  8e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.491515  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  39.91 
 
 		 441 aa  342  1e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  42.07 
 
 		 494 aa  340  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2159  GTP-binding protein EngA  39.18 
 
 		 436 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2896  GTP-binding protein EngA  39.82 
 
 		 453 aa  340  4e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0739755  hitchhiker  0.000158888 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1562  GTP-binding protein EngA  40.37 
 
 		 436 aa  340  4e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.496113  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2390  GTP-binding protein EngA  40.58 
 
 		 441 aa  340  4e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000149599  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1532  GTP-binding protein EngA  40.37 
 
 		 436 aa  340  4e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2340  GTP-binding protein EngA  43.69 
 
 		 453 aa  339  5.9999999999999996e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06890  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  41.59 
 
 		 444 aa  338  8e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.632761 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0799  GTP-binding protein EngA  39.68 
 
 		 436 aa  338  8e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.940642  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0387  GTP-binding protein EngA  40.36 
 
 		 457 aa  338  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0460  GTP-binding protein EngA  39.5 
 
 		 436 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0118  GTP-binding protein EngA  39.64 
 
 		 452 aa  336  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.132129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0121  GTP-binding protein EngA  39.64 
 
 		 452 aa  336  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04421  GTP-binding protein EngA  39.68 
 
 		 457 aa  335  1e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04111  GTP-binding protein EngA  39.91 
 
 		 457 aa  335  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1009  GTPase  39.95 
 
 		 442 aa  334  2e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.369054  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0728  small GTP-binding protein  41.69 
 
 		 441 aa  333  3e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.390352 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  38.46 
 
 		 440 aa  333  4e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  37.81 
 
 		 440 aa  330  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  39.36 
 
 		 442 aa  331  2e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1347  small GTP-binding protein  44.99 
 
 		 429 aa  331  2e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.308373  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  38.44 
 
 		 441 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  38.72 
 
 		 439 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  38.93 
 
 		 440 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1337  small GTP-binding protein  40.64 
 
 		 438 aa  327  2.0000000000000001e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0503171  normal  0.51028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>