More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1233 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1233  small GTP-binding protein  100 
 
 
458 aa  886    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.765411  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1924  ribosome-associated GTPase EngA  65.98 
 
 
515 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00693706  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2826  small GTP-binding protein  66.22 
 
 
463 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000744132  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1210  GTP-binding protein EngA  62.67 
 
 
463 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15330  cytidylate kinase  62.56 
 
 
755 aa  555  1e-157  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.201651  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1538  GTP-binding protein EngA  62.64 
 
 
516 aa  558  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0501467  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1565  cytidylate kinase  62.24 
 
 
725 aa  555  1e-157  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1538  GTP-binding protein EngA  62.41 
 
 
516 aa  554  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000734498 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5057  GTP-binding protein EngA  65.38 
 
 
462 aa  551  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0472211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0980  ribosome-associated GTPase EngA  59.73 
 
 
478 aa  554  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3059  small GTP-binding protein  63.82 
 
 
493 aa  553  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296218  normal  0.0592019 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19830  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  62.05 
 
 
531 aa  550  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1616  GTP-binding protein EngA  61.4 
 
 
471 aa  547  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207628  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1272  GTP-binding protein EngA  62.33 
 
 
490 aa  548  1e-154  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4423  small GTP-binding protein  61.62 
 
 
465 aa  543  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14830  GTP-binding protein EngA  65.15 
 
 
470 aa  543  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.778091  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2148  small GTP-binding protein  64.46 
 
 
495 aa  543  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1497  small GTP-binding protein  61.45 
 
 
476 aa  543  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.642777  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2981  ribosome-associated GTPase EngA  61.25 
 
 
447 aa  543  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2503  GTP-binding protein EngA  64.16 
 
 
461 aa  539  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.512604  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15170  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  61.38 
 
 
527 aa  530  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00982196  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1458  GTP-binding protein EngA  65.65 
 
 
487 aa  529  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.961762  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14040  GTP-binding protein EngA  63.49 
 
 
512 aa  525  1e-148  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.732945  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1921  GTP-binding protein EngA  65.59 
 
 
467 aa  523  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.39722  hitchhiker  0.00139595 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4051  small GTP-binding protein  61.04 
 
 
483 aa  524  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0567196  normal  0.594075 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3115  GTP-binding protein EngA  62.33 
 
 
496 aa  523  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241248 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2369  ribosome-associated GTPase EngA  59.55 
 
 
482 aa  520  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.931884  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3493  GTP-binding protein EngA  60.99 
 
 
479 aa  518  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.948039  normal  0.275089 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2815  ribosome-associated GTPase EngA  61.68 
 
 
478 aa  520  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.560303  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1930  GTP-binding protein EngA  65.81 
 
 
467 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.322711  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2971  GTP-binding protein EngA  62.56 
 
 
471 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3000  GTP-binding protein  59.68 
 
 
472 aa  512  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151151  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2942  GTP-binding protein EngA  62.56 
 
 
471 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2927  GTP-binding protein EngA  62.56 
 
 
471 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3274  GTP-binding protein EngA  61.68 
 
 
470 aa  510  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333638  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11728  GTP-binding protein EngA  60.81 
 
 
463 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000105319  normal  0.501933 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0463  bifunctional cytidylate kinase/GTP-binding protein  54.44 
 
 
709 aa  496  1e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.816012  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0828  ribosome-associated GTPase EngA  53.85 
 
 
734 aa  487  1e-136  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  47.13 
 
 
438 aa  362  9e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  42.69 
 
 
438 aa  353  4e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  43.48 
 
 
439 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  41.36 
 
 
438 aa  351  1e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  41.36 
 
 
438 aa  351  1e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  43.18 
 
 
441 aa  351  2e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  43.61 
 
 
441 aa  348  1e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0764  GTP-binding protein EngA  41.46 
 
 
437 aa  348  1e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000517804  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  41.69 
 
 
438 aa  347  3e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  43.12 
 
 
438 aa  345  7e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  39.59 
 
 
440 aa  345  8e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2108  GTP-binding protein EngA  43.96 
 
 
443 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000750275  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2028  GTP-binding protein EngA  43.27 
 
 
455 aa  343  2.9999999999999997e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.89204  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  40.14 
 
 
439 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0885  GTP-binding protein EngA  42.54 
 
 
452 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  44.52 
 
 
444 aa  343  4e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  39.59 
 
 
440 aa  343  4e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2126  GTP-binding protein EngA  42.4 
 
 
449 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.127058  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  45.15 
 
 
494 aa  340  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  43.33 
 
 
449 aa  341  2e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0799  GTP-binding protein EngA  40.09 
 
 
436 aa  340  2e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.940642  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0460  GTP-binding protein EngA  42.01 
 
 
436 aa  339  7e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2146  GTP-binding protein EngA  44.96 
 
 
493 aa  338  9e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  45.41 
 
 
448 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0644  GTP-binding protein EngA  42.99 
 
 
455 aa  338  9.999999999999999e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3785  GTP-binding protein EngA  40.37 
 
 
436 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0456792  normal  0.0699486 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0333  GTP-binding protein EngA  40.77 
 
 
453 aa  338  9.999999999999999e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03881  GTP-binding protein EngA  42.32 
 
 
456 aa  338  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2159  GTP-binding protein EngA  40.87 
 
 
436 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1291  GTP-binding protein EngA  41 
 
 
436 aa  337  1.9999999999999998e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0244351  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1428  GTP-binding protein EngA  40.14 
 
 
436 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  42.95 
 
 
434 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21511  GTP-binding protein EngA  43.5 
 
 
461 aa  337  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  42.67 
 
 
456 aa  336  5e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  40.45 
 
 
440 aa  336  5.999999999999999e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04431  GTP-binding protein EngA  42.38 
 
 
456 aa  335  7e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0422674  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2896  GTP-binding protein EngA  41.89 
 
 
453 aa  336  7e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0739755  hitchhiker  0.000158888 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  39.37 
 
 
441 aa  335  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1227  GTP-binding protein EngA  41.28 
 
 
436 aa  335  1e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.718862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1631  GTP-binding protein EngA  40.6 
 
 
436 aa  333  3e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1414  GTP-binding protein EngA  40.6 
 
 
436 aa  333  3e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1386  GTP-binding protein EngA  40.6 
 
 
436 aa  333  3e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.844345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1386  GTP-binding protein EngA  40.6 
 
 
436 aa  333  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0845142  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1559  GTP-binding protein EngA  40.6 
 
 
436 aa  333  3e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0922672  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1726  GTP-binding protein EngA  42.15 
 
 
456 aa  333  3e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1525  GTP-binding protein EngA  40.6 
 
 
436 aa  333  3e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1667  GTP-binding protein EngA  40.6 
 
 
436 aa  333  3e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1598  GTP-binding protein EngA  40.6 
 
 
436 aa  333  3e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000589883 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  40 
 
 
440 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  40.27 
 
 
441 aa  331  1e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  39.77 
 
 
440 aa  331  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0118  GTP-binding protein EngA  41.43 
 
 
452 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.132129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0121  GTP-binding protein EngA  41.43 
 
 
452 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2279  GTP-binding protein EngA  42.07 
 
 
460 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0830899  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1043  GTP-binding protein EngA  38.81 
 
 
436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.617691  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1347  small GTP-binding protein  47.67 
 
 
429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.308373  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  40.5 
 
 
442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  40.55 
 
 
441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0359  GTP-binding protein EngA  38.27 
 
 
436 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0387  GTP-binding protein EngA  39.5 
 
 
457 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1177  GTP-binding protein  39.59 
 
 
441 aa  327  3e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1561  GTP-binding protein EngA  41.65 
 
 
453 aa  326  7e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.53751  normal  0.168181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>