More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3895 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  100 
 
 		 345 aa  693    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  72.99 
 
 		 348 aa  476  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  71.88 
 
 		 352 aa  459  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  60.57 
 
 		 353 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  58.86 
 
 		 353 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  59.43 
 
 		 353 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  58.1 
 
 		 358 aa  393  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  58.45 
 
 		 356 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0233  GTPase ObgE  61.77 
 
 		 332 aa  389  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  58.67 
 
 		 349 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  63.12 
 
 		 350 aa  385  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  62.39 
 
 		 351 aa  385  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  60.3 
 
 		 358 aa  384  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  60.5 
 
 		 391 aa  375  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  62.07 
 
 		 348 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  60.5 
 
 		 342 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  57.85 
 
 		 342 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  57.27 
 
 		 344 aa  371  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2055  GTP-binding protein Obg/CgtA  56.98 
 
 		 344 aa  368  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  57.27 
 
 		 344 aa  366  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  58.14 
 
 		 343 aa  367  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  57.27 
 
 		 344 aa  366  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  59.13 
 
 		 343 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0415  GTP-binding protein Obg/CgtA  59.13 
 
 		 348 aa  358  8e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_004310  BR1845  GTPase ObgE  59.82 
 
 		 341 aa  358  9e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1778  GTPase ObgE  59.82 
 
 		 371 aa  358  9e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0317  GTPase ObgE  56.53 
 
 		 339 aa  354  1e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  57.68 
 
 		 345 aa  353  2e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  58.28 
 
 		 349 aa  353  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1054  GTPase ObgE  59.2 
 
 		 341 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87865  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3874  GTPase ObgE  59.51 
 
 		 364 aa  348  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849027 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  55.46 
 
 		 348 aa  348  8e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3280  GTP-binding protein Obg/CgtA  60.43 
 
 		 346 aa  348  8e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0275403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  56.16 
 
 		 354 aa  347  2e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3802  GTPase ObgE  56.81 
 
 		 359 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3514  GTPase ObgE  56.23 
 
 		 342 aa  346  4e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3822  GTPase ObgE  56.23 
 
 		 342 aa  346  4e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4198  GTPase ObgE  56.6 
 
 		 364 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3009  GTPase ObgE  57.45 
 
 		 336 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2283  GTPase ObgE  54.89 
 
 		 344 aa  328  7e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4282  GTPase ObgE  58.59 
 
 		 366 aa  325  9e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.358429  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  50.76 
 
 		 423 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  53.99 
 
 		 387 aa  301  7.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  52.76 
 
 		 338 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  50.92 
 
 		 338 aa  291  9e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.55 
 
 		 458 aa  291  1e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0543  GTPase ObgE  46.2 
 
 		 340 aa  290  2e-77  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  50.6 
 
 		 338 aa  287  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  47.54 
 
 		 427 aa  287  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  47.73 
 
 		 338 aa  285  7e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0956  GTPase ObgE  49.41 
 
 		 386 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  50.6 
 
 		 405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.85 
 
 		 350 aa  284  1.0000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  50 
 
 		 347 aa  282  6.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  49.7 
 
 		 392 aa  282  6.000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.15 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  47.38 
 
 		 352 aa  281  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0490  GTPase ObgE  47.08 
 
 		 340 aa  280  2e-74  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.831388  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  48.01 
 
 		 329 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  48.01 
 
 		 329 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  47.72 
 
 		 402 aa  280  3e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  49.56 
 
 		 406 aa  280  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0561  GTPase ObgE  50.87 
 
 		 390 aa  279  5e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00587502  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  50.61 
 
 		 338 aa  279  5e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.33 
 
 		 426 aa  279  6e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  49.83 
 
 		 346 aa  279  6e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3476  GTPase ObgE  49.86 
 
 		 391 aa  279  6e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000303711  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1006  GTPase ObgE  47.58 
 
 		 389 aa  278  7e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134861  decreased coverage  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  48.13 
 
 		 397 aa  278  8e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0493  GTPase ObgE  48.87 
 
 		 340 aa  278  1e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.750349  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  50 
 
 		 338 aa  278  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  49.25 
 
 		 366 aa  277  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  53.47 
 
 		 341 aa  277  2e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  48.6 
 
 		 440 aa  277  2e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0871  GTPase ObgE  48.52 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0184633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  48.72 
 
 		 406 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  53.82 
 
 		 406 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3736  GTPase ObgE  47.69 
 
 		 397 aa  276  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0046392  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4236  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.13 
 
 		 396 aa  276  5e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000643018  hitchhiker  0.00000182471 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  48.68 
 
 		 341 aa  275  7e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  48.94 
 
 		 357 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0524  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.28 
 
 		 390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000179136  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  48.18 
 
 		 370 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.16 
 
 		 434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  48.99 
 
 		 392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000171752  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3598  GTPase ObgE  49.28 
 
 		 390 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4505  GTPase ObgE  49.28 
 
 		 390 aa  273  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000250571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3493  GTPase ObgE  49.28 
 
 		 390 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3491  GTPase ObgE  49.28 
 
 		 390 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000240056  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3660  GTPase ObgE  49.28 
 
 		 390 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0449011  normal  0.0890894 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3562  GTPase ObgE  49.28 
 
 		 390 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.238363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.33 
 
 		 369 aa  273  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.97 
 
 		 417 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  49.06 
 
 		 408 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  49.06 
 
 		 408 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  48.95 
 
 		 364 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0796  GTPase ObgE  49.71 
 
 		 390 aa  273  5.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000620978  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3357  GTPase ObgE  48.98 
 
 		 392 aa  272  6e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0207536  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.49 
 
 		 425 aa  272  7e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  45.87 
 
 		 435 aa  272  7e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>