More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4712 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  100 
 
 		 354 aa  709    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_004310  BR1845  GTPase ObgE  67.84 
 
 		 341 aa  430  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1778  GTPase ObgE  67.84 
 
 		 371 aa  430  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  68.28 
 
 		 351 aa  427  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  69.72 
 
 		 348 aa  420  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1054  GTPase ObgE  70.4 
 
 		 341 aa  417  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87865  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  62.29 
 
 		 353 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  62.25 
 
 		 353 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  63.4 
 
 		 356 aa  414  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.84 
 
 		 344 aa  413  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  62.71 
 
 		 342 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  61.9 
 
 		 353 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  66.1 
 
 		 343 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  62.43 
 
 		 391 aa  408  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  67.7 
 
 		 343 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  62.15 
 
 		 349 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  67.07 
 
 		 349 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  65.75 
 
 		 344 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  65.75 
 
 		 344 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  65.22 
 
 		 358 aa  402  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  62.64 
 
 		 342 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2055  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.93 
 
 		 344 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  64.97 
 
 		 345 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  64.49 
 
 		 358 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0233  GTPase ObgE  64.05 
 
 		 332 aa  398  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3009  GTPase ObgE  67.08 
 
 		 336 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3280  GTP-binding protein Obg/CgtA  65.44 
 
 		 346 aa  388  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0275403 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3874  GTPase ObgE  66.15 
 
 		 364 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849027 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2283  GTPase ObgE  64.12 
 
 		 344 aa  388  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4198  GTPase ObgE  65.22 
 
 		 364 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  61.28 
 
 		 348 aa  390  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0317  GTPase ObgE  62.46 
 
 		 339 aa  390  1e-107  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0415  GTP-binding protein Obg/CgtA  64.91 
 
 		 348 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  60.57 
 
 		 350 aa  385  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3802  GTPase ObgE  61.3 
 
 		 359 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4282  GTPase ObgE  67.08 
 
 		 366 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.358429  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3514  GTPase ObgE  60.45 
 
 		 342 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3822  GTPase ObgE  60.45 
 
 		 342 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  57.75 
 
 		 348 aa  353  2e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  56.45 
 
 		 345 aa  348  9e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  55.21 
 
 		 352 aa  316  5e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  50.14 
 
 		 387 aa  314  9.999999999999999e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.28 
 
 		 356 aa  302  7.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  52.02 
 
 		 343 aa  298  1e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  51.38 
 
 		 338 aa  297  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  52.74 
 
 		 352 aa  297  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  51.69 
 
 		 338 aa  296  5e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  51.7 
 
 		 338 aa  294  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  49.53 
 
 		 346 aa  290  2e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.08 
 
 		 350 aa  290  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  48.6 
 
 		 356 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 402 aa  289  6e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  51.06 
 
 		 397 aa  288  7e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 338 aa  288  8e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  52.34 
 
 		 329 aa  288  9e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  52.34 
 
 		 329 aa  288  9e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  48.82 
 
 		 338 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  51.04 
 
 		 357 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  49.41 
 
 		 427 aa  285  7e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  49.24 
 
 		 326 aa  285  9e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  48.77 
 
 		 406 aa  285  9e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  48.81 
 
 		 337 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  48.6 
 
 		 379 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  48.17 
 
 		 357 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  48.48 
 
 		 395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  49.08 
 
 		 338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  48.17 
 
 		 357 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.26 
 
 		 334 aa  283  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  53.64 
 
 		 364 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  50.92 
 
 		 392 aa  282  8.000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.91 
 
 		 426 aa  281  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.03 
 
 		 371 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  50.76 
 
 		 397 aa  281  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  53.31 
 
 		 364 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.12 
 
 		 482 aa  280  2e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  49.58 
 
 		 405 aa  280  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  48.32 
 
 		 357 aa  280  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 370 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  48.48 
 
 		 370 aa  280  3e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  49.86 
 
 		 362 aa  280  3e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 365 aa  280  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.86 
 
 		 425 aa  279  5e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  47.29 
 
 		 419 aa  279  6e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0642  GTPase ObgE  46.32 
 
 		 336 aa  278  7e-74  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  50 
 
 		 365 aa  278  8e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  50.45 
 
 		 370 aa  278  8e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  46.48 
 
 		 362 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  49.39 
 
 		 347 aa  278  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  52.53 
 
 		 406 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  46.67 
 
 		 361 aa  276  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.31 
 
 		 369 aa  276  4e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  52.65 
 
 		 366 aa  276  5e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  52.17 
 
 		 354 aa  276  5e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0796  GTPase ObgE  50 
 
 		 390 aa  275  6e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000620978  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1270  GTPase ObgE  46.63 
 
 		 355 aa  276  6e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.96 
 
 		 336 aa  275  6e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  49.06 
 
 		 394 aa  275  7e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  47.71 
 
 		 337 aa  275  7e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  52.53 
 
 		 406 aa  275  7e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.55 
 
 		 417 aa  275  9e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>